4-(azidoacetamido)phenyl 2,3,4,6-tetra-O-acetyl-β-D-galactopyranoside | 1381777-82-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 4-(azidoacetamido)phenyl 2,3,4,6-tetra-O-acetyl-β-D-galactopyranoside
• 英文别名: p-(α-azidoacetamido)phenyl 2,3,4,6-tetra-O-acetyl-β-D-galactopyranoside；[(2R,3S,4S,5R,6S)-3,4,5-triacetyloxy-6-[4-[(2-azidoacetyl)amino]phenoxy]oxan-2-yl]methyl acetate
• CAS: 1381777-82-7
• 化学式: C₂₂H₂₆N₄O₁₁
• 分子量: 522.469
• InChiKey: BDEZYSNCITZRBG-WHCFWRGISA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.7
• 重原子数：
  37
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  167
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  13

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-(azidoacetamido)phenyl 2,3,4,6-tetra-O-acetyl-β-D-galactopyranoside 在 copper(l) iodide 、 水 、 三乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 0.5h， 生成 4-[(1,2,3-triazol-4-hydroxymethyl-1-yl)-acetamido]phenyl β-D-galactopyranoside
  参考文献：
  名称：

  多价凝集素与碳水化合物相互作用的最佳糖簇的合理设计与合成：连接臂的影响

  摘要：

  多价糖簇的设计需要将通过连接臂功能化的生物学相关的碳水化合物表位缀合到多价核心支架上。结合酰胺部分和/或苯环的三种结构修饰的三乙二醇类似物的数克级合成，可方便地获得一系列具有不同水溶性和刚性的碳水化合物探针。通过构象分析进行灵活性的评估和优选构象的确定。叠氮基官能化碳水化合物与四炔丙基化核心支架的偶联，通过Cu I高产量提供了一个包含18个四价糖簇的文库催化的叠氮化物-炔烃环加成反应（CuAAC）。评估了这些化合物与PA‐IL（来自机会性病原体铜绿假单胞菌的LecA凝集素）结合的能力。通过抑制血凝测定（HIA），酶联凝集素测定（ELLA），表面等离振子共振（SPR）和等温滴定微量量热法（ITC）进行生化评估，发现其中一种单价探针的亲和力得到了改善和前所未有的提高（K d = 5.8 μ中号），并且还为一个数字，提供这种四聚体凝集素几个新的配位体纳摩尔四价化合物。

  DOI：

  10.1002/chem.201200010
• 作为产物：
  描述：

  4-硝基苯基-D-吡喃葡糖苷 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 sodium azide 、 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 、 四丁基碘化铵 、 三乙胺 作用下， 以 吡啶 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 50.0h， 生成 4-(azidoacetamido)phenyl 2,3,4,6-tetra-O-acetyl-β-D-galactopyranoside
  参考文献：
  名称：

  多价凝集素与碳水化合物相互作用的最佳糖簇的合理设计与合成：连接臂的影响

  摘要：

  多价糖簇的设计需要将通过连接臂功能化的生物学相关的碳水化合物表位缀合到多价核心支架上。结合酰胺部分和/或苯环的三种结构修饰的三乙二醇类似物的数克级合成，可方便地获得一系列具有不同水溶性和刚性的碳水化合物探针。通过构象分析进行灵活性的评估和优选构象的确定。叠氮基官能化碳水化合物与四炔丙基化核心支架的偶联，通过Cu I高产量提供了一个包含18个四价糖簇的文库催化的叠氮化物-炔烃环加成反应（CuAAC）。评估了这些化合物与PA‐IL（来自机会性病原体铜绿假单胞菌的LecA凝集素）结合的能力。通过抑制血凝测定（HIA），酶联凝集素测定（ELLA），表面等离振子共振（SPR）和等温滴定微量量热法（ITC）进行生化评估，发现其中一种单价探针的亲和力得到了改善和前所未有的提高（K d = 5.8 μ中号），并且还为一个数字，提供这种四聚体凝集素几个新的配位体纳摩尔四价化合物。

  DOI：

  10.1002/chem.201200010

文献信息

• Development and optimization of a competitive binding assay for the galactophilic low affinity lectin LecA from Pseudomonas aeruginosa
  作者：Ines Joachim、Sebastian Rikker、Dirk Hauck、Daniela Ponader、Sophia Boden、Roman Sommer、Laura Hartmann、Alexander Titz

  DOI：10.1039/c6ob01313a

  日期：——

  chronic infections. The bacterial protein LecA, a C-type lectin, is a virulence factor and an integral component for biofilm formation. Inhibition of LecA with its carbohydrate ligands results in reduced biofilm mass, a potential Achilles heel for treatment. Here, we report the development and optimization of a fluorescence polarization-based competitive binding assay with LecA for application in screening

