(3S,8aS)-3-[[2-(2-甲基丁-3-烯-2-基)-1H-吲哚-3-基]甲基]-2,3,6,7,8,8a-六氢吡咯并[2,1-f]吡嗪-1,4-二酮 | 34610-68-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 中文名称: (3S,8aS)-3-[[2-(2-甲基丁-3-烯-2-基)-1H-吲哚-3-基]甲基]-2,3,6,7,8,8a-六氢吡咯并[2,1-f]吡嗪-1,4-二酮
• 英文名称: deoxybrevianamide E
• 英文别名: (3S,8aS)-3-[[2-(2-methylbut-3-en-2-yl)-1H-indol-3-yl]methyl]-2,3,6,7,8,8a-hexahydropyrrolo[1,2-a]pyrazine-1,4-dione
• CAS: 34610-68-9
• 化学式: C₂₁H₂₅N₃O₂
• 分子量: 351.448
• InChiKey: KUGNSEAHJVSMAJ-IRXDYDNUSA-N

物化性质

• 溶解度：
  DMF：可溶； DMSO：可溶；乙醇：可溶；甲醇：可溶

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.5
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.43
• 拓扑面积：
  65.2
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  2

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (3S,8aS)-3-[[2-(2-甲基丁-3-烯-2-基)-1H-吲哚-3-基]甲基]-2,3,6,7,8,8a-六氢吡咯并[2,1-f]吡嗪-1,4-二酮 在 glucose-6-phosphate 、 还原型辅酶II(NADPH)四钠盐 作用下， 以 aq. buffer 为溶剂， 以31 %的产率得到brevianamide E
  参考文献：
  名称：

  底物许可二酮哌嗪反向异戊二烯基转移酶 NotF 的数据科学驱动分析：在蛋白质工程和 (−)-Eurotiumin A 的级联生物催化合成中的应用

  摘要：

  异戊二烯转移是一种早期碳氢键 (C–H) 功能化，普遍存在于多种具有生物活性的细菌、真菌、植物和后生动物二酮哌嗪 (DKP) 生物碱的生物合成中。为了开发异戊二烯化 DKP 吲哚生物碱生物催化构建的统一策略，我们试图鉴定和表征底物允许的 C2 反向异戊二烯基转移酶 (PT)。作为细胞毒性诺托酰胺代谢物生物合成中的第一个剪裁事件，PT NotF 催化短维胺 F 的 C2 反向异戊烯转移。解析 NotF 的晶体结构（与天然底物和异戊烯供体模拟物二甲基烯丙基 S-硫代二磷酸 (DMSPP) 形成复合物）揭示了一个大的，暴露于溶剂的活性位点，提示 NotF 可能具有非常广泛的底物范围。为了评估 NotF 的底物选择性，我们合成了一组 30 种空间和电子分化的色氨酸 DKP，其中大部分在合成有用的转化（2 至 >99%）中被 NotF 选择性异戊二烯化。该底物库的定量表示和描述性统计模型的开发提供了对

  DOI：

  10.1021/jacs.2c06631
• 作为产物：
  描述：

  Prenyl-9-BBN 在 次氯酸叔丁酯 、 氨 、 双(2-氧代-3-恶唑烷基)次磷酰氯 、 一水合肼 、 三乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 乙醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 93.5h， 生成 (3S,8aS)-3-[[2-(2-甲基丁-3-烯-2-基)-1H-吲哚-3-基]甲基]-2,3,6,7,8,8a-六氢吡咯并[2,1-f]吡嗪-1,4-二酮
  参考文献：
  名称：

  Gypsetin、Deoxybrevianamide E、Brevianamide E 和 Tryprostatin B 的全合成：2,3-二取代吲哚的新结构

  摘要：

  描述了一种简洁有效的酰基辅酶 A：胆固醇酰基转移酶抑制剂 gypsetin (1) 的全合成。该路线的特点是将反向异戊二烯基团引入 N-邻苯二甲酰基保护的色氨酸的 C2 位的直接方法 (11)。gypsetin 的全合成是通过二甲基二环氧乙烷促进的预制二酮哌嗪的双氧化环化反应完成的 (19)。还描述了遵循类似程序的脱氧短酰胺 E (24) 和短酰胺 E (25) 的全合成。亲核试剂与原位生成的 3-氯吲哚啉的反应提供了从 3-取代前体生成 2,3-二取代吲哚的途径。提供了此类反应的范围和限制的指示。胰前列腺素 B (41) 的全合成，完成了衍生自 l-色氨酸衍生物（在吲哚的 α 位置带有异戊二烯基）和 l-脯氨酸的二酮哌嗪。关键步骤涉及引入异戊二烯功能......

  DOI：

  10.1021/ja9925249

文献信息

• Complete Decoration of the Indolyl Residue in <i>cyclo</i>-<scp>l</scp>-Trp-<scp>l</scp>-Trp with Geranyl Moieties by Using Engineered Dimethylallyl Transferases
  作者：Ge Liao、Peter Mai、Jie Fan、Georg Zocher、Thilo Stehle、Shu-Ming Li

  DOI：10.1021/acs.orglett.8b03124

  日期：2018.11.16

  for prenyl donor selectivity in six dimethylallyl transferases significantly increased their activities toward geranyl diphosphate. Forty-two geranylated derivatives were obtained from 15 cyclic dipeptides by using the engineered enzymes. Taking cyclo-l-Trp-l-Trp as an example, the geranyl moiety can be attached to all seven possible positions of the indole nucleus. This study demonstrates a convenient

