1-methyl-4-({1-methyl-4-[(1-methyl-4-nitro-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]-1H-pyrrole-2-carbonyl}amino)-1H-pyrrole-2-carboxylic acid methyl ester | 69910-21-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 1-methyl-4-({1-methyl-4-[(1-methyl-4-nitro-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]-1H-pyrrole-2-carbonyl}amino)-1H-pyrrole-2-carboxylic acid methyl ester
• 英文别名: methyl 1-methyl-4-{[({[(1-methyl-4-nitro-1H-pyrrol-2-yl)carbonyl]amino}-1-methyl-1H-pyrrol-2-yl)carbonyl]amino}-1H-pyrrole-2-carboxylate；methyl 1-methyl-4-(1-methyl-4-(1-methyl-4-nitro-1H-pyrrole-2-carboxamido)-1H-pyrrole-2-carboxamido)-1H-pyrrole-2-carboxylate；1-methyl-4-[1-methyl-4-(1-methyl-4-nitro-pyrrole-2-carbonylamino)-pyrrole-2-carbonylamino]-pyrrole-2-carboxylic acid methyl ester；Methyl 1-methyl-4-[[1-methyl-4-[(1-methyl-4-nitropyrrole-2-carbonyl)amino]pyrrole-2-carbonyl]amino]pyrrole-2-carboxylate
• CAS: 69910-21-0
• 化学式: C₁₉H₂₀N₆O₆
• 分子量: 428.404
• InChiKey: WMAKIRPXFQIRJN-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 熔点：
  >270 °C
• 沸点：
  528.5±50.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.45±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.5
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.21
• 拓扑面积：
  145
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-methyl-4-({1-methyl-4-[(1-methyl-4-nitro-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]-1H-pyrrole-2-carbonyl}amino)-1H-pyrrole-2-carboxylic acid methyl ester 在 palladium 10% on activated carbon 、 水 、 氢气 、 sodium carbonate 、 N,N'-羰基二咪唑 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醇 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 20.0~65.0 ℃ 、137.9 kPa 条件下， 反应 15.83h， 生成 4-(4-(4-formamido-1-methyl-1H-pyrrole-2-carboxamido)-1-methyl-1H-pyrrole-2-carboxamido)-1-methyl-1H-pyrrole-2-carboxylic acid
  参考文献：
  名称：

  [EN] DNA BINDING AGENTS WITH A MINOR GROOVE BINDING TAIL
  [FR] AGENTS LIANT L'ADN AVEC UNE QUEUE SE LIANT AU SILLON MINEUR

  摘要：

  本文提供的是一些能够插入细胞DNA并能够穿过血脑屏障的化合物。此外，本文还提供了这些化合物的药物组合物以及治疗癌症的方法，例如大脑、肺部或胰腺癌。

  公开号：

  WO2017049091A1
• 作为产物：
  描述：

  1-甲基-4-硝基吡咯-2-羧酸 在 palladium 10% on activated carbon 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 26.0h， 生成 1-methyl-4-({1-methyl-4-[(1-methyl-4-nitro-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]-1H-pyrrole-2-carbonyl}amino)-1H-pyrrole-2-carboxylic acid methyl ester
  参考文献：
  名称：

  PYRROLOBENZODIAZEPINE DERIVATIVE AND LIGAND-LINKER CONJUGATE THEREOF

  摘要：

  本发明涉及一种吡咯苯并二氮平衍生物化合物、其与配体的共轭物以及其用途。该吡咯苯并二氮平衍生物化合物在血浆中更加稳定，即使在循环过程中也稳定，并表现出优异的疗效。特别是，该吡咯苯并二氮平衍生物化合物与配体的共轭物具有极大的优势，因为可以针对性地治疗增生性疾病如癌症，最大化药物疗效，并最小化副作用的表达，因为该共轭物更稳定地到达目标细胞并有效发挥药物疗效，同时通过允许药物在癌细胞内轻松释放的连接技术，大大降低了毒性并最大化药物疗效。

  公开号：

  EP4086268A1

文献信息

• Synthesis and cytotoxicity evaluation of novel C7–C7, C7–N3 and N3–N3 dimers of 1-chloromethyl-5-hydroxy-1,2-dihydro-3H-benzo[e]indole (seco-CBI) with pyrrole and imidazole polyamide conjugates
  作者：Rohtash Kumar、J. William Lown

  DOI：10.1039/b303650m

  日期：——

  The C7–C7, C7–N3 and N3–N3 dimers of 1-chloromethyl-5-hydroxy-1,2-dihydro-3H-benzo[e]indole (seco-CBI) with pyrrole and imidazole polyamides were synthesized and preliminary anti-cancer evaluation carried out by NCI against three types of cancer cells.

