(S)-[5-Boc-amino-1-(4-methyl-2-oxo-2H-chromen-7-ylcarbamoyl)pentyl]carbamic acid 9H-fluoren-9-ylmethyl ester | 263368-34-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: (S)-[5-Boc-amino-1-(4-methyl-2-oxo-2H-chromen-7-ylcarbamoyl)pentyl]carbamic acid 9H-fluoren-9-ylmethyl ester
• 英文别名: Fmoc-Lys(Boc)-MCA；(9H-fluoren-9-yl)methyl-tert-butyl (6-((4-methyl-2-oxo-2H-chromen-7-yl)amino)-6-oxohexane-1,5-diyl)-(S)-dicarbamate；Fmoc-Lys(Boc)-(7-amino-4-methyl-coumarin)；Fmoc-Lys(Boc)-AMC；tert-butyl N-[(5S)-5-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-6-[(4-methyl-2-oxochromen-7-yl)amino]-6-oxohexyl]carbamate
• CAS: 263368-34-9
• 化学式: C₃₆H₃₉N₃O₇
• 分子量: 625.722
• InChiKey: JIZMARLCCADRRN-PMERELPUSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.7
• 重原子数：
  46
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  132
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (S)-[5-Boc-amino-1-(4-methyl-2-oxo-2H-chromen-7-ylcarbamoyl)pentyl]carbamic acid 9H-fluoren-9-ylmethyl ester 在 哌啶 、 1-羟基苯并三唑 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N,N'-二异丙基碳二亚胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 26.84h， 生成 N-乙酰基-L-亮氨酰甘氨酰-N6-乙酰基-N-(4-甲基-2-氧代-2H-1-苯并吡喃-7-基)-L-赖氨酰胺
  参考文献：
  名称：

  使用NAD依赖的Sirtuin 5赖氨酸脱酰基酶（KDAC）酶进行高效荧光筛查的底物

  摘要：

  III类赖氨酸脱酰基酶（KDAC），也称为sirtuins，已成为治疗多种疾病的有趣药物靶标。为了更深入地了解受沉默调节蛋白影响的过程，开发单个同工酶的选择性小分子调节剂一直是一个长期的目标。然而，对于新颖的调节剂的发现，必不可少的是针对所关注目标的良好筛选方案和机理见解。因此，我们评估了七种人类瑟土因水解酶对一组荧光底物的活性。评价了常用的市售底物和设计用于解决赖氨酸翻译后修饰领域的最新发展的新型化学型。含N-琥珀酰赖氨酸的底物，可使用瑟土因5（SIRT5）进行高效且酶经济的筛选。此外，开发了用于简便动力学研究的优化方案，这对于酶动力学研究应该是有价值的。最后，将这些方案应用于苏拉明对SIRT5抑制的动力学分析，苏拉明是一种有效的瑟土因抑制剂，先前已通过X射线晶体学显示与人SIRT5 KDAC酶的底物口袋结合。

  DOI：

  10.1021/jm300526r
• 作为产物：
  描述：

  7-氨基-4-甲基香豆素 、 N-alpha-芴甲氧羰基-N-epsilon-叔丁氧羰基-L-赖氨酸 在 吡啶 、 三氯氧磷 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.17h， 以100%的产率得到(S)-[5-Boc-amino-1-(4-methyl-2-oxo-2H-chromen-7-ylcarbamoyl)pentyl]carbamic acid 9H-fluoren-9-ylmethyl ester
  参考文献：
  名称：

  使用NAD依赖的Sirtuin 5赖氨酸脱酰基酶（KDAC）酶进行高效荧光筛查的底物

  摘要：

  III类赖氨酸脱酰基酶（KDAC），也称为sirtuins，已成为治疗多种疾病的有趣药物靶标。为了更深入地了解受沉默调节蛋白影响的过程，开发单个同工酶的选择性小分子调节剂一直是一个长期的目标。然而，对于新颖的调节剂的发现，必不可少的是针对所关注目标的良好筛选方案和机理见解。因此，我们评估了七种人类瑟土因水解酶对一组荧光底物的活性。评价了常用的市售底物和设计用于解决赖氨酸翻译后修饰领域的最新发展的新型化学型。含N-琥珀酰赖氨酸的底物，可使用瑟土因5（SIRT5）进行高效且酶经济的筛选。此外，开发了用于简便动力学研究的优化方案，这对于酶动力学研究应该是有价值的。最后，将这些方案应用于苏拉明对SIRT5抑制的动力学分析，苏拉明是一种有效的瑟土因抑制剂，先前已通过X射线晶体学显示与人SIRT5 KDAC酶的底物口袋结合。

