N-乙酰基-L-亮氨酰甘氨酰-N6-乙酰基-N-(4-甲基-2-氧代-2H-1-苯并吡喃-7-基)-L-赖氨酰胺 | 660847-06-3

• 物质功能分类: 生物化工 - 生化试剂 - 激动剂抑制剂
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 中文名称: N-乙酰基-L-亮氨酰甘氨酰-N6-乙酰基-N-(4-甲基-2-氧代-2H-1-苯并吡喃-7-基)-L-赖氨酰胺
• 中文别名: (S)-6-乙酰氨基-2-(2-((S)-2-乙酰氨基-4-甲基戊酰胺基)乙酰氨基)-N-(4-甲基-2-氧代-2H-色烯-7-基)己酰胺
• 英文名称: Ac-Leu-Gly-Lys(Ac)-AMC
• 英文别名: Ac-LGK(Ac)-AMC；Ac-Leu-Gly-Lys(Ac)-(7-amino-4-methylcoumarin)；N-Ac-Leu-Gly-(ε-N-Ac)-Lys-AMC；Ac-Leu-Gly-Lys (Ac)-AMC；Leu(Ac)-Gly-Lys(Ac)-AMC；Ac-LeuGlyLys(Ac)-AMC；(S)-6-acetamido-2-(2-((S)-2-acetamido-4-methylpentanamido)acetamido)-N-(4-methyl-2-oxo-2H-chromen-7-yl)hexanamide；(2S)-6-acetamido-2-[[2-[[(2S)-2-acetamido-4-methylpentanoyl]amino]acetyl]amino]-N-(4-methyl-2-oxochromen-7-yl)hexanamide
• CAS: 660847-06-3
• 化学式: C₂₈H₃₉N₅O₇
• 分子量: 557.647
• InChiKey: YLJRILGAXBHXDZ-GOTSBHOMSA-N

物化性质

• 沸点：
  980.1±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.219

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.2
• 重原子数：
  40
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  172
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  7

安全信息

• 危险性防范说明：
  P261,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H302,H315,H319,H335
• 储存条件：
  室温下应存放在干燥密封的容器中。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-乙酰基-L-亮氨酰甘氨酰-N6-乙酰基-N-(4-甲基-2-氧代-2H-1-苯并吡喃-7-基)-L-赖氨酰胺 以 aq. buffer 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 Ac-Leu-Gly-Lys-AMC
  参考文献：
  名称：

  锌依赖性赖氨酸脱酰基酶酶的底物分析：HDAC3表现出体外的降糖基化酶活性。

  摘要：

  系统针对一系列荧光底物的11人的锌依赖性赖氨酸脱酰的活动的筛选（参见方案）以及动力学评价揭示基板组蛋白的脱乙酰放映和HDAC10 HDAC11在合理的低的酶浓度。此外，HDAC3在复合体与核受体辅抑制子1（HDAC3-NCoR1）显示窝藏在体外decrotonylase活性。

  DOI：

  10.1002/anie.201203754
• 作为产物：
  描述：

  7-氨基-4-甲基香豆素 在 哌啶 、 吡啶 、 1-羟基苯并三唑 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N,N'-二异丙基碳二亚胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 30.01h， 生成 N-乙酰基-L-亮氨酰甘氨酰-N6-乙酰基-N-(4-甲基-2-氧代-2H-1-苯并吡喃-7-基)-L-赖氨酰胺
  参考文献：
  名称：

  使用NAD依赖的Sirtuin 5赖氨酸脱酰基酶（KDAC）酶进行高效荧光筛查的底物

  摘要：

  III类赖氨酸脱酰基酶（KDAC），也称为sirtuins，已成为治疗多种疾病的有趣药物靶标。为了更深入地了解受沉默调节蛋白影响的过程，开发单个同工酶的选择性小分子调节剂一直是一个长期的目标。然而，对于新颖的调节剂的发现，必不可少的是针对所关注目标的良好筛选方案和机理见解。因此，我们评估了七种人类瑟土因水解酶对一组荧光底物的活性。评价了常用的市售底物和设计用于解决赖氨酸翻译后修饰领域的最新发展的新型化学型。含N-琥珀酰赖氨酸的底物，可使用瑟土因5（SIRT5）进行高效且酶经济的筛选。此外，开发了用于简便动力学研究的优化方案，这对于酶动力学研究应该是有价值的。最后，将这些方案应用于苏拉明对SIRT5抑制的动力学分析，苏拉明是一种有效的瑟土因抑制剂，先前已通过X射线晶体学显示与人SIRT5 KDAC酶的底物口袋结合。

