5-碘胞苷 | 1147-23-5

• 物质功能分类: 生物化工 - 核苷类药物 - 核苷中间体
• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 中文名称: 5-碘胞苷
• 中文别名: 5-碘胞啶
• 英文名称: 4-amino-1-((2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl) tetrahydrofuran-2-yl)-5-iodopyrimidine-2(1H)-one
• 英文别名: 5-iodo-cytidine；5-iodocytidine；iodocytidine；5-Iod-cytidin；5-Jod-cytidin；5-Iodcytidin；4-amino-1-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-iodopyrimidin-2-one
• CAS: 1147-23-5
• 化学式: C₉H₁₂IN₃O₅
• mdl: MFCD00056070
• 分子量: 369.116
• InChiKey: LQQGJDJXUSAEMZ-UAKXSSHOSA-N

物化性质

• 熔点：
  >160°C (dec.)
• 沸点：
  565.5±60.0 °C(Predicted)
• 密度：
  2.52±0.1 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  DMSO（少许）、甲醇（少许）、水（少许）

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.7
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.555
• 拓扑面积：
  129
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  5

安全信息

• 安全说明：
  S24/25
• 海关编码：
  2934999090
• 危险性防范说明：
  P280,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H302
• 储存条件：
  -20°C

制备方法与用途

5-碘代胞苷（5-Iodo-D-胞苷）是一种嘌呤核苷类似物，具有广泛抗肿瘤活性，尤其针对惰性淋巴系统恶性肿瘤。其抗癌机制主要通过抑制DNA合成和诱导细胞凋亡来实现。

上下游信息

• 上游原料

  中文名称	英文名称	CAS号	化学式	分子量
  胞苷	CYTIDINE	65-46-3	C9H13N3O5	243.219

• 下游产品

  中文名称	英文名称	CAS号	化学式	分子量
  胞苷	CYTIDINE	65-46-3	C9H13N3O5	243.219
  ——	5-ethynyl-cytidine	65223-78-1	C11H13N3O5	267.241
  ——	5-(2-cyanoethyl)cytidine	81206-84-0	C12H16N4O5	296.283
  ——	5-azidopentynyl cytidine	——	C14H18N6O5	350.334
  ——	5-<2-(methoxycarbonyl)ethyl>cytidine	137248-66-9	C13H19N3O7	329.31
  ——	(E)-5-<2-(Methoxycarbonyl)ethenyl>cytidine	81244-97-5	C13H17N3O7	327.294
  ——	5-[3-(trifluoroacetamido)propynyl]cytidine	480439-97-2	C14H15F3N4O6	392.292
  ——	5-[3-(2,2,2-trifluoroacetamido)propyl]cytidine	1340586-67-5	C14H19F3N4O6	396.323
  ——	O6,5'-Cyclocytidin	23276-37-1	C9H11N3O5	241.203

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-碘胞苷 在 sodium tetrahydroborate 、 naphthalene-1,8-diselenol 作用下， 以 aq. phosphate buffer 为溶剂， 生成 胞苷
  参考文献：
  名称：

  有机硒化合物对卤代核糖核酸和核苷的脱卤作用

  摘要：

  卤代核苷（例如5-碘-2'-脱氧尿苷和5-碘-2'-脱氧胞苷）被掺入复制细胞的DNA中，以促进DNA单链断裂以及紫外线照射后的链内或链间交联。在这项工作中，表明基于萘基的有机硒化合物可以介导卤代嘧啶基核苷的脱卤化作用，例如5‐X‐2′‐脱氧尿苷和5‐X‐2‐‐脱氧胞苷（X = Br或I ）。发现两种核苷的去碘化率均显着高于去溴化率。此外，发现碘胞苷的脱碘作用比碘尿苷的去碘作用要快。5-碘胞嘧啶和5-碘尿嘧啶脱碘的起始速率表明糖部分的性质会影响脱碘的动力学。

