脱氧核苷5'-
三磷酸酯是用3-oxo-2 H-
哒嗪-6-基(Pz O)(一种缺少2-酮基的尿
嘧啶类似物)作为核碱基合成的。理论分析和杂交实验表明,Pz O识别
腺嘌呤(A)以形成Watson-Crick碱基对。使用核苷5'-
三磷酸和Klenow片段的引物延伸反应表明,通过识别模板链中的A,合成核苷5'-
三磷酸被掺入了引物的3'端。此外,以Pz O为碱基的3'-核苷酸残基对Klenow片段exo +的3'-核酸外切酶活性有抗性。带有Pz O的底漆3'端的碱基可以在随后的链延长中起作用。Pz O的这些特性归因于在糖苷键邻位的环内氮原子的存在,推测该环内氮原子与
DNA聚合酶的
氨基酸残基形成H键,可有效识别Pz O的3'端。用于引物延伸的引物。这些结果为通过结合糖苷键邻位的氮原子和沃森-克里克氢键的碱基配对位点提供了设计新核碱基的基础。