  DOI：

  10.1021/jm300526r

文献信息

• A Continuous, Fluorogenic Sirtuin 2 Deacylase Assay: Substrate Screening and Inhibitor Evaluation
  作者：Iacopo Galleano、Matthias Schiedel、Manfred Jung、Andreas S. Madsen、Christian A. Olsen

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.5b01532

  日期：2016.2.11

  synthesized fluorogenic substrates enabling enzyme-economical evaluation of SIRT2 inhibitors in a continuous assay format as well as evaluation of the properties of SIRT2 as a long chain deacylase enzyme. Novel enzymatic activities of SIRT2 were thus established in vitro, which warrant further investigation, and two known inhibitors, suramin and SirReal2, were profiled against substrates containing ε-N-acyllysine

  Sirtuins是赖氨酸酰化的重要调节剂，其与细胞代谢和转录控制有关。这使得sirtuin类酶成为开发具有药物潜力的小分子探针的有趣靶标。为了获得有关瑟土因抑制剂的详细分析和动力学见解，重要的是要获得有效的测定方法。在这项工作中，我们报告了易于合成的荧光底物，能够以连续测定形式对SIRT2抑制剂进行酶经济评价，以及对SIRT2作为长链脱酰基酶的特性进行评价。因此，在体外建立了SIRT2的新酶活性，需要进一步研究，并且针对含有ε- N的底物分析了两种已知的抑制剂，苏拉明和SirReal2。-不同长度的酰基赖氨酸修饰。
• CLASS- AND ISOFORM-SPECIFIC HDAC INHIBITORS AND USES THEREOF
  申请人：Mazitschek Ralph

  公开号：US20120208889A1

  公开（公告）日：2012-08-16

  HDAC inhibitors of the general formula (I) and (II) and pharmaceutically acceptable salts thereof, as described herein, are useful as inhibitors of histone deacetylases or other deacetylases, and thus are useful for the treatment of various diseases and disorders associated with acetylase/deacetylase activity as described herein (e.g., cancer). In certain embodiments, the compounds of the invention selectively target either a class or isoform of the HDAC family. Another aspect of the invention provides an assay for determining the inhibitory effect of a test compound on an HDAC protein comprising: incubating the HDAC protein with a substrate of general formula (IIIc) in the presence of a test compound; and determining the activity of the HDAC protein.

  本文描述的具有一般式（I）和（II）及其药学上可接受的盐的HDAC抑制剂，可用作组蛋白去乙酰化酶或其他去乙酰化酶的抑制剂，并因此可用于治疗与去乙酰化酶/乙酰化酶活性相关的各种疾病和疾病，如本文所述（例如癌症）。在某些实施例中，本发明的化合物有选择性地靶向HDAC家族的一类或同工酶。本发明的另一个方面提供了一种测定试验化合物对HDAC蛋白质抑制作用的测定方法，包括：在试验化合物的存在下，将HDAC蛋白质与一般式（IIIc）的底物孵育，并确定HDAC蛋白质的活性。
• US8513290B2
  申请人：——

  公开号：US8513290B2

  公开（公告）日：2013-08-20
• US9186402B2
  申请人：——

  公开号：US9186402B2

  公开（公告）日：2015-11-17
• Substrates for Efficient Fluorometric Screening Employing the NAD-Dependent Sirtuin 5 Lysine Deacylase (KDAC) Enzyme
  作者：Andreas S. Madsen、Christian A. Olsen

  DOI：10.1021/jm300526r

  日期：2012.6.14

  employing sirtuin 5 (SIRT5). Furthermore, optimized protocols for facile kinetic investigations were developed, which should be valuable for enzyme kinetic investigations. Finally, these protocols were applied to a kinetic analysis of the inhibition of SIRT5 by suramin, a potent sirtuin inhibitor previously shown by X-ray crystallography to bind the substrate pocket of the human SIRT5 KDAC enzyme.

  III类赖氨酸脱酰基酶（KDAC），也称为sirtuins，已成为治疗多种疾病的有趣药物靶标。为了更深入地了解受沉默调节蛋白影响的过程，开发单个同工酶的选择性小分子调节剂一直是一个长期的目标。然而，对于新颖的调节剂的发现，必不可少的是针对所关注目标的良好筛选方案和机理见解。因此，我们评估了七种人类瑟土因水解酶对一组荧光底物的活性。评价了常用的市售底物和设计用于解决赖氨酸翻译后修饰领域的最新发展的新型化学型。含N-琥珀酰赖氨酸的底物，可使用瑟土因5（SIRT5）进行高效且酶经济的筛选。此外，开发了用于简便动力学研究的优化方案，这对于酶动力学研究应该是有价值的。最后，将这些方案应用于苏拉明对SIRT5抑制的动力学分析，苏拉明是一种有效的瑟土因抑制剂，先前已通过X射线晶体学显示与人SIRT5 KDAC酶的底物口袋结合。