combination. The acridines interact with both single- and double-stranded DNAs with substantially preferred interaction for the latter. The study of interaction suggested higher affinity of the acridines toward the GC- than AT-rich sequences. Good discrimination of two point mutations was shown in practical application with HFE gene (wild type, H63D C > G and S65C A > C mutations). Acridine itself can also
短寡脱氧核苷酸 (ODN) 探针适用于点突变的良好区分。然而,这些探针的熔化温度较低。在这项工作中,研究了使用
吖啶-4-甲酰胺嵌入剂来提高热稳定性的策略。大量
吖啶的研究表明,在通过双碳连接基团进行空间上不要求基本功能的仲甲酰胺修饰
吖啶后,可实现最佳稳定性。通过点击
化学进入位置 7 和/或 13,将两个高活性嵌入剂连接到短探针(13 或 18 个碱基;设计为 HFE
基因的一部分),并证明将双链体的熔化温度 (Tm) 提高近 8° C 为最佳组合。
吖啶与单链和双链 DNA 相互作用,后者具有实质上优选的相互作用。相互作用的研究表明
吖啶对 GC 序列的亲和力高于富含 AT 的序列。在 HFE
基因(野生型、H63D C > G 和 S65C A > C 突变)的实际应用中,显示了对两个点突变的良好区分。
吖啶本身也可以用作荧光团,并且还允许在仅用
吖啶标记的探针中将完全匹配的序列与具有点突变的序列区分开来。