  革兰氏阴性菌铜绿假单胞菌的感染导致免疫受损的患者和囊性纤维化患者的高死亡率。病原体可以从浮游生物转变为生物膜，从而保护自己免受抗生素治疗并宿主免疫防御以建立慢性感染。细菌蛋白LecA，一种C型凝集素，是一种致病因子，是生物膜形成不可或缺的组成部分。LecA及其碳水化合物配体的抑制作用导致生物膜质量降低，这可能是治疗的潜在致命弱点。在这里，我们报告与LecA的荧光偏振为基础的竞争性结合测定法的发展和优化，用于筛选潜在的抑制剂。由于D的亲和力低对于LecA-半乳糖，优化荧光配体以减少测定中的蛋白质消耗。使用一组已知的LecA抑制剂验证了该测定，并获得了与已知K d值高度吻合的IC 50值。最后，我们采用了优化的检测方法来筛选合成的硫代半乳糖苷和天然血型抗原的集合，并报告它们的结构-活性关系。此外，我们评估了LecA的多价荧光测定探针，并报告了其在抑制测定中的适用性。
• [EN] GLYCOCLUSTERS AND THEIR PHARMACEUTICAL USE AS ANTIBACTERIALS<br/>[FR] GLYCOCLUSTERS ET LEUR UTILISATION PHARMACEUTIQUE COMME ANTIBACTÉRIENS
  申请人：CENTRE NAT RECH SCIENT

  公开号：WO2015040209A1

  公开（公告）日：2015-03-26

  A molecule responding to formula (I)of the glycocluster type with galactose residues at their extremities. Simple and efficient methods for the preparation of these compounds. Medical use of compounds (I) as inhibitors of infections by Pseudomonas aeruginosa, more specifically as inhibitors of Pseudomonas aeruginosa's virulence.

  一种分子对具有半乳糖残基的糖团型式（I）做出响应。这些化合物的制备有简单高效的方法。将化合物（I）用作铜绿假单胞菌感染的抑制剂，更具体地说是铜绿假单胞菌毒力的抑制剂。
• GLYCOMIMETIC COMPOUNDS AS ANTI-INFECTIOUS AGAINST PATHOGENS LECTINS
  申请人：Imberty Anne

  公开号：US20130252910A1

  公开（公告）日：2013-09-26

  The present invention relates to a calixarene-based glycosylated compound (I) having the formula: (I) wherein D is independently selected in the group comprising a —CH 2 -group, an oxygen atom, a sulphur atom, a sulfinyl group or a sulfonyl group, E is independently selected in the group comprising a hydrogen, an alkyl having from 1 to 10 carbon atoms, an aryl having from 6 to 20 carbon atoms, a nitrogen dioxide group, an azide group, an amino group, a guanidinium group, a halogen atom, a —CH 2 R group wherein R is a hydroxyl, a halogen, an amino group, a N(alkyl) 2 group, a NH(alkyl) group, or E represents a —CO—R′ wherein R′ is a hydrogen atom, a hydroxyl group or an amino, B represents a A-C group wherein A is independently selected in the group comprising an oxygen atom, a sulfur atom, a NH group or a (CH 2 ) i group, i being an integer from 1 to 10, C is independently selected in the group comprising a hydrogen, an alkyl, an alkenyl, an alkynyl, or C is a group of formula (II). The present invention also relates to a pharmaceutical composition characterized in that it comprises the said calixarene-based glycosylated compound (I), in combination with pharmaceutically acceptable carriers or diluents. The present invention also relates to the use of the said calixarene-based glycosylated compound (I) or the said pharmaceutical composition, for the manufacture of a drug intended to prevent or treat bacterial infections from pathogens that use lectins in the first steps of infection.

  本发明涉及一种基于杯芳烃的糖基化化合物（I），其化学式如下：（I）其中D在以下组中独立选择：—CH2基团、氧原子、硫原子、亚砜基或磺酰基；E在以下组中独立选择：氢、具有1至10个碳原子的烷基、具有6至20个碳原子的芳基、亚硝基团、叠氮基团、氨基、胍胺基、卤原子、— R基团（其中R是羟基、卤原子、氨基、N（烷基）2基团、NH（烷基）基团）或E代表—CO—R'（其中R'是氢原子、羟基或氨基），B代表A-C基团（其中A在以下组中独立选择：氧原子、硫原子、NH基团或（ ）i基团，i为1至10的整数），C在以下组中独立选择：氢、烷基、烯基、炔基，或C是化学式（II）的基团。本发明还涉及一种药物组合物，其特征在于它包括所述的基于杯芳烃的糖基化化合物（I），与药学上可接受的载体或稀释剂结合。本发明还涉及所述的基于杯芳烃的糖基化化合物（I）或所述的药物组合物的用途，用于制造用于预防或治疗利用凝集素进行感染起始阶段的病原体引起的细菌感染的药物。
• [EN] GLYCOMIMETIC COMPOUNDS AS ANTI-INFECTIOUS AGAINST PATHOGENS LECTINS<br/>[FR] COMPOSÉS GLYCOMIMÉTIQUES EN TANT QU'AGENTS ANTI-INFECTIEUX CONTRE DES LECTINES PATHOGÈNES
  申请人：CENTRE NAT RECH SCIENT

