5-碘胞核嘧啶 | 1122-44-7

• 物质功能分类: 生物化工 - 核苷类药物 - 核苷酸及其类似物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 中文名称: 5-碘胞核嘧啶
• 中文别名: 5-碘胞嘧啶；4-氨基-2-羟基-5-碘嘧啶
• 英文名称: 5-iodocytosine
• 英文别名: 4-amino-5-iodo-1H-pyrimidin-2-one；6-amino-5-iodo-1H-pyrimidin-2-one
• CAS: 1122-44-7
• 化学式: C₄H₄IN₃O
• mdl: MFCD00023162
• 分子量: 237.0
• InChiKey: UFVWJVAMULFOMC-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 密度：
  2.65±0.1 g/cm3(Predicted)
• 稳定性/保质期：
  在常温常压下，该物质保持稳定。

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.5
• 重原子数：
  9
• 可旋转键数：
  0
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.0
• 拓扑面积：
  67.5
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  2

安全信息

• 危险品标志：
  Xn
• 安全说明：
  S24/25
• 危险类别码：
  R22
• WGK Germany：
  3
• 海关编码：
  2933599090
• RTECS号：
  HA6125000
• 危险性防范说明：
  P280,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H302

SDS

1.1 产品标识符
: 5-Iodocytosine
产品名称
1.2 鉴别的其他方法
4-Amino-2-hydroxy-5-iodopyrimidine
1.3 有关的确定了的物质或混合物的用途和建议不适合的用途
仅供科研用途，不作为药物、家庭备用药或其它用途。

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模块 2. 危险性概述
2.1 GHS分类
急性毒性, 经口 (类别4)
2.2 GHS 标记要素，包括预防性的陈述
象形图
警示词 警告
危险申明
H302 吞咽有害。
警告申明
预防
P264 操作后彻底清洁皮肤。
P270 使用本产品时不要进食、饮水或吸烟。
措施
P301 + P312 如果吞下去了: 如感觉不适，呼救解毒中心或看医生。
P330 漱口。
处理
P501 将内容物/ 容器处理到得到批准的废物处理厂。
2.3 其它危害物 - 无

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模块 3. 成分/组成信息
3.1 物 质
: 4-Amino-2-hydroxy-5-iodopyrimidine
别名
: C4H4IN3O
分子式
: 237.00 g/mol
分子量
组分 浓度或浓度范围
5-Iodocytosine
-
CAS 号 1122-44-7

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模块 4. 急救措施
4.1 必要的急救措施描述
一般的建议
请教医生。 出示此安全技术说明书给到现场的医生看。
吸入
如果吸入,请将患者移到新鲜空气处。 如果停止了呼吸,给于人工呼吸。 请教医生。
皮肤接触
用肥皂和大量的水冲洗。 请教医生。
眼睛接触
用水冲洗眼睛作为预防措施。
食入
切勿给失去知觉者从嘴里喂食任何东西。 用水漱口。 请教医生。
4.2 主要症状和影响，急性和迟发效应
4.3 及时的医疗处理和所需的特殊处理的说明和指示
无数据资料

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模块 5. 消防措施
5.1 灭火介质
灭火方法及灭火剂
用水雾,耐醇泡沫,干粉或二氧化碳灭火。
5.2 源于此物质或混合物的特别的危害
碳氧化物, 氮氧化物, 碘化氢
5.3 给消防员的建议
如必要的话,戴自给式呼吸器去救火。
5.4 进一步信息
无数据资料

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模块 6. 泄露应急处理
6.1 人员的预防,防护设备和紧急处理程序
使用个人防护设备。 防止粉尘的生成。 防止吸入蒸汽、气雾或气体。 保证充分的通风。 避免吸入粉尘。
6.2 环境保护措施
不要让产物进入下水道。
6.3 抑制和清除溢出物的方法和材料
收集、处理泄漏物，不要产生灰尘。 扫掉和铲掉。 存放进适当的闭口容器中待处理。
6.4 参考其他部分
丢弃处理请参阅第13节。