  在六个二甲基烯丙基转移酶中异戊二烯供体选择性的守门残基突变显着增加了它们对香叶基二磷酸的活性。使用工程化酶从15个环状二肽中获得了42个Geranylated衍生物。以环-1-Trp-1-Trp为例，香叶基部分可以连接到吲哚核的所有七个可能位置。这项研究表明通过基于结构的可利用的二甲基烯丙基转移酶工程来增加香叶酰化产物的结构多样性的简便方法。
• Studies on indolic mould metabolites. Total synthesis of l-prolyl-2-methyltryptophan anhydride and deoxybrevianamide e
  作者：R. Ritchie、J.E. Saxton

  DOI：10.1016/0040-4020(81)85025-9

  日期：1981.1

  Syntheses of l - prolyl - 2 - methyl - l - tryptophan anhydride, l -prolyl - 2 - methyl - d - tryptophan anhydride, deoxybrevianamide E, and l - prolyl - 2 - (1,1 - dimethylallyl) - d- tryptophan anhydride are described. A route for the conversion of deoxybrevianamide E into brevianamide E has also been examined.

  1-prolyl-2-甲基-1-色氨酸酐，1-prolyl-2-甲基-d-色氨酸酐，脱氧布雷维酰胺E和1-prolyl-2-（1,1-二甲基烯丙基）-d-色氨酸酐的合成被描述。还研究了将脱氧布雷维酰胺E转化为布雷维酰胺E的途径。
• Genome-Based Characterization of Two Prenylation Steps in the Assembly of the Stephacidin and Notoamide Anticancer Agents in a Marine-Derived <i>Aspergillus</i> sp.
  作者：Yousong Ding、Jeffrey R. de Wet、James Cavalcoli、Shengying Li、Thomas J. Greshock、Kenneth A. Miller、Jennifer M. Finefield、James D. Sunderhaus、Timothy J. McAfoos、Sachiko Tsukamoto、Robert M. Williams、David H. Sherman

  DOI：10.1021/ja1049302

  日期：2010.9.15

  products belong to a group of prenylated indole alkaloids containing a core bicyclo[2.2.2]diazaoctane ring system. These bioactive fungal secondary metabolites have a range of unusual structural and stereochemical features but their biosynthesis has remained uncharacterized. Herein, we report the first biosynthetic gene cluster for this class of fungal alkaloids based on whole genome sequencing of a marine-derived

  Stephacidin 和 notoamide 天然产物属于一组含有核心双环 [2.2.2] 重氮辛烷环系统的异戊二烯化吲哚生物碱。这些具有生物活性的真菌次级代谢物具有一系列不寻常的结构和立体化学特征，但它们的生物合成仍未得到表征。在此，我们报告了基于海洋衍生曲霉的全基因组测序的此类真菌生物碱的第一个生物合成基因簇。详细表征了催化正常和反向异戊二烯转移反应的两种中央途径酶。我们的研究结果确立了异戊二烯化吲哚生物碱结构的早期步骤，并提出了一种合成千金藤碱和诺托酰胺代谢物的方案。
• Studies on the syntheses of heterocyclic compounds. Part 876. The chiral total synthesis of brevianamide E and deoxybrevianamide E
  作者：Tetsuji Kametani、Naoaki Kanaya、Masataka Ihara

  DOI：10.1039/p19810000959

  日期：——

  The chiral total synthesis of brevianamide E (1) and deoxybrevianamide E (2) starting from L-proline is described. Condensation of 2-(1,1-dimethylallyl)-3-dimethylaminomethylindole (3) and (–)-methyl 1,4-dioxoperhydropyrrolo[1,2-a]pyrazine-3-carboxylate (7) derived from L-proline followed by demethoxycarbonylation gave (–)-deoxybrevianamide E (2) and its epimer (10). Photo-oxygenations of (2) and (10)

  描述了从L-脯氨酸开始的手性总的brevianamide E（1）和deoxybrevianamide E（2）的合成。衍生自L-脯氨酸的2-（1,1-二甲基烯丙基）-3-二甲基氨基甲基吲哚（3）和（–）-甲基1,4-二氧杂氢吡咯并[1,2 - a ]吡嗪-3-羧酸酯（7）的缩合反应通过脱甲氧基羰基化得到（-）-脱氧短戊酰胺E（2）及其差向异构体（10）。（2）和（10）的光氧合形成了（–）-brevianamide E（14）及其三个立体异构体（15），（16）和（17）。通过该合成将布雷维酰胺E（14）的绝对立体化学确定为4a S，5a R，10a S，11a S。
• Study on the biosynthesis of the notoamides: pinacol-type rearrangement of the isoprenyl unit in deoxybrevianamide E and 6-hydroxydeoxybrevianamide E
  作者：Hikaru Kato、Yuichi Nakamura、Jennifer M. Finefield、Hideharu Umaoka、Takashi Nakahara、Robert M. Williams、Sachiko Tsukamoto

  DOI：10.1016/j.tetlet.2011.10.065

  日期：2011.12

  reverse-prenylated indole alkaloids, deoxybrevianamide E and 6-hydroxydeoxybrevianamide E, are proposed as biosynthetic precursors for advanced metabolites isolated from the marine-derived Aspergillus sp. In order to uncover the role of the alkaloids in the biosynthetic pathway, the feeding experiments of the [13C]2–[15N]-labeled deoxybrevianamide E and 6-hydroxydeoxybrevianamide E were performed to afford the

  两种反向异戊二烯化吲哚生物碱 deoxybrevianamide E 和 6-hydroxydeoxybrevianamide E 被提议作为从海洋来源的曲霉属中分离的高级代谢物的生物合成前体。为了揭示生物碱在生物合成途径中的作用，进行了 [ 13 C] 2 – [ 15 N] 标记的脱氧短酰胺 E 和 6-羟基脱氧短酰胺 E的饲养实验，以提供通过氧化产生的代谢物和异戊二烯基单元的连续频哪醇型重排。