  公开号：WO2012076934A1

  公开（公告）日：2012-06-14

  The present invention relates to a calixarene-based glycosylated compound (I) having the formula : (I) wherein D is independently selected in the group comprising a –CH2 –group, an oxygen atom, a sulphur atom, a sulfinyl group or a sulfonyl group, E is independently selected in the group comprising a hydrogen, an alkyl having from 1 to 10 carbon atoms, an aryl having from 6 to 20 carbon atoms, a nitrogen dioxide group, an azide group, an amino group, a guanidinium group,a halogen atom, a –CH2 R group wherein R is a hydroxyl, a halogen, an amino group, a N(alkyl)2 group, a NH(alkyl) group, or E represents a –CO-R' wherein R' is a hydrogen atom, a hydroxyl group or an amino, B represents a A–C group wherein A is independently selected in the group comprising an oxygen atom, a sulfur atom, a NH group or a (CH2 )i group, i being an integer from 1 to 10, C is independently selected in the group comprising a hydrogen, an alkyl, an alkenyl, an alkynyl, or C is a group of formula (II). The present invention also relates to a pharmaceutical composition characterized in that it comprises the said calixarene-based glycosylated compound (I), in combination with pharmaceutically acceptable carriers or diluents. The present invention also relates to the use of the said calixarene-based glycosylated compound (I) or the said pharmaceutical composition, for the manufacture of a drug intended to prevent or treat bacterial infections from pathogens that use lectins in the first steps of infection.

  本发明涉及一种基于杯芳烃的糖基化化合物（I），其化学式为：（I），其中D在以下基团中独立选择：-CH2-基团、氧原子、硫原子、亚砜基团或磺基团，E在以下基团中独立选择：氢、碳原子数为1至10的烷基、碳原子数为6至20的芳基、二氧化氮基团、叠氮基团、氨基团、胍基团、卤素原子、- R基团，其中R为羟基、卤素、氨基、N（烷基）2基团、NH（烷基）基团，或E表示-CO-R'，其中R'为氢原子、羟基或氨基，B表示A-C基团，其中A在以下基团中独立选择：氧原子、硫原子、NH基团或( )i基团，i为1至10的整数，C在以下基团中独立选择：氢、烷基、烯基、炔基，或C为下式的基团（II）。本发明还涉及一种药物组合物，其特征在于它包括所述基于杯芳烃的糖基化化合物（I），结合具有药用接受的载体或稀释剂。本发明还涉及所述基于杯芳烃的糖基化化合物（I）或所述药物组合物的用途，用于制造预防或治疗利用凝集素在感染的最初阶段的病原体引起的细菌感染的药物。
• Synthesis of Multivalent Carbohydrate-Centered Glycoclusters as Nanomolar Ligands of the Bacterial Lectin LecA from <i>Pseudomonas aeruginosa</i>
  作者：Marina L. Gening、Denis V. Titov、Samy Cecioni、Aymeric Audfray、Alexey G. Gerbst、Yury E. Tsvetkov、Vadim B. Krylov、Anne Imberty、Nikolay E. Nifantiev、Sébastien Vidal

  DOI：10.1002/chem.201300135

  日期：2013.7.8

  the bacterial lectin LecA with various valencies (from 2 to 4) and linkers. Evaluation of their binding properties towards LecA has been performed by a combination of hemagglutination inhibition assays (HIA), enzyme‐linked lectin assays (ELLA), and isothermal titration microcalorimetry (ITC). Divalent ligands displayed dissociation constants in the sub‐micromolar range and tetravalent ligands displayed

  基于环状寡聚（1→6）-β- D的15个糖簇的家族葡糖胺核心被设计为细菌凝集素LecA的潜在抑制剂，具有不同的化合价（从2到4）和连接子。通过结合血凝抑制试验（HIA），酶联凝集素试验（ELLA）和等温滴定微量量热法（ITC）评估了它们与LecA的结合特性。二价配体在亚微摩尔范围内显示解离常数，四价配体对该凝集素显示低纳摩尔亲和力。链接器的影响也可以得到证明；芳香族部分是与凝集素结合的最佳支架。然后将体外观察到的亲和力与分子模型相关联，以合理化这些糖簇与细菌凝集素的可能结合模式。