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模块 7. 操作处置与储存
7.1 安全操作的注意事项
避免接触皮肤和眼睛。 防止粉尘和气溶胶生成。
在有粉尘生成的地方,提供合适的排风设备。
7.2 安全储存的条件,包括任何不兼容性
贮存在阴凉处。 容器保持紧闭，储存在干燥通风处。
建议的贮存温度： -20 °C
7.3 特定用途
无数据资料

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模块 8. 接触控制和个体防护
8.1 容许浓度
最高容许浓度
没有已知的国家规定的暴露极限。
8.2 暴露控制
适当的技术控制
按照良好工业和安全规范操作。 休息前和工作结束时洗手。
个体防护设备
眼/面保护
带有防护边罩的安全眼镜符合 EN166要求请使用经官方标准如NIOSH (美国) 或 EN 166(欧盟)
检测与批准的设备防护眼部。
皮肤保护
所选择的保护手套必须符合EU的89/686/EEC规定和从它衍生出来的EN 376标准。
戴手套取 手套在使用前必须受检查。
请使用合适的方法脱除手套(不要接触手套外部表面),避免任何皮肤部位接触此产品.
使用后请将被污染过的手套根据相关法律法规和有效的实验室规章程序谨慎处理. 请清洗并吹干双手
身体保护
全套防化学试剂工作服, 防护设备的类型必须根据特定工作场所中的危险物的浓度和含量来选择。
呼吸系统防护
如须暴露于有害环境中,请使用P95型(美国)或P1型(欧盟 英国
143)防微粒呼吸器。如需更高级别防护,请使用OV/AG/P99型(美国)或ABEK-P2型 (欧盟 英国 143)
防毒罐。
呼吸器使用经过测试并通过政府标准如NIOSH（US）或CEN（EU）的呼吸器和零件。

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模块 9. 理化特性
9.1 基本的理化特性的信息
a) 外观与性状
形状: 粉末
颜色: 白色
b) 气味
无数据资料
c) 气味阈值
无数据资料
d) pH值
无数据资料
e) 熔点/凝固点
熔点/凝固点: 250 °C
f) 起始沸点和沸程
无数据资料
g) 闪点
无数据资料
h) 蒸发速率
无数据资料
i) 易燃性(固体,气体)
无数据资料
j) 高的/低的燃烧性或爆炸性限度 无数据资料
k) 蒸汽压
无数据资料
l) 蒸汽密度
无数据资料
m) 相对密度
无数据资料
n) 水溶性
无数据资料
o) n-辛醇/水分配系数
无数据资料
p) 自燃温度
无数据资料
q) 分解温度
无数据资料
r) 粘度
无数据资料

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模块 10. 稳定性和反应活性
10.1 反应性
无数据资料
10.2 稳定性
无数据资料
10.3 危险反应的可能性
无数据资料
10.4 应避免的条件
无数据资料
10.5 不兼容的材料
无数据资料
10.6 危险的分解产物
其它分解产物 - 无数据资料

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模块 11. 毒理学资料
11.1 毒理学影响的信息
急性毒性
无数据资料
皮肤刺激或腐蚀
无数据资料
眼睛刺激或腐蚀
无数据资料
呼吸道或皮肤过敏
无数据资料
生殖细胞突变性
无数据资料
致癌性
IARC:
此产品中没有大于或等于 0。1%含量的组分被 IARC鉴别为可能的或肯定的人类致癌物。
生殖毒性
无数据资料
特异性靶器官系统毒性（一次接触）
无数据资料
特异性靶器官系统毒性（反复接触）
无数据资料
吸入危险
无数据资料
潜在的健康影响
吸入 吸入可能有害。 可能引起呼吸道刺激。
摄入 误吞对人体有害。
皮肤 如果通过皮肤吸收可能是有害的。 可能引起皮肤刺激。
眼睛 可能引起眼睛刺激。
附加说明
化学物质毒性作用登记: HA6125000

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模块 12. 生态学资料
12.1 生态毒性
无数据资料
12.2 持久存留性和降解性
无数据资料
12.3 潜在的生物蓄积性
无数据资料
12.4 土壤中的迁移性
无数据资料
12.5 PBT 和 vPvB的结果评价
无数据资料
12.6 其它不利的影响
无数据资料