  DOI：

  10.1021/jm300526r

文献信息

• A Molecular Probe with Both Chromogenic and Fluorescent Units for Detecting Serine Proteases
  作者：Kirara Ishida、Yushi Nakamura、Tetsuo Ohta、Yohei Oe

  DOI：10.3390/molecules26020482

  日期：——

  A molecular probe with l-phenylalanine p-nitroanilide and l-lysin 4-methylcoumaryl-7-amide, in which these amino acid derivatives are connected through a succinic-acid spacer, was prepared. Trypsin and papain were detected by blue-fluorescence emission of generated 7-amino-4-methylcoumarin (AMC). α-Chymotrypsin and nattokinase were detected from both the blue-fluorescence emission of AMC and the UV absorbance of p-nitroaniline. In addition, different time courses of p-nitroaniline and AMC were observed between the reaction of P1 with α-chymotrypsin and that with nattokinase. In the case of nattokinase, both the fluorescence emission and UV absorbance slowly increased. In contrast, the increasing UV absorbance was saturated at the early stage of the reaction of the present probe with chymotrypsin, whereas the fluorescence emission continuously increased in the following stages.

  一种含有l-苯丙氨酸对硝基苯胺和l-赖氨酸4-甲基香豆素-7-酰胺的分子探针被制备出来，其中这些氨基酸衍生物通过琥珀酸间隔连接。胰蛋白酶和木瓜蛋白酶通过生成的7-氨基-4-甲基香豆素（AMC）的蓝色荧光发射被检测到。α-胰蛋白酶和纳豆激酶通过AMC的蓝色荧光发射和对对硝基苯胺的紫外吸收被检测到。此外，在P1与α-胰蛋白酶和纳豆激酶反应之间观察到对硝基苯胺和AMC的不同时间进程。在纳豆激酶的情况下，荧光发射和紫外吸收都缓慢增加。相比之下，与α-胰蛋白酶反应的反应物与该探针的反应在早期阶段紫外吸收增加饱和，而随后阶段荧光发射持续增加。
• A Judgment on Postmortem Aging in<i>Longissimus Dorsi</i>Based on a Peptide Substrate Library
  作者：Eiichiro ONITSUKA、Tomoyuki OKUMURA、Hiroshi MURAKAMI、Norikazu NISHINO、Fumiki MORIMATSU

  DOI：10.1271/bbb.60208

  日期：2006.12.23

  We attempted to develop a method to determine easily and effectively the degree of postmortem aging of pork longissimus dorsi (LD) by measuring the activity of proteases in the LD using fluorogenic peptide substrates. LD was used to measure the change with time in the protease activity detected with these substrates. Determining the variations within the LD muscles, strong positive correlations were found between changes in hardness and fluorescence intensities against Ac-Ala-MCA, Ac-Met-MCA, Ac-Ser-MCA, Ac-Thr-MCA, and Ac-Ala-Phe-MCA (P<0.005), and strong negative correlations were found between changes in total amounts of free amino acids and Ac-Ala-MCA, Ac-Met-MCA, Ac-Ser-MCA, Ac-Thr-MCA, and Ac-Ala-Phe-MCA (P<0.001). Negative correlations were also observed between changes in the amounts of free Ala, Arg, Lys, Leu, Met, Phe, and Tyr and the fluorescence intensities against Ala, Arg, Lys, Leu, Met, Phe, and Tyr-MCA respectively (P<0.001).

