4(5)-(3,5-di-O-benzyl-2′-deoxy-β-D-ribofuranosyl)-1H-imidazole

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 4(5)-(3,5-di-O-benzyl-2′-deoxy-β-D-ribofuranosyl)-1H-imidazole
• 英文别名: 5-[(2R,4S,5R)-4-phenylmethoxy-5-(phenylmethoxymethyl)oxolan-2-yl]-1H-imidazole
• 化学式: C₂₂H₂₄N₂O₃
• 分子量: 364.444
• InChiKey: CJKRJMFYPUKFBO-BHIFYINESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.7
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  56.4
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4(5)-(3,5-di-O-benzyl-2′-deoxy-β-D-ribofuranosyl)-1H-imidazole 在 三氯化硼 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.25h， 以94%的产率得到4(5)-(2-deoxy-β-ribofuranosyl)-1H-imidazole
  参考文献：
  名称：

  高效和β-立体选择性合成4（5）-（β-D-呋喃核糖基）-和4（5）-（2-脱氧核糖呋喃基）咪唑（1）。

  摘要：

  通过Mitsunobu环化反应，从2,3,5-三-O-苄基-D-核糖（5）开始，合成了4（5）-（β-D-呋喃呋喃糖基）咪唑（1）。5与双保护的咪唑的锂盐反应，得到相应的5-核糖咪唑7RS。7RS的水解得到具有未取代的咪唑的二醇异构体8R和8S的1：1混合物。使用N，N，N'，N'-四甲基偶氮二甲酰胺和Bu（3）P的混合物8RS的Mitsunobu环化以26.3的比率独家提供了苄基化的β-核呋喃呋喃糖基咪唑9beta，伴随有α-端基异构体9alpha： 1。通过乙氧基羰基衍生物10beta的X射线晶体学确定了9beta的构型。在Pd / C上进行了9beta的还原性脱苄基作用，并且从四个步骤开始从5开始获得1的合成，总产率为87％。这种合成方法扩展到4（5）-（2-deoxy-beta-D-rifurfuranosyl）imidazole（2）的合成。相应的二醇异构体14RS的1：1混合物的Mitsunobu环化以5

  DOI：

  10.1021/jo952136z
• 作为产物：
  描述：

  3,5-di-O-benzyl-2-deoxy-D-ribofuranose 在 盐酸 、 正丁基锂 、 三丁基膦 、 偶氮二甲酰胺 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 23.33h， 生成 4(5)-(3,5-di-O-benzyl-2′-deoxy-β-D-ribofuranosyl)-1H-imidazole
  参考文献：
  名称：

  高效和β-立体选择性合成4（5）-（β-D-呋喃核糖基）-和4（5）-（2-脱氧核糖呋喃基）咪唑（1）。

  摘要：

  通过Mitsunobu环化反应，从2,3,5-三-O-苄基-D-核糖（5）开始，合成了4（5）-（β-D-呋喃呋喃糖基）咪唑（1）。5与双保护的咪唑的锂盐反应，得到相应的5-核糖咪唑7RS。7RS的水解得到具有未取代的咪唑的二醇异构体8R和8S的1：1混合物。使用N，N，N'，N'-四甲基偶氮二甲酰胺和Bu（3）P的混合物8RS的Mitsunobu环化以26.3的比率独家提供了苄基化的β-核呋喃呋喃糖基咪唑9beta，伴随有α-端基异构体9alpha： 1。通过乙氧基羰基衍生物10beta的X射线晶体学确定了9beta的构型。在Pd / C上进行了9beta的还原性脱苄基作用，并且从四个步骤开始从5开始获得1的合成，总产率为87％。这种合成方法扩展到4（5）-（2-deoxy-beta-D-rifurfuranosyl）imidazole（2）的合成。相应的二醇异构体14RS的1：1混合物的Mitsunobu环化以5

  DOI：

  10.1021/jo952136z

文献信息

• Synthesis of novel C4-linked imidazole ribonucleoside phosphoramidites for probing general acid and base catalysis in ribozyme
  作者：Lisa Araki、Shinya Harusawa、Maho Yamaguchi、Sumi Yonezawa、Natsumi Taniguchi、David M.J. Lilley、Zheng-yun Zhao、Takushi Kurihara