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模块 13. 废弃处置
13.1 废物处理方法
产品
与易燃溶剂相溶或者相混合，在备有燃烧后处理和洗刷作用的化学焚化炉中燃烧
将剩余的和未回收的溶液交给处理公司。
受污染的容器和包装
作为未用过的产品弃置。

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模块 14. 运输信息
14.1 联合国危险货物编号
欧洲陆运危规: - 国际海运危规: - 国际空运危规: -
14.2 联合国（UN）规定的名称
欧洲陆运危规: 非危险货物
国际海运危规: 非危险货物
国际空运危规: 非危险货物
14.3 运输危险类别
欧洲陆运危规: - 国际海运危规: - 国际空运危规: -
14.4 包裹组
欧洲陆运危规: - 国际海运危规: - 国际空运危规: -
14.5 环境危险
欧洲陆运危规: 否 国际海运危规 海运污染物: 否 国际空运危规: 否
14.6 对使用者的特别提醒
无数据资料

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模块 15 - 法规信息
N/A

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模块16 - 其他信息
N/A

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-碘胞核嘧啶 在 sodium tetrahydroborate 、 naphthalene-1,8-diselenol 作用下， 以 aq. phosphate buffer 为溶剂， 生成 胞嘧啶
  参考文献：
  名称：

  有机硒化合物对卤代核糖核酸和核苷的脱卤作用

  摘要：

  卤代核苷（例如5-碘-2'-脱氧尿苷和5-碘-2'-脱氧胞苷）被掺入复制细胞的DNA中，以促进DNA单链断裂以及紫外线照射后的链内或链间交联。在这项工作中，表明基于萘基的有机硒化合物可以介导卤代嘧啶基核苷的脱卤化作用，例如5‐X‐2′‐脱氧尿苷和5‐X‐2‐‐脱氧胞苷（X = Br或I ）。发现两种核苷的去碘化率均显着高于去溴化率。此外，发现碘胞苷的脱碘作用比碘尿苷的去碘作用要快。5-碘胞嘧啶和5-碘尿嘧啶脱碘的起始速率表明糖部分的性质会影响脱碘的动力学。

  DOI：

  10.1002/chem.201805112
• 作为产物：
  描述：

  胞嘧啶 在 碘 、 potassium hydroxide 作用下， 以 水 为溶剂， 生成 5-碘胞核嘧啶
  参考文献：
  名称：

  未溶剂化和 DMSO 溶剂化形式的含卤素核碱基衍生物的 X 射线晶体结构

  摘要：

  据报道，一系列卤化核碱基衍生物 1-4 在从 DMSO 结晶时产生无溶剂 (2) 和 DMSO 溶剂化晶体 (1, 3, 4)，其中一个 (4) 含有额外的水分子。参考有关化合物的先前结果描述和比较讨论了分子和晶体结构。1的分子是平面的，2和3的分子关于杂环和核糖残基的共同C2'-内构象显示syn对齐，而4也是syn对齐但糖构象中的C4'-exo。堆积结构揭示了通过氢键网络产生的典型聚集。这些涉及核碱基和核糖单元以及溶剂分子之间的常规 N–H…N、N–H…O 和 O–H…O 相互作用，

  DOI：

  10.1007/s11224-009-9570-5

文献信息

• Synthesis, structure and rearrangement of iodinated imidazo[1,2- c ]pyrimidine-5(6 H )-ones derived from cytosine
  作者：Josef Jansa、Antonín Lyčka、Aleš Růžička、Martin Grepl、Jan Vaněček

  DOI：10.1016/j.tet.2014.11.049

  日期：2015.1

  8-substituted imidazo[1,2-c]pyrimidine-5(6H)-ones (ethenocytosines). Starting ethenocytosines were obtained by cyclization of 5-halogenocytosines with chloroacetaldehyde or by subsequent Suzuki–Miyaura cross-coupling between 8-iodoimidazo[1,2-c]pyrimidine-5(6H)-one 1d and corresponding arylboronic acids. When imidazo[1,2-c]pyrimidine-5(6H)-one or 8-iodoimidazo[1,2-c]pyrimidine-5(6H)-one 1d was iodinated

