1,3,2',2''',6'''-pentaazido-6,3',2'',5'',3''',4'''-hexa-O-benzyl-1,3,2',2''',6'''-pentadeaminoparomomycin | 1073243-62-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 1,3,2',2''',6'''-pentaazido-6,3',2'',5'',3''',4'''-hexa-O-benzyl-1,3,2',2''',6'''-pentadeaminoparomomycin
• 英文别名: 2",3',3'",4'",5",6-hexa-O-benzyl-1,2',2'",3,6'"-pentaazidoparomomycin；1,3,2',2'",6"'-pentaazido-6,3',2",5",3"',4"'-hexa-O-benzyl-1,3,2',2"',6"'-pentadeaminoparomomycin
• CAS: 1073243-62-5
• 化学式: C₆₅H₇₁N₁₅O₁₄
• 分子量: 1286.37
• InChiKey: IZVUOLPFCROVOC-JRQSXCJQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  11.24
• 重原子数：
  94.0
• 可旋转键数：
  32.0
• 环数：
  10.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  395.02
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  19.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1,3,2',2''',6'''-pentaazido-6,3',2'',5'',3''',4'''-hexa-O-benzyl-1,3,2',2''',6'''-pentadeaminoparomomycin 在 sodium hydroxide 、 水 、 三甲基膦 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 2.5h， 生成
  参考文献：
  名称：

  C（4'）修饰的巴龙霉素衍生物的合成与评价

  摘要：

  将巴龙霉素的2-氨基-2-脱氧-α -D-吡喃葡萄糖基部分（环I）替换为2,4-二氨基-2,4-二脱氧-α -D-吡喃葡萄糖基，2,4-二氨基-2 ，4-二脱氧-α -D-吡喃半乳糖基，2-氨基-2-脱氧-α -D-吡喃半乳糖基或3,4,5-三苯氧基-4-氮杂-α -D-赤型-庚七庚基部分C（4'）上的取代基与核糖体RNA相互作用的作用。三氟甲磺酸酯6由关键的中间体五叠氮基3'，6'-二苄基醚5制备，而己糖糖10是通过用Dess - Martin将5氧化而制得的的高碘。用NaBH 4进行立体选择性还原10，得到的醇11转变为三氟甲磺酸酯12。通过用叠氮化四丁基铵分别处理三氟甲磺酸酯6和12，获得了差向异构六叠氮化物7和13。乙二醇2的高碘酸盐裂解产生二醛24，该二醛24被苯胺和苄胺还原胺化，得到3,4,5-苯氧基-4-氮杂-α -D-赤型-庚庚糖苷25和26， 分别。标准叠氮化物的还原和脱苄基化反应得到9（2

  DOI：

  10.1002/hlca.200890167
• 作为产物：
  描述：

  1,3,2',2''',6'''-pentaazido-6,3',2'',5'',3''',4'''-hexa-O-benzyl-4',6'-O-benzylidene-1,3,2',2''',6'''-pentadeaminoparomomycin 在 对甲苯磺酸 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 生成 1,3,2',2''',6'''-pentaazido-6,3',2'',5'',3''',4'''-hexa-O-benzyl-1,3,2',2''',6'''-pentadeaminoparomomycin
  参考文献：
  名称：

  基于结构的设计和合成安普霉素-回蓝霉素类似物：6'-位置的构型的重要性以及6'-氨基和羟基系列之间的差异

  摘要：

  描述了一系列氨基糖苷类抗生素新霉素和巴龙霉素的四个类似物的制备，其中参与环与核糖体靶标关键结合相互作用的环I被阿普霉素样二恶双环[4.4.0]辛烷系统取代。这种修饰的作用是将新霉素或巴龙霉素环I的羟甲基侧链（作为二氧杂双环辛烷环的一部分）锁定在gauche – gauche或gauche – trans中构象（分别为双环系统的轴向或赤道）。使用细菌核糖体和携带真核解码A位盒的重组杂种核糖体，通过无细胞翻译测定法研究了这些化合物的抗核糖体活性。在新形成的环中被赤道羟基或氨基取代的化合物比其轴向非对映异构体活性高得多，这为晶体学衍生的氨基糖苷-核糖体相互作用模型提供了有力的支持。一种这样的带有赤道羟基的双环化合物具有与母体相同的活性，但显示出更好的核糖体选择性，预示着治疗指数的提高。缺少羟甲基环I侧链的巴龙霉素类似物的活性明显低于母体。报道了针对所选化合物的针对模型革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌的

  DOI：

  10.1021/jacs.7b07754

文献信息

• NEOMYCIN AND PAROMOMYCIN DERIVATIVES
  申请人：WAYNE STATE UNIVERSITY

  公开号：US20210107932A1

  公开（公告）日：2021-04-15

  The present disclosure relates to derivatives of neamine-based aminoglycoside antibacterial drugs modified in position C6′, C2′ and/or C5″. The modifications impart favorable properties regarding activity against ESKAPE pathogens, evasion of resistance traits and increased selectivity, enabling systemic use of the compounds.

