花青素CYANINE7染料,SULFO-CY7COOH | 943298-08-6

• 物质功能分类: 生物化工 - 生化试剂 - 荧光成像
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 中文名称: 花青素CYANINE7染料,SULFO-CY7COOH
• 中文别名: 二磺酸-CY7羧基；花氰染料CY7；2-[7-[1-(5-羧基戊基)-1,3-二氢-3,3-二甲基-5-磺基-2H-吲哚-2-亚基]-1,3,5-庚三烯-1-基]-1-乙基-3,3-二甲基-5-磺基-3H-吲哚鎓内盐；花氰染料cy7；磺基-CY7羧酸
• 英文名称: Cy7-COOH
• 英文别名: Cy7；(2E)-2-[(2Z,4Z,6Z)-7-[1-(5-carboxypentyl)-3,3-dimethyl-5-sulfoindol-1-ium-2-yl]hepta-2,4,6-trienylidene]-1-ethyl-3,3-dimethylindole-5-sulfonate
• CAS: 943298-08-6
• 化学式: C₃₅H₄₂N₂O₈S₂
• 分子量: 682.859
• InChiKey: CZWUESRDTYLNDE-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 溶解度：
  DMF：10 mg/ml； DMSO：10 mg/ml；乙醇：5 mg/ml； PBS（pH 7.2）：1 mg/ml

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.2
• 重原子数：
  47
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.37
• 拓扑面积：
  172
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  9

安全信息

• 安全说明：
  S24/25
• 海关编码：
  29339900

制备方法与用途

应用

磺基-CY7 羧酸在分子生物学和药理学等科研领域中有广泛的应用，但严禁用于人体。花菁染料Cy7 常被应用于生物分子标记、荧光成像及其他荧光生物分析。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  花青素CYANINE7染料,SULFO-CY7COOH 、 2-[(氯乙基)砜基]乙醇盐酸盐 在 吡啶 、 N,N'-二琥珀酰亚胺基碳酸酯 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 1.0h， 以73%的产率得到2-(7-(3,3-dimethyl-1-(6-oxo-6-((2-(vinylsulfonyl)ethyl)amino)hexyl)-5-sulfoindolin-2-ylidene)hepta-1,3,5-trien-1-yl)-1-ethyl-3,3-dimethyl-3H-indol-1-ium-5-sulfonate
  参考文献：
  名称：

  Cyanine compound for labeling biomolecule and preparation method thereof

  摘要：

  揭示了一种新型的青霉素化合物，由以下的化学式1表示，用于标记生物分子，并提供了制备该化合物的方法。其中，R1、R2、R3、R4、B、m和n如上所定义。

  公开号：

  US08729276B2
• 作为产物：
  描述：

  2,3,3-三甲基-3H-吲哚-5-磺酸钠 在 溶剂黄146 作用下， 以 环丁砜 、 乙腈 为溶剂， 反应 1.25h， 生成 花青素CYANINE7染料,SULFO-CY7COOH
  参考文献：
  名称：

  [EN] DYE COMPOSITIONS AND DYE SYNTHESES
  [FR] COMPOSITIONS DE COLORANTS ET SYNTHÈSES DE COLORANTS

  摘要：

  公开号：

  WO2012001050A9

文献信息

• DYE COMPOSITIONS AND DYE SYNTHESES
  申请人：Achanath Radha

  公开号：US20130121926A1

  公开（公告）日：2013-05-16

  The present invention relates to sulfonated optical dye compositions, especially dyes suitable for biological applications in vitro, and for in vivo imaging. Improved dye compositions and intermediates are provided, which enable the suppression of undesirable newly-identified impurities. Also provided is the use of the improved dye compositions in the preparation of conjugates with biological targeting molecules.

  本发明涉及磺化光学染料组合物，尤其是适用于体外生物应用和体内成像的染料。提供了改进的染料组合物和中间体，可以抑制不良的新鉴定出的杂质。还提供了利用改进的染料组合物制备与生物靶向分子结合物的用途。
• Photoswitching Mechanism of Cyanine Dyes
  作者：Graham T. Dempsey、Mark Bates、Walter E. Kowtoniuk、David R. Liu、Roger Y. Tsien、Xiaowei Zhuang

  DOI：10.1021/ja904588g

  日期：2009.12.30

  Cyanine dyes have been shown to undergo reversible photoswitching, where the fluorophore can be switched between a fluorescent state and a dark state upon illumination at different wavelengths. The photochemical mechanism by which switching occurs has yet to be elucidated. In this study, we have determined the mechanism of photoswitching by characterizing the kinetics of dark state formation and the spectral and structural properties of the dark state. The rate of switching to the dark state depends on the concentration of the primary thiol in the solution and the solution pH in a manner quantitatively consistent with the formation of an encounter complex between the cyanine dye and ionized thiol prior to their conjugation. Mass spectrometry suggests that the photoconversion product is a thiol-cyanine adduct in which covalent attachment of the thiol to the polymethine bridge disrupts the original conjugated pi-electron system of the dye.
• PROCEDE DE MESURE EN TEMPS REEL DE L'EPAISSEUR DE LA PAROI ET SES APPLICATIONS
  申请人：Université Paris Diderot - Paris 7

  公开号：EP3500836A1

  公开（公告）日：2019-06-26
• PROCEDE DE MESURE EN TEMPS REEL DE L'EPAISSEUR DE LA PAROI AVEC MARQUERS À LA FACE INTERNE ET EXTERNE
  申请人：Université Paris Diderot - Paris 7

  公开号：EP3500836B1

  公开（公告）日：2020-09-23
• [EN] METHOD FOR THE REAL-TIME MEASUREMENT OF A WALL THICKNESS AND USES THEREOF<br/>[FR] PROCEDE DE MESURE EN TEMPS REEL DE L'EPAISSEUR DE LA PAROI ET SES APPLICATIONS
  申请人：UNIV PARIS DIDEROT PARIS 7

  公开号：WO2018033560A1

  公开（公告）日：2018-02-22

  La présente invention se rapporte au domaine de l'industrie en biotechnologie, dont la portée d'application est aussi bien dans le secteur de la santé, de l'agro-industrie que de la recherche. La présente invention propose plus particulièrement une nouvelle méthode pour mesurer l'épaisseur de la paroi cellulaire de cellules à paroi, ainsi que sa mise en œuvre dans diverses applications.