Nα-(fluoren-9-ylmethoxycarbonyl)-3-O-(3,4,6-tri-O-acetyl-2-azido-2-deoxy-α-D-galactopyranosyl)-L-serine allyl ester | 136497-86-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: Nα-(fluoren-9-ylmethoxycarbonyl)-3-O-(3,4,6-tri-O-acetyl-2-azido-2-deoxy-α-D-galactopyranosyl)-L-serine allyl ester
• 英文别名: Fmoc-Ser(3,4,6-Ac3-2-N3Gla)-All；prop-2-enyl (2S)-3-[(2S,3R,4R,5R,6R)-4,5-diacetyloxy-6-(acetyloxymethyl)-3-azidooxan-2-yl]oxy-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)propanoate
• CAS: 136497-86-4
• 化学式: C₃₃H₃₆N₄O₁₂
• 分子量: 680.668
• InChiKey: IVQPIRGAZQZYJR-VKLFMPCTSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.1
• 重原子数：
  49
• 可旋转键数：
  19
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  176
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  14

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Nα-(fluoren-9-ylmethoxycarbonyl)-3-O-(3,4,6-tri-O-acetyl-2-azido-2-deoxy-α-D-galactopyranosyl)-L-serine allyl ester 在 四(三苯基膦)钯 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 溶剂黄146 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N-甲基苯胺 、 锌 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 2.75h， 生成
  参考文献：
  名称：

  糖蛋白合成中的糖辅助连接

  摘要：

  糖辅助连接 (SAL) 为合成糖肽提供了一种有吸引力的策略，包括合成不含半胱氨酸的 β-O 连接和 N 连接糖肽。在这里，我们扩展了 SAL 用于合成 α-O 连接的糖肽和糖蛋白的效用。为了在糖蛋白合成的背景下探索 SAL，我们开发了一种新的化学合成路线，用于 α-O 连接的糖蛋白双萜 epsilon。在我们合成的第一阶段，SAL 通过 Gly-Val 连接点组装了双萜片段 Cys(Acm)37-Gly(52) 和片段 Val(53)-Phe(82)。随后，在 Acm 脱保护后，通过天然化学连接 (NCL) 将敌百虫片段 Cys(37)-Phe(82) 连接到片段 Asp(1)-Asn(36) 以提供完整的敌百虫 epsilon 序列。在最后的合成步骤中，应用氢解从糖部分去除硫醇手柄，同时将突变的 Cys(37) 转化为天然丙氨酸残基。此外，我们通过在乙酰氨基甲基 (Acm) 保护的半胱氨

  DOI：

  10.1021/ja0708971
• 作为产物：
  描述：

  2-叠氮-D-半乳糖四乙酸酯 、 N-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-L-serine allyl ester 在 三氟化硼乙醚 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 以65%的产率得到Nα-(fluoren-9-ylmethoxycarbonyl)-3-O-(3,4,6-tri-O-acetyl-2-azido-2-deoxy-α-D-galactopyranosyl)-L-serine allyl ester
  参考文献：
  名称：

  Microwave-Assisted Synthesis of Fluorescein-Labelled GalNAcα1-O-Ser/Thr (Tn) Glycopeptides as Immunological Probes

  摘要：

  Fluorescently labelled glycopeptides containing GalNAc alpha 1-O-Ser/Thr residues provide valuable immunological probes for the development of cancer vaccines. The microwave-assisted automated Fmoc solid-phase synthesis of a series of 5(6)-carboxyfluorescein-labelled GalNAc alpha 1-O-Ser/Thr peptides is described. Lys(Dde)-Gly-Wang polystyrene resin was elongated using Fmoc SPPS with incorporation of several GalNAc alpha 1-O-Ser/Thr residues. Deprotection of the Lys(Dde) then allowed attachment of the 5(6)-carboxyfluorescein label. The synthetic methodology described is flexible and suitably robust enabling the incorporation of three contiguous GalNAc alpha 1-O-Ser residues into the peptide chain.

  DOI：

  10.1055/s-0029-1218635

文献信息

• Piperidine is preferred to morpholine for Fmoc cleavage in solid phase glycopeptide synthesis as exemplified by preparation of glycopeptides related to HIV gp120 and mucins
  作者：Tatjana Vuljanic、Karl-Erik Bergquist、Henrik Clausen、Sarbari Roy、Jan Kihlberg

  DOI：10.1016/0040-4020(96)00369-9

  日期：1996.6

  deallylation. The derivatives 5 and 8 were used for solid phase synthesis of glycopeptides related to HIV gp120 and mucins. In these syntheses piperidine was found to give efficient Fmoc removal whereas deprotection with morpholine was slow and incomplete for some steps. In contrast to previous concerns β-elimination and epimerization of glycopeptide stereocenters was not encountered when piperidine

  在Tn的抗原[将Fmoc-丝氨酸/苏氨酸（AC的被保护的衍生物3 GalNAcα）-OH，化合物5和8 ]已经制备通过将Fmoc-丝氨酸/苏氨酸- O-烯丙基糖基化与3,4,6-三- ø -乙酰基-2-叠氮基-2-脱氧-D-吡喃半乳糖基氯（2），然后将叠氮基转化为乙酰胺并脱脱甲酰。导数5和8用于固相合成与HIV gp120和粘蛋白有关的糖肽。在这些合成中，发现哌啶可有效去除Fmoc，而吗啉的脱保护作用缓慢且在某些步骤中不完全。与先前的关注相反，当哌啶用于Fmoc脱保护时，没有遇到糖肽立体中心的β-消除和差向异构化。然而，发现对于糖肽而言，其侧链脱保护并从固相切割。
• Revisiting Glycosylations Using Glycosyl Fluoride by BF₃·Et₂O: Activation of Disarmed Glycosyl Fluorides with High Catalytic Turnover
  作者：Yoshiyuki Manabe、Takuya Matsumoto、Yuka Ikinaga、Yuya Tsutsui、Shota Sasaya、Yuichiro Kadonaga、Akihito Konishi、Makoto Yasuda、Tomoya Uto、Changhao Dai、Kumpei Yano、Atsushi Shimoyama、Ayana Matsuda、Koichi Fukase

  DOI：10.1021/acs.orglett.1c03233

  日期：2022.1.14

  Catalytic glycosylations with glycosyl fluorides using BF3·Et2O are presented. Glycosylations with both armed and disarmed donors were efficiently catalyzed by 1 mol% of BF3·Et2O in a nitrogen-filled glovebox without the use of dehydrating agents. Our finding is in sharp contrast with conventional BF3·Et2O-mediated glycosylations, where excess Lewis acid and additives are required. Mechanistic studies

  介绍了使用 BF 3 ·Et 2 O与糖基氟化物的催化糖基化。在没有使用脱水剂的情况下，在充满氮气的手套箱中，1 mol% 的 BF 3 ·Et 2 O有效地催化了武装和解除武装供体的糖基化。我们的发现与传统的 BF 3 ·Et 2 O 介导的糖基化形成鲜明对比，后者需要过量的路易斯酸和添加剂。机理研究表明，由原位生成的 HF 和玻璃容器反应形成的化学物质参与了催化循环。