胞啶3'-单磷酸 | 84-52-6

• 物质功能分类: 生物化工 - 核苷类药物 - 核苷中间体
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 中文名称: 胞啶3'-单磷酸
• 中文别名: 3-磷酸胞苷；胞苷-3-一磷酸；胞苷3'-一磷酸
• 英文名称: cytidine 3'-monophosphate
• 英文别名: 3'-CMP；cytidine 3′-monophosphate；[(2R,3S,4R,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-4-hydroxy-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] dihydrogen phosphate
• CAS: 84-52-6
• 化学式: C₉H₁₄N₃O₈P
• 分子量: 323.199
• InChiKey: UOOOPKANIPLQPU-XVFCMESISA-N

物化性质

• 熔点：
  230 °C
• 沸点：
  693.7±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  2.15±0.1 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  PBS (pH 7.2)：微溶，
• 碰撞截面：
  170.98 Ų [M+H]+ [CCS Type: DT, Method: stepped-field]

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.8
• 重原子数：
  21
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  175
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  8

安全信息

• WGK Germany：
  3
• 海关编码：
  2934999090
• 危险品运输编号：
  HAZARD

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  胞啶3'-单磷酸 在 formic acid buffer 作用下， 生成 胞苷
  参考文献：
  名称：

  Oivanen, Mikko; Loennberg, Harri, Acta Chemica Scandinavica, 1990, vol. 44, # 3, p. 239 - 242

  摘要：

  DOI：
• 作为产物：
  描述：

  胞苷-2'-磷酸 在 formic acid buffer 作用下， 生成 胞啶3'-单磷酸
  参考文献：
  名称：

  Oivanen, Mikko; Loennberg, Harri, Acta Chemica Scandinavica, 1990, vol. 44, # 3, p. 239 - 242

  摘要：

  DOI：

文献信息

• Rapid and highly base selective RNA cleavage by a dinuclear Cu(II) complex
  作者：Shanghao Liu、Andrew D. Hamilton

  DOI：10.1039/a808195f

  日期：——

  A bis-Cu(II) complex based on a covalently linked terpyridine and bipyridine ligand system is shown to rapidly cleave bis-ribonucleotides with remarkable selectivity for adenine bases.

  基于共价连接的吡啶并三吡啶和联吡啶配体系统的二铜(II)配合物，显示出对腺嘌呤基具有显著选择性的双核糖核酸快速切割能力。
• Lipid Formulated Compositions and Methods for Inhibiting Expression of Serum Amyloid A Gene
  申请人：de Fougerolles Antonin

  公开号：US20110263684A1

  公开（公告）日：2011-10-27

  The invention relates to a double-stranded ribonucleic acid (dsRNA) targeting a Serum Amyloid A (SAA) gene, and methods of using the dsRNA to inhibit expression of SAA.

  这项发明涉及一种针对血清淀粉样蛋白A（SAA）基因的双链核糖核酸（dsRNA），以及使用该dsRNA抑制SAA表达的方法。
• Studies on transfer ribonucleic acids and related compounds. XXXIV. Stepwise diester or partial triester synthesis of penta- to octanucleotides corresponding to residues 41-46, 47-54, 61-65 and 66-71 of tRNAfMet of E. coli.
  作者：EIKO OHTSUKA、TETSUO MIYAKE、EIKO NAKAGAWA、MORIO IKEHARA、ALEXANDER F. MARKHAM

  DOI：10.1248/cpb.28.2450

  日期：——

  A hexanucleotide and an octanucleotide corresponding to tRNAMetf bases 41-46 and 47-54 were synthesized by stepwise addition of mononucleotides. The octanucleotide is the largest oligoribonucleotide synthesized by this method. A pentanucleotide (bases 61-65) and a hexanucleotide (bases 66-71) were synthesized via partially triesterified intermediates. The deblocked products were purified by ion-exchange chromatography and characterized by enzymatic hydrolysis. These oligonucleotides were used as substrates in joining reactions with RNA ligase.

  通过逐步添加单核苷酸，合成了对应于tRNAMetf第41-46位和第47-54位的六核苷酸和八核苷酸。这个八核苷酸是通过这种方法合成的最大的寡核糖核酸。通过部分三酯化中间体，合成了一个五核苷酸（第61-65位）和一个六核苷酸（第66-71位）。去阻断产物通过离子交换色谱法进行纯化，并利用酶解法进行表征。这些寡核苷酸被用作RNA连接酶连接反应中的底物。
• Guanidine-Based Polymer Brushes Grafted onto Silica Nanoparticles as Efficient Artificial Phosphodiesterases
  作者：Claudia Savelli、Riccardo Salvio

  DOI：10.1002/chem.201406526

  日期：2015.4.7

  Polymer brushes grafted to the surface of silica nanoparticles were fabricated by atom‐transfer radical polymerization (ATRP) and investigated as catalysts in the cleavage of phosphodiesters. The surfaces of silica nanoparticles were functionalized with an ATRP initiator. Surface‐initiated ATRP reactions, in varying proportions, of a methacrylate moiety functionalized with a phenylguanidine moiety

  通过原子转移自由基聚合（ATRP）制备了接枝到二氧化硅纳米颗粒表面的聚合物刷，并研究了其作为磷酸二酯裂解的催化剂。二氧化硅纳米颗粒的表面用ATRP引发剂官能化。表面引发的ATRP反应以不同的比例被苯基胍部分官能化的甲基丙烯酸酯部分和惰性的亲水性甲基丙烯酸酯物质提供了杂化的纳米颗粒，并通过电位滴定，热重分析和SEM对其进行了表征。在RNA模型化合物2-羟丙基对位酯的酯交换反应中测试了杂化纳米颗粒的活性-硝基苯基磷酸酯（HPNP）和二核糖核苷单磷酸酯。较高的催化效率和显着的有效摩尔浓度，从而克服了先前在可比系统中观察到的有效摩尔浓度，表明在胍/胍单元中存在有效的协同作用，并且在纳米结构中存在高度的预组织。所研究的系统还对二核糖核苷序列CpA表现出显着和前所未有的选择性。提出的结果为制备超分子催化剂的新颖而直接的策略开辟了道路。
• Immunoaffinity purification of cyclic nucleotide phosphodiesterase from Lactuca cotyledons
  作者：Donato Chiatante、Carlotta Balconi、Russell P. Newton、Eric G. Brown

  DOI：10.1016/0031-9422(88)87014-6

  日期：1988.1

  Abstract To facilitate further study of a multifunctional phosphodiesterase, previously partially purified from Lactuca cotyledons, a new purification step has been devised. This uses an immunoaffinity column based upon polyclonal antibodies raised against the partially purified enzyme. Preparation of the immunoaffinity column, purification of the enzyme using the new protocol, and analysis of the

  摘要 为了促进对先前从莴苣子叶中部分纯化的多功能磷酸二酯酶的进一步研究，设计了一个新的纯化步骤。这使用基于针对部分纯化酶产生的多克隆抗体的免疫亲和柱。描述了免疫亲和柱的制备、酶的纯化以及纯化酶活性的分析。额外的步骤产生了具有显着更高比活性并且不含核苷酸酶和非特异性磷酸酶活性的酶制剂。观察到的酶特性证实了与哺乳动物多功能磷酸二酯酶的相似性，但重申了 Lactuca 磷酸二酯酶上存在两种类型的底物结合位点。

表征谱图