  我们描述了各种8-取代的咪唑并[1,2 - c ]嘧啶-5（6 H）-ones（ethenocytosines）的温和和选择性碘化。通过将5-卤代胞嘧啶与氯乙醛环化或随后的Suzuki-Miyaura交叉偶联在8-碘咪唑并[1,2 - c ]嘧啶-5（6 H）-1d和相应的芳基硼酸中获得起始的胞嘧啶。当咪唑并[1,2 Ç ]嘧啶5（6 ħ） -酮或8碘咪唑并[1,2- c ^ ]嘧啶5（6 ħ） -酮1D通过碘化Ñ在DMF碘代丁二酰亚胺（NIS） ，纯3,8-二碘代衍生物2d获得了。在碱性或酸性条件下，该分子会重排为2,8-二十二烷基衍生物3d，随后可将其碘代为2,3,8-三十二烷基衍生物4d。由于仅通过NMR光谱不能令人信服地确定碘原子在咪唑环上的位置，因此对2d进行X射线分析以毫无疑问地确认其结构。将相同的反应顺序应用于另外八个乙炔胞嘧啶，可提供出色的区域选择性，易重排和高产率的碘化产物。通过1
• New Imidazo[1,2-<i>c</i>]pyrimidin-5(6<i>H</i>)-Ones Derived from Cytosine: Synthesis, Structure, and Cytotoxic Activity
  作者：Josef Jansa、Antonín Lyčka、Zdeňka Padělková、Martin Grepl、Petr Konečný、Marián Hajdúch、Petr Džubák

  DOI：10.1002/jhet.2243

  日期：2015.9

  This work describes the synthesis of 8‐iodoimidazo[1,2‐c]pyrimidin‐5(6H)‐one 2 from 5‐iodocytosine 1. This compound was subjected to Suzuki cross‐coupling reaction with aryl and heteroarylboronic acids. After optimization, 10 products 3a, 3b, 3c, 3d, 3e, 3f, 3g, 3h, 3i, 3j were obtained in good yields 61‐90%. Cytotoxic activity of all new products was evaluated on seven tumor cell lines including resistant

  这项工作描述了从5-碘胞嘧啶1合成8-碘咪唑并[1,2- c ]嘧啶-5（6 H）-one 2。该化合物与芳基和杂芳基硼酸进行了铃木交叉偶联反应。经过优化后，有10个产品3a，3b，3c，3d，3e，3f，3g，3h，3i，3j获得了61-90％的高收率。在包括抗性变体在内的七个肿瘤细胞系和正常人成纤维细胞上评估了所有新产品的细胞毒活性。在3h的情况下，两种衍生物表现出良好的生物活性和良好的治疗指数。
• Imidazo[1,2-<i>c</i> ]pyrimidin-5(6<i>H</i> )-one as a novel core of cyclin-dependent kinase 2 inhibitors: Synthesis, activity measurement, docking, and quantum mechanical scoring
  作者：Haresh Ajani、Josef Jansa、Cemal Köprülüoğlu、Pavel Hobza、Vladimír Kryštof、Antonín Lyčka、Martin Lepsik

  DOI：10.1002/jmr.2720

  日期：2018.9

  We report on the synthesis, activity testing, docking, and quantum mechanical scoring of novel imidazo[1,2‐c]pyrimidin‐5(6H)‐one scaffold for cyclin‐dependent kinase 2 (CDK2) inhibition. A series of 26 compounds substituted with aromatic moieties at position 8 has been tested in in vitro enzyme assays and shown to inhibit CDK2. 2D structure‐activity relationships have ascertained that small substituents

  我们报告了新型咪唑并[1,2 - c ]嘧啶-5（6 H）-1支架对细胞周期蛋白依赖性激酶2（CDK2）抑制的合成，活性测试，对接和量子力学评分。在体外酶法中已经测试了一系列在位置8处被芳香族部分取代的26种化合物，并显示出抑制CDK2的作用。二维结构与活性的关系已确定，位置8处的小取代基（最大为萘基或甲氧基苯基的大小）通常会导致单位数微摩尔IC 50较大的取代基（取代的联苯）会降低化合物的活性。使用Glide对接获得的化合物的结合模式在CDK2上显示出最多2个铰链区氢键，并且在抑制剂核心的取向和8个取代基的位置上有所不同。基于半经验量子力学的计分方法确定了可能的有利结合模式，这将有助于未来基于结构的设计以及杂环核取代基的合成优化。总之，我们已经确定了CDK2抑制的新核心，并将进一步探索以增加化合物的效力并监测其对其他蛋白激酶的选择性。
• Inhibitors of the kinase IspE: structure–activity relationships and co-crystal structure analysis
  作者：Anna K. H. Hirsch、Magnus S. Alphey、Susan Lauw、Michael Seet、Luzi Barandun、Wolfgang Eisenreich、Felix Rohdich、William N. Hunter、Adelbert Bacher、François Diederich