  DOI：10.1016/j.tet.2005.09.063

  日期：2005.12

  We describe the synthesis of novel C4-linked imidazole ribonucleoside phosphoramidite (PA) 1a by which the imidazole moiety is incorporated into VS ribozyme to study its role in general acid and base catalysis. Investigation of protecting groups for the imidazole-N first indicated that pivaloyloxymethyl (POM) was adequate as an N-protecting group for the imidazole nucleoside, which could be readily

  我们描述了新型C4连接的咪唑核糖核苷亚磷酰胺（PA）1a的合成，通过该合成，咪唑部分被掺入VS核酶中，以研究其在一般酸和碱催化中的作用。对咪唑-N保护基的研究首先表明，新戊酰氧基甲基（POM）作为咪唑核苷的N-保护基是足够的，在温和的碱性条件下可以很容易地将其除去。此外，合成方法扩展到2'-脱氧-和2'- O-烯丙基核苷PA 1b和1c的合成。
• Synthesis of C4-Linked C0- and C2-Imidazole 2′-Deoxyribonucleoside Phos­phoramidites and Imidazole Base-Pairing Effects on DNA
  作者：Shinya Harusawa、Hiroki Yoneyama、Yoshihide Usami、Daisuke Yamamoto、Zheng-yun Zhao

  DOI：10.1055/s-0034-1378451

  日期：——

  The synthesis of C4-linked imidazole C-0- and C-2-2'-deoxyribonucleoside phosphoramidites (dPAs), in which the final phosphitylations are greatly improved by 4,5-dicyanoimidazole-promoted conversion, is described. The respective dPAs are successfully incorporated into the sequence of a 15-nt DNA, and the abilities of one or two imidazoles to pair with different bases are investigated through thermal melting (T-m) experiments on the resulting DNA duplexes. Furthermore, computational models of the imidazole-modified DNAs are found to be in good agreement with the results of the thermal melting experiments.
• Efficient and β-Stereoselective Synthesis of 4(5)-(β-<scp>d</scp>-Ribofuranosyl)- and 4(5)-(2-Deoxyribofuranosyl)imidazoles¹
  作者：Shinya Harusawa、Yoshihiko Murai、Hideki Moriyama、Tomonari Imazu、Hirofumi Ohishi、Ryuji Yoneda、Takushi Kurihara

  DOI：10.1021/jo952136z

  日期：1996.1.1

  A synthetic route to 4(5)-(beta-D-ribofuranosyl)imidazole (1), starting from 2,3,5-tri-O-benzyl-D-ribose (5), was developed via a Mitsunobu cyclization. Reaction of 5 with the lithium salt of bis-protected imidazole afforded the corresponding 5-ribosylimidazole 7RS. Hydrolysis of 7RS gave a 1:1 mixture of diol isomers 8R and 8S having an unsubstituted imidazole. Mitsunobu cyclization of the mixture

  通过Mitsunobu环化反应，从2,3,5-三-O-苄基-D-核糖（5）开始，合成了4（5）-（β-D-呋喃呋喃糖基）咪唑（1）。5与双保护的咪唑的锂盐反应，得到相应的5-核糖咪唑7RS。7RS的水解得到具有未取代的咪唑的二醇异构体8R和8S的1：1混合物。使用N，N，N'，N'-四甲基偶氮二甲酰胺和Bu（3）P的混合物8RS的Mitsunobu环化以26.3的比率独家提供了苄基化的β-核呋喃呋喃糖基咪唑9beta，伴随有α-端基异构体9alpha： 1。通过乙氧基羰基衍生物10beta的X射线晶体学确定了9beta的构型。在Pd / C上进行了9beta的还原性脱苄基作用，并且从四个步骤开始从5开始获得1的合成，总产率为87％。这种合成方法扩展到4（5）-（2-deoxy-beta-D-rifurfuranosyl）imidazole（2）的合成。相应的二醇异构体14RS的1：1混合物的Mitsunobu环化以5