D-[1-³H]ribose | 4933-79-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: D-[1-³H]ribose
• 英文别名: D-Ribose-1-t；D-Ribose-1-3H；(2R,3R,4R)-2,3,4,5-tetrahydroxy-1-tritiopentan-1-one
• CAS: 4933-79-3
• 化学式: C₅H₁₀O₅
• 分子量: 152.123
• InChiKey: PYMYPHUHKUWMLA-RHTJZAGISA-N

物化性质

• 闪点：
  17 °C

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.3
• 重原子数：
  10
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.8
• 拓扑面积：
  98
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  D-[1-³H]ribose 、 腺嘌呤 在 adenylate kinase 、 pyruvate kinase 、 alpha-酮戊二酸 、 5-phosphoribosyl 1-pyrophosphate synthetase 、 ribokinase 、 α-ketoglutarate dehydrogenase 、 adenine phosphoribosyl transferase 、 烟酰胺腺嘌呤双核苷酸磷酸盐 、 2-(膦酰氧基)丙烯酸酯 、 氯化铵 、 5’-三磷酸腺苷 、 magnesium chloride 作用下， 以 aq. phosphate buffer 为溶剂， 生成 ((2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl-5-t)methyl tetrahydrogen triphosphate
  参考文献：
  名称：

  同位素效应对人MAT2A的过渡态结构

  摘要：

  人甲硫氨酸S-腺苷基转移酶（MAT2A）催化由ATP和甲硫氨酸形成S-腺苷甲硫氨酸（SAM）。合成致死遗传分析已将MAT2A作为缺乏5'-甲基硫代腺苷磷酸化酶（MTAP）表达的肿瘤细胞的抗癌靶标。大约15％的人类癌症是MTAP – / –。其余的可以呈现MTAP -通过MTAP抑制剂。我们将动力学同位素效应（KIE），承诺因子（C f）和结合同位素效应（BIE）测量与量子力学（QM）计算结合使用，以解决人类MAT2A的过渡态结构。该反应的特征在于先进的S N2过渡状态。从亲核蛋氨酸硫到ATP的5'-C形成的键在过渡态（键序为0.67）为2.03Å。ATP的离去基团三磷酸的离解进展顺利，并在ATP的5'-C与三磷酸的氧之间形成2.32Å键（键序为0.23）。MAT2A及其MAT2B调节亚基的相互作用不会导致内在KIE发生变化，表明相同的过渡态结构。与来自大肠杆菌的蛋氨酸腺苷基转移酶的近对称过

  DOI：

  10.1021/jacs.7b05803