  合成了1-氯甲基-5-羟基-1,2-二氢-3H-苯并[e]吲哚（seco-CBI）与吡咯和咪唑聚酰胺的C7–C7、C7–N3和N3–N3二聚体，并通过NCI对三种类型的癌细胞进行了初步抗癌评估。
• Facile synthesis of novel fluorescent distamycin analogues
  作者：Santanu Bhattacharya、Mini Thomas

  DOI：10.1016/s0040-4039(01)01040-1

  日期：2001.8

  A facile synthesis of four distamycin analogues that bear the dansyl fluorophore is described. The nature of the linkage between the fluorophore and the sequence recognition element had a dramatic effect on the fluorescence properties of these ligands upon DNA binding.

  描述了一种带有丹磺酰基荧光团的四种间他霉素类似物的简便合成方法。荧光基团和序列识别元件之间的连接性质对DNA结合后的这些配体的荧光性质产生了显着影响。
• Redirection of the Transcription Factor SP1 to AT Rich Binding Sites by a Synthetic Adaptor Molecule
  作者：Mathias Bolz、Ute Scheffer、Elisabeth Kalden、Michael W. Göbel

  DOI：10.1002/hlca.202100095

  日期：2021.9

  The ubiquitous transcription factor SP1 binds to a GC rich consensus sequence. Here we describe an adaptor molecule that mediates binding of SP1 to a non-cognate DNA site rich in AT. The adaptor is comprised of a Dervan-type hairpin polyamide with high affinity to an AT rich hexamer duplex. It also carries a 27mer DNA that contains the SP1 consensus sequence. The synthesis and purification of the polyamide-DNA

  无处不在的转录因子 SP1 与富含 GC 的共有序列结合。在这里，我们描述了一种适配器分子，它介导 SP1 与富含 AT 的非同源 DNA 位点的结合。该接头由对富含 AT 的六聚体双链体具有高亲和力的Dervan型发夹聚酰胺组成。它还携带含有 SP1 共有序列的 27 聚体 DNA。报道了聚酰胺-DNA 偶联物的合成和纯化。Pulldown 实验和蛋白质印迹分析证明了接头介导的 SP1 与六聚体双链体 TTGTTA 的结合。
• Bisindolylmaleimides Linked to DNA Minor Groove Binding Lexitropsins:  Synthesis, Inhibitory Activity against Topoisomerase I, and Biological Evaluation
  作者：Guojian Xie、Rajan Gupta、Kevin Atchison、J. William Lown

  DOI：10.1021/jm950465d

  日期：1996.1.1

  The synthesis, characterization, inhibitory activity against topoisomerase I, and biological evaluation of a series of oligopeptide-substituted bisindolylmaleimides 7-12 are described. Compounds 7-9, which contain a basic C-terminus function such as (dimethylamino)propyl and bind to DNA with C(50) values of 200, 160, and 135 microM, respectively, exhibited inhibition of topoisomerase I in a concentration

  描述了合成，表征，对拓扑异构酶I的抑制活性以及一系列寡肽取代的双吲哚基马来酰亚胺7-12的生物学评估。化合物7-9含有基本的C末端功能，例如（二甲氨基）丙基，并与C（50）值分别为200、160和135 microM的DNA结合，以浓度依赖的方式抑制了拓扑异构酶I 。同样，在<或= 100 microM浓度下观察到的拓扑异构酶I抑制的相对顺序为9> 8> 7，对应于寡肽部分中吡咯单元数量的增加。含有静电中性部分（例如甲酯）的化合物10-12不会与DNA模板结合，也不会抑制拓扑异构酶I。但是，这些化合物的细胞毒性活性为1。
• Studies of interaction between a new synthesized minor-groove targeting artificial nuclease and DNA
  作者：Qiang Yin、Zhen Zhang、Yu-Fen Zhao

  DOI：10.1016/j.saa.2006.05.007

  日期：2007.4

  molecular biology, such as DNA sequencing. Synthetic polyamide conjugates can be considered as new tool in the selective inhibition of gene expression and as potential drugs in anticancer or antiviral chemotherapy. In this paper, a new synthesized minor-groove targeting artificial nuclease, oligopyrrol-containing peptide, was reported. It was found that this new compound can bind DNA in AT-riched minor groove

  核酸酶在分子生物学（例如DNA测序）中起着重要作用。合成聚酰胺共轭物可被视为选择性抑制基因表达的新工具，并可作为抗癌或抗病毒化学疗法中的潜在药物。在本文中，报道了一种新的合成的针对人工核酸酶的小沟，含有寡吡咯的肽。发现该新化合物可以高亲和力和位点特异性结合富含AT的小沟中的DNA。通过UV-vis和圆二色性（CD）方法确定DNA结合行为。结果表明，化合物6可将寡聚体DNA的Tm从51.8℃提高至63.5℃，并具有较大的结合常数（Kb ＝ 8.83×10（4）L / mol）。