6′-(R)-methyl-5-O-(5-amino-5,6-dideoxy-β-D-allofuranosyl)-1-N-[(S)-4-amino-2-hydroxy-butanoyl]-paromamine | 1375073-99-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 6′-(R)-methyl-5-O-(5-amino-5,6-dideoxy-β-D-allofuranosyl)-1-N-[(S)-4-amino-2-hydroxy-butanoyl]-paromamine
• 英文别名: 6'-(R)-methyl-5-O-(5-amino-5,6-dideoxy-β-D-talofuranosyl)-1-N-[(S)-4-amino-2-hydroxy-butanoyl]paromamine；(2S)-4-amino-N-[(1R,2S,3R,4R,5S)-5-amino-4-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-amino-4,5-dihydroxy-6-[(1R)-1-hydroxyethyl]oxan-2-yl]oxy-3-[(2S,3R,4S,5R)-5-[(1R)-1-aminoethyl]-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]oxy-2-hydroxycyclohexyl]-2-hydroxybutanamide
• CAS: 1375073-99-6
• 化学式: C₂₃H₄₅N₅O₁₂
• 分子量: 583.637
• InChiKey: NNXUZMHYTAUGFA-WKDOJIPSSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -6.4
• 重原子数：
  40
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.96
• 拓扑面积：
  312
• 氢给体数：
  12
• 氢受体数：
  16

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6′-(R)-methyl-5-O-(5-amino-5,6-dideoxy-β-D-allofuranosyl)-1-N-[(S)-4-amino-2-hydroxy-butanoyl]-paromamine 在 硫酸 作用下， 以 水 为溶剂， 生成 (2S)-4-amino-N-[(1R,2S,3R,4R,5S)-5-amino-4-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-amino-4,5-dihydroxy-6-[(1R)-1-hydroxyethyl]oxan-2-yl]oxy-3-[(2S,3R,4S,5R)-5-[(1R)-1-aminoethyl]-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]oxy-2-hydroxycyclohexyl]-2-hydroxybutanamide;sulfuric acid
  参考文献：
  名称：

  [EN] AMINOGLYCOSIDES AND USES THEREOF IN TREATING GENETIC DISORDERS
  [FR] AMINOGLYCOSIDES ET LEURS UTILISATIONS DANS LE TRAITEMENT DES TROUBLES GÉNÉTIQUES

  摘要：

  提供了一类新型的伪三糖氨基糖苷类化合物，其在5''位具有烷基基团，表现出高效的终止密码子突变读穿活性，低细胞毒性和高选择性作用于真核翻译系统。还提供了含有这些化合物的药物组合物，以及在治疗遗传疾病中的用途，以及制备这些氨基糖苷类化合物的方法。所披露的氨基糖苷类化合物可以用通用公式I表示：公式I或其药用可接受的盐，其中R1选自烷基、环烷基和芳基组成的群体；以及所有其他变量和特征如规范中所述。

  公开号：

  WO2012066546A1
• 作为产物：
  描述：

  p-tolyl 1-thio-β-D-ribofuranoside 在 4-二甲氨基吡啶 、 D(+)-10-樟脑磺酸 吡啶 、 六甲基磷酰三胺 、 N-溴代丁二酰亚胺(NBS) 、 sodium azide 、 乙醇 、 水 、 magnesium sulfate 、 戴斯-马丁氧化剂 、 溶剂黄146 、 甲胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 丙酮 为溶剂， 反应 24.84h， 生成 6′-(R)-methyl-5-O-(5-amino-5,6-dideoxy-β-D-allofuranosyl)-1-N-[(S)-4-amino-2-hydroxy-butanoyl]-paromamine
  参考文献：
  名称：

  [EN] AMINOGLYCOSIDES AND USES THEREOF IN TREATING GENETIC DISORDERS
  [FR] AMINOGLYCOSIDES ET LEURS UTILISATIONS DANS LE TRAITEMENT DES TROUBLES GÉNÉTIQUES

  摘要：

  提供了一类新型的伪三糖氨基糖苷类化合物，其在5''位具有烷基基团，表现出高效的终止密码子突变读穿活性，低细胞毒性和高选择性作用于真核翻译系统。还提供了含有这些化合物的药物组合物，以及在治疗遗传疾病中的用途，以及制备这些氨基糖苷类化合物的方法。所披露的氨基糖苷类化合物可以用通用公式I表示：公式I或其药用可接受的盐，其中R1选自烷基、环烷基和芳基组成的群体；以及所有其他变量和特征如规范中所述。

  公开号：

  WO2012066546A1

文献信息

• [EN] AMINOGLYCOSIDES AND USES THEREOF IN TREATING GENETIC DISORDERS<br/>[FR] AMINOGLYCOSIDES ET LEURS UTILISATIONS DANS LE TRAITEMENT DES TROUBLES GÉNÉTIQUES
  申请人：TECHNION RES & DEV FOUNDATION

  公开号：WO2012066546A1

  公开（公告）日：2012-05-24

  A new class of pseudo-trisaccharide aminoglycosides having an alkyl group at the 5'' position, exhibiting efficient stop codon mutation readthrough activity, low cytotoxicity and high selectivity towards eukaryotic translation systems are provided. Also provided are pharmaceutical compositions containing the same, and uses thereof in the treatment of genetic disorders, as well as processes of preparing these aminoglycosides. The disclosed aminoglycosides can be represented by the general formula I: formula I or a pharmaceutically acceptable salt thereof, wherein R1 is selected from the group consisting of alkyl, cycloalkyl and aryl; and all other variables and features are as described in the specification.

  提供了一类新型的伪三糖氨基糖苷类化合物，其在5''位具有烷基基团，表现出高效的终止密码子突变读穿活性，低细胞毒性和高选择性作用于真核翻译系统。还提供了含有这些化合物的药物组合物，以及在治疗遗传疾病中的用途，以及制备这些氨基糖苷类化合物的方法。所披露的氨基糖苷类化合物可以用通用公式I表示：公式I或其药用可接受的盐，其中R1选自烷基、环烷基和芳基组成的群体；以及所有其他变量和特征如规范中所述。
• Increased Selectivity toward Cytoplasmic versus Mitochondrial Ribosome Confers Improved Efficiency of Synthetic Aminoglycosides in Fixing Damaged Genes: A Strategy for Treatment of Genetic Diseases Caused by Nonsense Mutations
  作者：Jeyakumar Kandasamy、Dana Atia-Glikin、Eli Shulman、Katya Shapira、Michal Shavit、Valery Belakhov、Timor Baasov

  DOI：10.1021/jm3012992

  日期：2012.12.13

  Compelling evidence is now available that gentamicin and Geneticin (G418) can induce the mammalian ribosome to suppress disease-causing nonsense mutations and partially restore the expression of functional proteins. However, toxicity and relative lack of efficacy at subtoxic doses limit the use of gentamicin for suppression therapy. Although G418 exhibits the strongest activity, it is very cytotoxic even at low doses. We describe here the first systematic development of the novel aminoglycoside (S)-11 exhibiting similar in vitro and ex vivo activity to that of G418, while its cell toxicity is significantly lower than those of gentamicin and G418. Using a series of biochemical assays, we provide proof of principle that antibacterial activity and toxicity of aminoglycosides can be dissected from their suppression activity. The data further indicate that the increased specificity toward cytoplasmic ribosome correlates with the increased activity and that the decreased specificity toward mitochondrial ribosome confers the lowered cytotoxicity.