  DOI：

  10.1002/chem.201805112
• 作为产物：
  描述：

  胞苷 在 碘 、 碘酸 、 溶剂黄146 作用下， 以 四氯化碳 、 水 为溶剂， 反应 2.0h， 以51%的产率得到5-碘胞苷
  参考文献：
  名称：

  嘧啶吗啉核苷5-碘衍生物的有效合成

  摘要：

  核苷的吗啉衍生物作为合成 DNA 或 siRNA 类似物的单体广泛用于医学和生物学。它们被认为是抗癌、抗病毒、抗菌和抗寄生虫治疗以及生物分析应用的有前途的药物。Morpholino 寡核苷酸是反义治疗中影响深远的候选者。Eteplirsen，吗啉代磷酸二酰胺寡核苷酸，于 2016 年被 FDA 批准用于治疗杜兴氏肌营养不良症。吗啉代核苷三磷酸似乎是 DNA 聚合酶 b 和 HIV-1 逆转录酶的底物，而吗啉代胸苷三磷酸被发现是 Taq DNA 聚合酶的底物. 使用杂环碱基处卤化的核苷衍生物为核苷、核苷酸、和寡核苷酸。核苷的碘衍生物最常用于交叉偶联反应中的进一步官能化，因为它们比溴和氯更具反应性。此前，已报道了含有 1a 的 N-Tr 保护的吗啉代核苷的合成。同一作者发表了一种制备含有 5-碘胞嘧啶作为杂环碱基的 40-N-Trand 20-OCH2-甲硅烷基保护的吗啉代核苷的程序。该方法包

  DOI：

  10.1080/00304948.2018.1462063
• 作为试剂：
  描述：

  胞苷 、 碘 、 在 silica gel 、 5-碘胞苷 作用下， 以 溶剂黄146 、 四氯化碳 、 水 为溶剂， 反应 22.17h， 以resulting in 19.4 g (85.1%) desired product 5-iodocytidine (195)的产率得到5-碘胞苷
  参考文献：
  名称：

  ALTERNATIVE NUCLEIC ACID MOLECULES AND USES THEREOF

  摘要：

  本公开提供了替代核苷、核苷酸和核酸以及它们的使用方法。

  公开号：

  US20150167017A1

文献信息

• [EN] COMPOSITIONS AND METHODS FOR SYNTHESIS OF PHOSPHORYLATED MOLECULES<br/>[FR] COMPOSITIONS ET PROCÉDÉS DE SYNTHÈSE DE MOLÉCULES PHOSPHORYLÉES
  申请人：UNIV CALIFORNIA

  公开号：WO2019195494A1

  公开（公告）日：2019-10-10

  The invention provides compositions and methods for synthesis of phosphorylated organic compounds, including nucleoside triphosphates.

  这项发明提供了合成磷酸化有机化合物的组合物和方法，包括核苷三磷酸。
• [EN] NOVEL PHOSPHOROUS (V)-BASED REAGENTS, PROCESSES FOR THE PREPARATION THEREOF, AND THEIR USE IN MAKING STEREO-DEFINED ORGANOPHOSHOROUS (V) COMPOUNDS<br/>[FR] NOUVEAUX RÉACTIFS À BASE DE PHOSPHORE (V), LEURS PROCÉDÉS DE PRÉPARATION ET LEUR UTILISATION DANS LA FABRICATION DE COMPOSÉS ORGANOPHOSHOREUX (V) STÉRÉODÉFINIS
  申请人：BRISTOL MYERS SQUIBB CO

  公开号：WO2019200273A1

  公开（公告）日：2019-10-17

  The present invention relates to novel phosphorous (V) (P(V)) reagents, methods for preparing thereof, and methods for preparing organophosphorous (V) compounds by using the novel reagents.

  本发明涉及新型磷（V）（P(V)）试剂，其制备方法以及利用这种新型试剂制备有机磷（V）化合物的方法。
• Nucleotide mimics and their prodrugs
  申请人：——

  公开号：US20040059104A1

  公开（公告）日：2004-03-25

  The present invention relates to nucleoside diphosphate mimics and nucleoside triphosphate mimics, which contain diphosphate or triphosphate moiety mimics and optionally sugar-modifications and/or base-modifications. The nucleotide mimics of the present invention, in a form of a pharmaceutically acceptable salt, a pharmaceutically acceptable prodrug, or a pharmaceutical formulation, are useful as antiviral, antimicrobial, and anticancer agents. The present invention provides a method for the treatment of viral infections, microbial infections, and proliferative disorders. The present invention also relates to pharmaceutical compositions comprising the compounds of the present invention optionally in combination with other pharmaceutically active agents.