  本公开涉及对以奈阿霉素为基础的氨基糖苷抗菌药物进行的在C6'、C2'和/或C5''位置进行修饰的衍生物。这些修饰赋予了有利的特性，包括对ESKAPE病原体的活性、逃避抗药性特征以及增加选择性，从而使化合物能够进行全身应用。
• Predictive Analysis of the Side Chain Conformation of the Higher Carbon Sugars: Application to the Preorganization of the Aminoglycoside Ring 1 Side Chain for Binding to the Bacterial Ribosomal Decoding A Site
  作者：Michael G. Pirrone、Marina Gysin、Klara Haldimann、Sven N. Hobbie、Andrea Vasella、David Crich

  DOI：10.1021/acs.joc.0c01836

  日期：2020.12.18

  N-acetylneuraminic acid, have little impact on the conformation of the exocyclic bond. On the basis of this model the conformation of the exocyclic bond in ring I of 6′-homologated 4,5-disubstituted 2-deoxystreptamine class aminoglycoside antibiotics was predicted and was borne out by NMR analysis of newly synthesized derivatives in D2O at pD5. The antiribosomal and antibacterial activity of these derivatives is briefly

  为了促进高碳糖中吡喃糖苷环外环键的预测，提出了一个模型，该模型将由分支点和两个侧翼中心（C4-C5-C6）组成的三个立体中心的相对构型联系起来。庚糖和更高的醛糖以及唾液酸和乌洛糖酸中的 C5-C6-C7）与简单的开环戊糖。通过检查费歇尔投影公式将给定立体三联体指定为阿拉伯、lxyo、核糖或xylo，允许通过与简单戊醇的已知溶液（=在所有情况下为晶体）构象进行比较来预测环外键的构象。侧链中更远的立体中心，如N-乙酰神经氨酸的 8 位，对环外键的构象影响很小。在此模型的基础上，预测了6'-同源4,5-二取代2-脱氧链霉胺类氨基糖苷类抗生素环I中环外键的构象，并通过新合成衍生物在D 2 O中pD5的NMR分析得到证实。。简要介绍并讨论了这些衍生物的抗核糖体和抗菌活性，并根据与核糖体解码 A 位点结合的侧链的预组织进行了讨论。预计该预测分析还将用于预测其他2-(1-羟烷基)-3-羟基四氢吡喃和四氢呋喃中环外键的构象。
• N6′, N6′′′, and O4′ Modifications to Neomycin Affect Ribosomal Selectivity without Compromising Antibacterial Activity
  作者：Girish C. Sati、Dimitri Shcherbakov、Sven N. Hobbie、Andrea Vasella、Erik C. Böttger、David Crich

  DOI：10.1021/acsinfecdis.6b00214

  日期：2017.5.12

  hybrids with eukaryotic decoding A sites, we investigate how individual substituents and their combinations affect activity and selectivity at the target level. In principle, and as shown by cell-free translation assays, modifications of the N6' and N6‴ positions allow enhancement of target selectivity without compromising antibacterial activity. As with the 6'OH aminoglycoside paromomycin, the 4'-O-ethyl

  描述了一系列在N6'和/或N6‴上携带2-羟乙基取代基的新霉素衍生物的合成，所述取代基单独地以及与4'-O-乙基组合。通过使用野生型细​​菌核糖体及其与真核解码 A 位点的杂交体进行无细胞翻译测定，我们研究了单个取代基及其组合如何影响目标水平的活性和选择性。原则上，如无细胞翻译测定所示，N6'和N6‴位置的修饰可以增强靶标选择性，而不会影响抗菌活性。与 6'OH 氨基糖苷巴龙霉素一样，4'-O-乙基修饰会影响新霉素及其 6'-N-(2-羟乙基) 衍生物的核糖体活性、选择性和抗菌特性。修饰的氨基糖苷类对模型革兰氏阳性和革兰氏阴性微生物显示出良好的抗菌活性，包括 ESKAPE 病原体金黄色葡萄球菌、肺炎克雷伯菌、阴沟肠杆菌和鲍曼不动杆菌。
• Synthesis of a Pseudodisaccharide Suitable for Synthesis of Ring I Modified 4,5-2-Deoxystreptamine Type Aminoglycoside Antibiotics
  作者：Amr Sonousi、Andrea Vasella、David Crich

  DOI：10.1021/acs.joc.0c00743

  日期：2020.6.5

  facilitate the synthesis of paromomycin and/or neomycin analogues, we describe a cleavage of ring I from paromomycin that proceeds in the presence of azides and affords a glycosyl acceptor for the installation of a modified ring I. A paromomycin 4′,6′-diol is oxidized by the Dess–Martin periodinane followed by m-chloroperoxybenzoic acid. Base treatment then affords a protected pseudodisaccharide, which functions

  为了促进巴龙霉素和/或新霉素类似物的合成，我们描述了在叠氮化物存在下从巴龙霉素上裂解环 I，并提供用于安装修饰的环 I 的糖基受体。巴龙霉素 4',6'-二醇被戴斯-马丁高碘烷氧化，然后被间氯过苯甲酸氧化。然后碱处理得到受保护的假二糖，其充当糖基受体。该方法还应适用于从寡糖和糖缀合物中裂解吡喃糖基4,6-二醇。
• [EN] MODIFIED AMINOGLYCOSIDE COMPOUNDS AND USES THEREOF IN DISABLING BACTERIAL RIBOSOME<br/>[FR] COMPOSÉS AMINOGLYCOSIDES MODIFIÉS ET LEURS UTILISATIONS DANS LA DÉSACTIVATION DE RIBOSOMES BACTÉRIENS
  申请人：TECHNION RES & DEV FOUNDATION

  公开号：WO2020105054A9

  公开（公告）日：2020-11-05