  我们尝试开发一种方法，通过使用荧光底物检测猪背最长肌（LD）中的蛋白酶活性，来简易有效地确定猪背最长肌死后老化的程度。利用这些底物检测到的蛋白酶活性的变化，用于衡量LD肌肉随时间的变化。在确定LD肌肉内的变异时，我们发现硬度的变化与荧光强度之间存在强烈的正相关，这些荧光强度是针对Ac-Ala-MCA、Ac-Met-MCA、Ac-Ser-MCA、Ac-Thr-MCA和Ac-Ala-Phe-MCA的（P<0.005），同时也发现总游离氨基酸量的变化与Ac-Ala-MCA、Ac-Met-MCA、Ac-Ser-MCA、Ac-Thr-MCA和Ac-Ala-Phe-MCA之间存在强烈的负相关（P<0.001）。我们还观察到，游离的Ala、Arg、Lys、Leu、Met、Phe和Tyr的量的变化与针对Ala、Arg、Lys、Leu、Met、Phe和Tyr-MCA的荧光强度之间存在负相关（P<0.001）。
• Interactions between sirtuins and fluorogenic small-molecule substrates offer insights into inhibitor design
  作者：Hua-Li Wang、Sha Liu、Zhu-Jun Yu、Chengyong Wu、Linna Cheng、Yuxi Wang、Kai Chen、Shu Zhou、Qiang Chen、Yamei Yu、Guo-Bo Li

  DOI：10.1039/c7ra05824a

  日期：——

  small-molecule substrates, i.e., acetyl-(AcBKA), crotonyl-(CrBKA), succinyl-(SuBKA), and myristoyl-(MyBKA)-containing substrates, were synthesized and tested against three representative sirtuin isoforms (i.e., SIRT2, SIRT5, and SIRT6). Enzyme kinetic results indicate that the fluorogenic small-molecule substrates have similar sirtuin-isoform preference as compared to peptide substrates. ITC analyses

  Sirtuins是依赖烟酰胺腺嘌呤二核苷酸（NAD +）的赖氨酸脱酰基酶，可调节代谢和应激反应，并参与人类病变，如神经退行性变。在这项研究中，合成了四个荧光小分子底物，即乙酰基-（AcBKA），巴豆酰基-（CrBKA），丁二酰基-（SuBKA）和肉豆蔻酰基-（MyBKA）包含的底物，并针对三种代表性的sirtuin同工型进行了测试。 （即，SIRT2，SIRT5和SIRT6）。酶动力学结果表明，与肽底物相比，荧光小分子底物具有类似的沉默调节蛋白同工型。ITC分析表明，AcBKA或MyBKA与SIRT2的结合主要是由熵驱动的，而SuBKA与SIRT5的结合是由焓驱动的。SIRT5：SuBKA复杂的晶体结构揭示了一种新的底物结合模式，该模式不同于肽底物结合模式，但涉及Loop S上的Tyr102，Arg105和其他催化重要残基。这表明SuBKA可能是通过SIRT5脱琥珀酰化的，可能是通过提出了
• Dual‐Mechanism Quenched Fluorogenic Probe Provides Selective and Rapid Detection of Cathepsin L Activity**
  作者：Kelton A. Schleyer、Ben Fetrow、Peter Zannes Fatland、Jun Liu、Maya Chaaban、Biwu Ma、Lina Cui

  DOI：10.1002/cmdc.202000823

  日期：2021.4.8

  have developed a fluorogenic probe, CTLAP, that displays good selectivity for CTL over CTB and CTV while exhibiting low background fluorescence attributed to dual quenching mechanisms. CTLAP achieves optimum CTL selectivity in the first 10 min of incubation, thus suggesting that it is amenable for rapid detection of CTL, even in the presence of competing cathepsins.

  组织蛋白酶 L (CTL) 是一种半胱氨酸蛋白酶，在许多疾病状态下活性上调。重叠的底物特异性使得 CTL 活性的选择性检测难以从其密切同源物 CTV 和普遍存在的 CTB 的活性中解析出来。由于对比度较差或需要额外的检测步骤来实现选择性，当前的 CTL 活性探针的应用受到限制。我们开发了一种荧光探针 CTLAP，与 CTB 和 CTV 相比，它对 CTL 具有良好的选择性，同时由于双重猝灭机制而表现出低背景荧光。CTLAP 在孵育的前 10 分钟内即可实现最佳的 CTL 选择性，因此表明即使存在竞争性组织蛋白酶，它也适合快速检测 CTL。
• Facile deprotection of Fmoc protected amino groups
  申请人：——

  公开号：US20020058788A1

  公开（公告）日：2002-05-16

  The present invention provides a method for deprotecting a Fmoc protected amino group, said method comprising treating in a suitable medium the protected amino group with a base in the presence of a thiol compound to yield a deprotected amino group.

  本发明提供了一种去保护Fmoc保护氨基的方法，该方法包括在适当介质中，在硫醇化合物的存在下，用碱处理保护氨基，以产生去保护的氨基。