(3aR,5S,6R,6aR)-2,2-dimethyl-6-phenylmethoxy-6-prop-2-enyl-5,6a-dihydro-3aH-furo[2,3-d][1,3]dioxole-5-carbaldehyde | 136152-95-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: (3aR,5S,6R,6aR)-2,2-dimethyl-6-phenylmethoxy-6-prop-2-enyl-5,6a-dihydro-3aH-furo[2,3-d][1,3]dioxole-5-carbaldehyde
• CAS: 136152-95-9
• 化学式: C₁₈H₂₂O₅
• 分子量: 318.37
• InChiKey: HTLORUWAKQHQJW-KYHPRHEASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.2
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  54
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (3aR,5S,6R,6aR)-2,2-dimethyl-6-phenylmethoxy-6-prop-2-enyl-5,6a-dihydro-3aH-furo[2,3-d][1,3]dioxole-5-carbaldehyde 在 四氧化锇 4-二甲氨基吡啶 、 sodium hydroxide 、 sodium periodate 、 水 、 sodium hydride 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 叔丁醇 为溶剂， 反应 40.5h， 生成
  参考文献：
  名称：

  具有典型S型糖构象的反式-3'，4'-桥联核酸的合成及性能

  摘要：

  具有构象受限的糖部分的核苷类似物的合成是非常令人感兴趣的。本研究描述了在4,2-二氧杂双环[4.3.0]壬烷骨架和C2'位置有甲氧基的BNA（桥联核酸）单体1和2的合成。构象分析表明这些单体的糖部分被限制在典型的S型构象中。难以合成核糖型单体1的亚磷酰胺衍生物，而成功地制备了阿拉伯糖型单体2的亚磷酰胺并掺入到寡脱氧核苷酸（ODN）中。所获得的含有2个ODN衍生物的杂交能力通过熔融温度（T m）测量来评估具有互补链的链。结果，尽管双链体的稳定性低于相应的天然DNA / DNA或DNA / RNA双链体的稳定性，但ODN衍生物与DNA和RNA的互补序列互补。

  DOI：

  10.1021/jo051187l
• 作为产物：
  描述：

  在 sodium periodate 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 为溶剂， 反应 0.75h， 生成 (3aR,5S,6R,6aR)-2,2-dimethyl-6-phenylmethoxy-6-prop-2-enyl-5,6a-dihydro-3aH-furo[2,3-d][1,3]dioxole-5-carbaldehyde
  参考文献：
  名称：

  NUCLEOSIDE ANALOGUES WHOSE SUGAR MOIETIES ARE BOUND IN S-FORM AND OLIGONUCLEOTIDE DERIVATIVES COMPRISING NUCLEOTIDE ANALOGUES THEREOF

  摘要：

  以下通用式（1）及其盐的化合物：其中A代表具有1至2个碳原子的烷基基团等；B代表可能具有取代基的芳香杂环基团等；R1和R2分别代表氢原子，用于核酸合成的羟基保护基，磷酸基，或-P（R4）R5 [其中R4和R5相同或不同，每个代表羟基，用于核酸合成的羟基保护基，巯基，用于核酸合成的巯基保护基等]；R3代表氢原子，卤素原子，羟基，用于核酸合成的羟基保护基等。这些化合物可用于生产用于反义方法、抗基因方法等的寡核苷酸类似物，以及生产它们的中间体。

  公开号：

  EP1486504A1

文献信息

• Screening the Structural Space of Bicyclo-DNA: Synthesis and Thermal Melting Properties of bc^4,3-DNA
  作者：Andrea Stauffiger、Christian J. Leumann

  DOI：10.1002/ejoc.200801034

  日期：2009.3

  In attempts to screen the structural and functional properties of bicyclo-DNA, in which the ribose C(3′) and C(5′) centers are integrated into an additional five-membered carbocyclic ring ([3.3.0]-series) we have now synthesized and investigated a ring enlarged analogue in which C(5′) and C(3′) are spanned by a six-membered carbocyclic ring ([4.3.0]-series). The synthesis of the corresponding bc4,3-T

  为了筛选双环 DNA 的结构和功能特性，其中核糖 C(3') 和 C(5') 中心被整合到一个额外的五元碳环（[3.3.0] 系列）中，我们现在已经合成并研究了一种环扩大类似物，其中 C(5') 和 C(3') 被一个六元碳环（[4.3.0] 系列）跨越。从已知的烯丙基呋喃糖 1 开始，相应的 bc4,3-T 核苷 13 的合成分 12 个步骤进行。其苄基保护的前体 12 的 X 射线分析显示环己烷环采用椅子构象，O(5' ) 轴向位置的取代基。呋喃糖部分明显显示S型糖褶。该核苷被转化为相应的亚磷酰胺结构单元 15 并通过标准亚磷酰胺化学掺入寡脱氧核苷酸中。发现单或双掺入 bc4,3-T 残基并与互补 DNA 或 RNA 配对的寡核苷酸的热稳定性与未修饰的寡核苷酸（每次修饰 –2.3 至 +0.7 °C）和具有已知的 bc-T 修饰。我们还发现 bc4,3-T 系列中的错配辨别力与自然系列的错配辨别力相似，但与已知的
• Synthesis of Fused Cyclic Systems Containing Medium-Sized Rings through Tandem ROM-RCM of Norbornene Derivatives Embedded in a Carbohydrate Template
  作者：Chanchal K. Malik、Ram Naresh Yadav、Michael G. B. Drew、Subrata Ghosh

