N¹-((1S,2S)-2-azido-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl)-N²-(4-chloro-3-fluorophenyl)oxalamide | 1374035-57-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N¹-((1S,2S)-2-azido-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl)-N²-(4-chloro-3-fluorophenyl)oxalamide
• 英文别名: N1-(4-chloro-3-fluorophenyl)-N2-[(1S,2S)-2-azido-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl]oxalamide；N-[(1S,2S)-2-azido-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl]-N'-(4-chloro-3-fluorophenyl)oxamide
• CAS: 1374035-57-0
• 化学式: C₁₇H₁₃ClFN₅O₂
• 分子量: 373.774
• InChiKey: AHFHZEDKCHODAX-GJZGRUSLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.18
• 拓扑面积：
  72.6
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N¹-((1S,2S)-2-azido-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl)-N²-(4-chloro-3-fluorophenyl)oxalamide 在 Pb-poisoned 5% Pd-CaCO3 、 氢气 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 2.0h， 以87%的产率得到N¹-((1S,2S)-2-amino-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl)-N²-(4-chloro-3-fluorophenyl)oxalamide
  参考文献：
  名称：

  双热点小分子 HIV-1 进入抑制剂的基于结构的设计、合成和表征

  摘要：

  HIV-1 的细胞感染始于病毒包膜糖蛋白 gp120 和细胞受体蛋白 CD4 之间的结合事件。CD4-gp120 界面由两个热点控制：由 Phe43 CD4封盖的疏水 gp120 腔和残基 Arg59 CD4和 Asp368 gp120之间的静电相互作用。CD4 模拟小分子 NBD-556 ( 1 ) 结合在 gp120 腔内；然而，1和相关的同源物表现出有限的病毒中和广度。在此，我们报告了 gp120 与同时结合两个结合热点的小分子复合物的设计、合成、表征和 X 射线结构。这些化合物特异性地抑制 42 种二级进化枝 B 和 C 病毒的病毒感染，并被证明是进入 CD4 阴性细胞的拮抗剂。因此，双热点设计既提供了一种增强 HIV-1 进入抑制剂的中和效力的方法，又提供了一种抑制 CD4-gp120 蛋白质-蛋白质相互作用的新型结构范式。

  DOI：

  10.1021/jm300265j
• 作为产物：
  描述：

  (1S,2R)-(-)-1-氨基-2-茚醇 在 4-二甲氨基吡啶 、 sodium azide 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醇 、 二甲基亚砜 、 1,2-二氯乙烷 为溶剂， 反应 5.5h， 生成 N¹-((1S,2S)-2-azido-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl)-N²-(4-chloro-3-fluorophenyl)oxalamide
  参考文献：
  名称：

  双热点小分子 HIV-1 进入抑制剂的基于结构的设计、合成和表征

  摘要：

  HIV-1 的细胞感染始于病毒包膜糖蛋白 gp120 和细胞受体蛋白 CD4 之间的结合事件。CD4-gp120 界面由两个热点控制：由 Phe43 CD4封盖的疏水 gp120 腔和残基 Arg59 CD4和 Asp368 gp120之间的静电相互作用。CD4 模拟小分子 NBD-556 ( 1 ) 结合在 gp120 腔内；然而，1和相关的同源物表现出有限的病毒中和广度。在此，我们报告了 gp120 与同时结合两个结合热点的小分子复合物的设计、合成、表征和 X 射线结构。这些化合物特异性地抑制 42 种二级进化枝 B 和 C 病毒的病毒感染，并被证明是进入 CD4 阴性细胞的拮抗剂。因此，双热点设计既提供了一种增强 HIV-1 进入抑制剂的中和效力的方法，又提供了一种抑制 CD4-gp120 蛋白质-蛋白质相互作用的新型结构范式。

  DOI：

  10.1021/jm300265j

文献信息

• [EN] CD4-MIMETIC INHIBITORS OF HIV-1 ENTRY AND METHODS OF USE THEREOF<br/>[FR] INHIBITEURS DE MIMÉTIQUES DU CD4 EMPÊCHANT LA PÉNÉTRATION DU VIH-1 ET LEURS MÉTHODES D'UTILISATION
  申请人：DANA FARBER CANCER INST INC

  公开号：WO2013090696A1

  公开（公告）日：2013-06-20

  Described herein are small-molecule mimics of CD4, which both enter the Phe43 cavity and target Asp368 of gpl20, the HIV-1 envelope protein. Also described herein are methods of using these compounds to inhibit the transmission or progression of HIV infection. These compounds exhibit antiviral potency greater than that of a known antiviral, NBD-556, with 100% breadth against clade B and C viruses. Importantly, the compounds do not activate HIV infection of CD4-negative, CCR5-positive cells, in contrast to NBD- 556.