  本发明涉及核苷二磷酸模拟物和核苷三磷酸模拟物，其中包含二磷酸或三磷酸基团模拟物，以及可选的糖修饰和/或碱基修饰。本发明的核苷酸模拟物，以药学上可接受的盐、药学上可接受的前药或药物配方的形式，可用作抗病毒、抗微生物和抗癌剂。本发明提供了一种治疗病毒感染、微生物感染和增生性疾病的方法。本发明还涉及包含本发明化合物的药物组合物，可选地与其他药理活性剂结合。
• [EN] COMPOSITIONS AND METHODS FOR DELIVERY OF THERAPEUTIC AGENTS<br/>[FR] COMPOSITIONS ET PROCÉDÉS PERMETTANT D'ADMINISTRER DES AGENTS THÉRAPEUTIQUES
  申请人：MODERNATX INC

  公开号：WO2017099823A1

  公开（公告）日：2017-06-15

  This disclosure provides improved lipid-based compositions, including lipid nanoparticle compositions, and methods of use thereof for delivering agents in vivo including nucleic acids and proteins. These compositions are not subject to accelerated blood clearance and they have an improved toxicity profile in vivo.

  这项披露提供了改进的基于脂质的组合物，包括脂质纳米粒子组合物，以及它们用于体内传递药剂的方法，包括核酸和蛋白质。这些组合物不受加速血清清除的影响，并且它们在体内具有改进的毒性特性。
• Structure–Activity Relationship of Purine and Pyrimidine Nucleotides as Ecto-5′-Nucleotidase (CD73) Inhibitors
  作者：Anna Junker、Christian Renn、Clemens Dobelmann、Vigneshwaran Namasivayam、Shanu Jain、Karolina Losenkova、Heikki Irjala、Sierra Duca、Ramachandran Balasubramanian、Saibal Chakraborty、Frederik Börgel、Herbert Zimmermann、Gennady G. Yegutkin、Christa E. Müller、Kenneth A. Jacobson

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.9b00164

  日期：2019.4.11

  Cluster of differentiation 73 (CD73) converts adenosine 5'-monophosphate to immunosuppressive adenosine, and its inhibition was proposed as a new strategy for cancer treatment. We synthesized 5'- O-[(phosphonomethyl)phosphonic acid] derivatives of purine and pyrimidine nucleosides, which represent nucleoside diphosphate analogues, and compared their CD73 inhibitory potencies. In the adenine series

  分化簇73（CD73）将5'-单磷酸腺苷转化为免疫抑制腺苷，其抑制作用被提出作为一种新的癌症治疗策略。我们合成了嘌呤和嘧啶核苷的5'-O-[（膦酰基甲基）膦酸]衍生物，它们代表核苷二磷酸类似物，并比较了它们对CD73的抑制作用。在腺嘌呤系列中，大多数核糖修饰和1-deaza和3-deaza都是有害的，但可以容忍7-deaza。耐受尿嘧啶被N3-甲基取代，但不能被较大的基团或2-硫代取代。不容许1，2-二膦酰基-乙基修饰。N4-（芳基）烷氧基-胞嘧啶衍生物，特别是具有庞大的苄氧基取代基的化合物，显示出增强的效力。最有效的抑制剂是5' -5-氟尿苷（4l），N4-苯甲酰基胞苷（7f），N4- [O-（4-苄氧基）]胞苷（9h）和N4- [O的O-[（膦酰基甲基）膦酸]衍生物-（4-萘-2-基甲氧基）]-胞苷（9e）（在人CD73上Ki值为5-10 nM）。在两种尿苷二磷酸激活的P2Y受体亚型上