  DOI：10.1021/jo802077t

  日期：2009.3.6

  under Lewis acid catalysis producing the diastereoisomers 11a−d exclusively. The reversal of facial selectivity from an uncatalyzed reaction to a catalyzed one is unprecedented. The observed stereochemical dichotomy is attributed to rotation of the enone moiety along the σ bond linking the sugar moiety during formation of the chelate 13. This makes the Re-face of the enone moiety in 4a−d unhindered

  已经开发了合成包含中等大小环（7-9）的稠合环状系统的通用方法。关键步骤涉及与具有环戊二烯的呋喃糖连接的亲二烯体4a - d的非对映体选择性Diels-Alder反应，以及所得降冰片烯衍生物10a - d和11a - d的开环（ROM）-闭环置换（RCM）。在没有催化剂的情况下，亲二烯体4a - d与环戊二烯的狄尔斯-阿尔德反应是通过向不受阻碍的Si中添加二烯而产生的主要产物10a - d-脸。这些亲二烯体的Diels-Alder反应最有趣和新的方面是Re- face的可及性，该表面在路易斯酸催化下被烯基链封闭，仅产生非对映异构体11a - d。从未催化反应到催化反应的面部选择性逆转是史无前例的。观察到的立体化学二分法归因于在螯合物13形成期间烯酮部分沿着连接糖部分的σ键旋转。这使得再在烯酮部分的-面4A - ð畅通无阻。碳环类似物的狄尔斯-阿尔德反应15在路易斯酸催化下，产生了加合物16
• A ring-closing metathesis based synthesis of bicyclic nucleosides locked in S-type conformations by hydroxyl functionalised 3′,4′-trans linkages
  作者：Morten Freitag、Helena Thomasen、Nanna K Christensen、Michael Petersen、Poul Nielsen

  DOI：10.1016/j.tet.2004.03.019

  日期：2004.4

  introduced in this nucleoside reveals a large potential for further derivatisation, and as the first example, a stereoselective dihydroxylation followed by deprotection afforded a multihydroxylated bicyclic nucleoside. The configuration and conformational behaviour was determined by NMR spectroscopy and ab initio calculations, and both this bicyclic nucleoside and its unsaturated analogue were found to

  [4.3.0]双环核苷，含有不饱和羟基化的3'，4'-反式链接已被有效地合成。因此，以双丙酮-d-葡萄糖为起始原料，用于烯丙基的立体选择性格氏反应，核碱基偶联以及随后的闭环复分解（RCM）反应被用作关键反应。引入该核苷中的环己烯部分显示出进一步衍生化的巨大潜力，并且作为第一个实例，立体选择性二羟基化然后脱保护得到了多羟基化的双环核苷。通过NMR光谱和从头算来确定构型和构象行为，并且发现该双环核苷及其不饱和类似物都强烈地受S-型构象的限制。
• Application of Intramolecular Nitrone Cycloaddition Reaction:  Synthesis of Chiral Aminocarbocycles and Carbocyclic Nucleosides from Carbohydrate Precursors
  作者：Narayan C. Bar、Atanu Roy、Basudeb Achari、Sukhendu B. Mandal

  DOI：10.1021/jo971342z

  日期：1997.12.1
• Synthesis and Properties of <i>Trans</i>-3‘,4‘-Bridged Nucleic Acids Having Typical S-type Sugar Conformation
  作者：Mitsuaki Sekiguchi、Satoshi Obika、Yasuki Harada、Tomohisa Osaki、Roongjang Somjing、Yasunori Mitsuoka、Nao Shibata、Miyuki Masaki、Takeshi Imanishi

  DOI：10.1021/jo051187l

  日期：2006.2.1

  nucleoside analogues with a conformationally restricted sugar moiety is of great interest. The present research describes the synthesis of BNA (bridged nucleic acid) monomers 1 and 2 bearing a 4,7-dioxabicyclo[4.3.0]nonane skeleton and a methoxy group at the C2‘ position. Conformational analysis showed that the sugar moiety of these monomers is restricted in a typical S-type conformation. It was difficult

  具有构象受限的糖部分的核苷类似物的合成是非常令人感兴趣的。本研究描述了在4,2-二氧杂双环[4.3.0]壬烷骨架和C2'位置有甲氧基的BNA（桥联核酸）单体1和2的合成。构象分析表明这些单体的糖部分被限制在典型的S型构象中。难以合成核糖型单体1的亚磷酰胺衍生物，而成功地制备了阿拉伯糖型单体2的亚磷酰胺并掺入到寡脱氧核苷酸（ODN）中。所获得的含有2个ODN衍生物的杂交能力通过熔融温度（T m）测量来评估具有互补链的链。结果，尽管双链体的稳定性低于相应的天然DNA / DNA或DNA / RNA双链体的稳定性，但ODN衍生物与DNA和RNA的互补序列互补。