  本文描述了CD4的小分子模拟物，这些模拟物既进入Phe43腔，又瞄准HIV-1包膜蛋白gpl20的Asp368。本文还描述了使用这些化合物抑制HIV感染的传播或进展的方法。这些化合物表现出优于已知抗病毒药物NBD-556的抗病毒效力，对B和C类病毒具有100%的广谱性。重要的是，与NBD-556相比，这些化合物不会激活CD4阴性、CCR5阳性细胞的HIV感染。
• CD4-MIMETIC INHIBITORS OF HIV-1 ENTRY AND METHODS OF USE THEREOF
  申请人：Dana-Farber Cancer Institute, Inc.

  公开号：US20140350113A1

  公开（公告）日：2014-11-27

  Described herein are small-molecule mimics of CD4, which both enter the Phe43 cavity and target Asp368 of gp120, the HIV-1 envelope protein. Also described herein are methods of using these compounds to inhibit the transmission or progression of HIV infection. These compounds exhibit antiviral potency greater than that of a known antiviral, NBD-556, with 100% breadth against clade B and C viruses. Importantly, the compounds do not activate HIV infection of CD4-negative, CCR5-positive cells, in contrast to NBD-556.

  本文描述了CD4的小分子模拟物，它们进入Phe43腔并靶向HIV-1包膜蛋白gp120的Asp368。本文还描述了使用这些化合物抑制HIV感染的传播或进展的方法。这些化合物表现出比已知抗病毒药物NBD-556更强的抗病毒效力，对B和C类病毒具有100％的广度。重要的是，与NBD-556相比，这些化合物不会激活CD4阴性，CCR5阳性细胞的HIV感染。
• US9403763B2
  申请人：——

  公开号：US9403763B2

  公开（公告）日：2016-08-02
• Structure-Based Design, Synthesis, and Characterization of Dual Hotspot Small-Molecule HIV-1 Entry Inhibitors
  作者：Judith M. LaLonde、Young Do Kwon、David M. Jones、Alexander W. Sun、Joel R. Courter、Takahiro Soeta、Toyoharu Kobayashi、Amy M. Princiotto、Xueling Wu、Arne Schön、Ernesto Freire、Peter D. Kwong、John R. Mascola、Joseph Sodroski、Navid Madani、Amos B. Smith

  DOI：10.1021/jm300265j

  日期：2012.5.10

  neutralization breadth. Herein, we report the design, synthesis, characterization, and X-ray structures of gp120 in complex with small molecules that simultaneously engage both binding hotspots. The compounds specifically inhibit viral infection of 42 tier 2 clades B and C viruses and are shown to be antagonists of entry into CD4-negative cells. Dual hotspot design thus provides both a means to enhance neutralization

  HIV-1 的细胞感染始于病毒包膜糖蛋白 gp120 和细胞受体蛋白 CD4 之间的结合事件。CD4-gp120 界面由两个热点控制：由 Phe43 CD4封盖的疏水 gp120 腔和残基 Arg59 CD4和 Asp368 gp120之间的静电相互作用。CD4 模拟小分子 NBD-556 ( 1 ) 结合在 gp120 腔内；然而，1和相关的同源物表现出有限的病毒中和广度。在此，我们报告了 gp120 与同时结合两个结合热点的小分子复合物的设计、合成、表征和 X 射线结构。这些化合物特异性地抑制 42 种二级进化枝 B 和 C 病毒的病毒感染，并被证明是进入 CD4 阴性细胞的拮抗剂。因此，双热点设计既提供了一种增强 HIV-1 进入抑制剂的中和效力的方法，又提供了一种抑制 CD4-gp120 蛋白质-蛋白质相互作用的新型结构范式。