6,6-dimethyl-5-((1E,3E)-4-(N-phenylacetamido)buta-1,3-dienyl)-1,2,3,6-tetrahydropyrrolo[3,2,1-ij]quinolinium-7-sulfonate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 喹啉及其衍生物
• 英文名称: 6,6-dimethyl-5-((1E,3E)-4-(N-phenylacetamido)buta-1,3-dienyl)-1,2,3,6-tetrahydropyrrolo[3,2,1-ij]quinolinium-7-sulfonate
• 英文别名: 10-[(1E,3E)-4-(N-acetylanilino)buta-1,3-dienyl]-9,9-dimethyl-1-azatricyclo[6.3.1.04,12]dodeca-4(12),5,7,10-tetraene-7-sulfonic acid
• 化学式: C₂₅H₂₆N₂O₄S
• 分子量: 450.558
• InChiKey: AKJYKZMKGPMWQT-KZVYIGENSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.6
• 重原子数：
  32
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.24
• 拓扑面积：
  90.3
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-(5-carboxypentyl)-5,6-dimethyl-1,2,3,6-tetrahydropyrrolo[3,2,1-ij]quinolinium-7-sulfonate 、 6,6-dimethyl-5-((1E,3E)-4-(N-phenylacetamido)buta-1,3-dienyl)-1,2,3,6-tetrahydropyrrolo[3,2,1-ij]quinolinium-7-sulfonate 在 吡啶 作用下， 以 乙酸酐 为溶剂， 生成 (E)-2-((2E,4E)-5-(6-(5-Carboxypentyl)-6-methyl-7-sulfo-1,2,3,6-tetrahydropyrrolo[3,2,1-ij]quinolinium-5-yl)penta-2,4-dienylidene)-1,1-dimethyl-2,4,5,6-tetrahydro-1H-pyrrolo[3,2,1-ij]quinoline-9-sulfonate
  参考文献：
  名称：

  REACTIVE CYANINE COMPOUNDS

  摘要：

  该发明提供了公式I-VII的化合物和组合物，以及使用这些化合物的方法。这些化合物可用于制备染料共轭物，其在蛋白质、核酸或其他生物聚合物上比使用结构类似已知碳氰染料标记的共轭物具有更均匀和明显更荧光。除了在几乎相同波长下比结构类似染料具有更强的荧光发射外，并且在与生物聚合物结合时吸收光谱中的伪迹减少，这些化合物在吸收峰波长处可能具有更高的光稳定性和/或更高的吸光度（消光系数）比这些结构类似的染料。

  公开号：

  US20110053162A1
• 作为产物：
  描述：

  6-(5-carboxypentyl)-5,6-dimethyl-1,2,3,6-tetrahydropyrrolo[3,2,1-ij]quinolinium-7-sulfonate 、 丙二醛双苯亚胺单盐酸盐 在 溶剂黄146 作用下， 以 乙酸酐 为溶剂， 以28.3%的产率得到6,6-dimethyl-5-((1E,3E)-4-(N-phenylacetamido)buta-1,3-dienyl)-1,2,3,6-tetrahydropyrrolo[3,2,1-ij]quinolinium-7-sulfonate
  参考文献：
  名称：

  REACTIVE CYANINE COMPOUNDS

  摘要：

  该发明提供了公式I-VII的化合物和组合物，以及使用这些化合物的方法。这些化合物可用于制备染料共轭物，其在蛋白质、核酸或其他生物聚合物上比使用结构类似已知碳氰染料标记的共轭物具有更均匀和明显更荧光。除了在几乎相同波长下比结构类似染料具有更强的荧光发射外，并且在与生物聚合物结合时吸收光谱中的伪迹减少，这些化合物在吸收峰波长处可能具有更高的光稳定性和/或更高的吸光度（消光系数）比这些结构类似的染料。

  公开号：

  US20110053162A1

文献信息

• Reactive cyanine compounds
  申请人：Promega Corporation

  公开号：US08309059B2

  公开（公告）日：2012-11-13

  The invention provides compounds and compositions of Formulas I-VII, and methods of using the compounds. The compounds can be used to prepare dye conjugates that are uniformly and substantially more fluorescent on proteins, nucleic acids or other biopolymers, than conjugates labeled with structurally similar known carbocyanine dyes. In addition to having more intense fluorescence emission than structurally similar dyes at virtually identical wavelengths, and decreased artifacts in their absorption spectra upon conjugation to biopolymers, the compounds can have greater photostability and/or higher absorbance (extinction coefficients) at the wavelength(s) of peak absorbance than such structurally similar dyes.

  本发明提供了公式I-VII的化合物和组合物，以及使用这些化合物的方法。这些化合物可用于制备染料共轭物，其在蛋白质、核酸或其他生物聚合物上的荧光均匀且明显增强，相比与结构类似的已知碳氰染料标记的共轭物。除了在几乎相同的波长下比结构类似的染料具有更强的荧光发射，以及在共轭到生物聚合物时吸收光谱中具有更少的伪迹外，这些化合物还可以在波峰吸收的波长处具有更高的光稳定性和/或吸光度（消光系数）比这些结构类似的染料更高。
• US8309059B2
  申请人：——

  公开号：US8309059B2

  公开（公告）日：2012-11-13