  DOI：10.1039/b804375b

  日期：——

  Enzymes of the non-mevalonate pathway for isoprenoid biosynthesis are therapeutic targets for the treatment of important infectious diseases. Whereas this pathway is absent in humans, it is used by plants, many eubacteria and apicomplexan protozoa, including major human pathogens such as Plasmodium falciparum and Mycobacterium tuberculosis. Herein, we report on the design, preparation and biological evaluation of a new series of ligands for IspE protein, a kinase from this pathway. These inhibitors were developed for the inhibition of IspE from Escherichia coli, using structure-based design approaches. Structure–activity relationships (SARs) and a co-crystal structure of Aquifex aeolicus IspE bound to a representative inhibitor validate the proposed binding mode. The crystal structure shows that the ligand binds in the substrate–rather than the adenosine 5′-triphosphate (ATP)-binding pocket. As predicted, a cyclopropyl substituent occupies a small cavity not used by the substrate. The optimal volume occupancy of this cavity is explored in detail. In the co-crystal structure, a diphosphate anion binds to the Gly-rich loop, which normally accepts the triphosphate moiety of ATP. This structure provides useful insights for future structure-based developments of inhibitors for the parasite enzymes.

  非甲羟戊酸途径合成类异戊二烯的酶是治疗重要传染病的关键药物靶点。虽然人类体内不存在这条途径,但植物、许多真细菌和顶复门原虫(包括诸如恶性疟原虫和结核分枝杆菌等主要人类病原体)都利用该途径。本文报道了针对该途径中的蛋白激酶IspE,设计、制备以及生物评价的一系列新型配体。这些抑制剂是基于结构的药物设计方法,通过抑制大肠杆菌的IspE蛋白而开发的。活性−结构关系(SARs)和与代表性抑制剂共同结晶的 Aquifex aeolicus IspE 的相关晶体结构验证了预期的结合模式。晶体结构显示,配体结合位点是底物结合口袋,而不是腺苷5'-三磷酸(ATP)结合位点。预测显示,环丙基取代基占据了一个非底物所用的小空腔。我们详细探讨了这个空腔的最佳体积占据。在共晶结构中,二磷酸阴离子与具有丰富甘氨酸的环结合,后者通常结合ATP的三磷酸部分。该结构为未来基于结构的药物设计方法开发顶复门寄生虫酶的抑制剂提供了有用的参考。
• [EN] MODIFIED CYTOSINE POLYNUCLEOTIDE OLIGOMERS AND METHODS<br/>[FR] OLIGOMÈRES POLYNUCLÉOTIDIQUES DE CYTOSINE MODIFIÉE ET PROCÉDÉS CORRESPONDANTS
  申请人：CEPHEID

  公开号：WO2015153510A1

  公开（公告）日：2015-10-08

  Disclosed are modified cytosine bases that provide enhanced base-pairing affinity for guanine bases in polynucleotide hybridization complexes. Also disclosed are polynucleotide oligomers, polynucleotide hybridization complexes that comprise such modified cytosine bases. Also disclosed are various methods of use. For example, in some embodiments, modified polynucleotide oligomers disclosed herein can be used as primers and probes for nucleic acid amplification and/or detection.

  揭示了一种改良的胞嘧啶碱基，可为多核苷酸杂交复合物中鸟嘌呤碱基提供增强的碱基配对亲和力。还揭示了多核苷酸寡聚体，包括这种改良的胞嘧啶碱基的多核苷酸杂交复合物。还揭示了各种使用方法。例如，在某些实施例中，本文所揭示的改良多核苷酸寡聚体可用作核酸扩增和/或检测的引物和探针。

表征谱图