(1R,2S,5S,3R,4R)-1-amino-4-[(tert-butyldiphenylsilyloxy)methyl]-2,3-O-isopropylidene-2,3-dihydroxybicyclo[3.1.0]hexane | 1069040-54-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: (1R,2S,5S,3R,4R)-1-amino-4-[(tert-butyldiphenylsilyloxy)methyl]-2,3-O-isopropylidene-2,3-dihydroxybicyclo[3.1.0]hexane
• 英文别名: (2R,5R)-5-[[(tert-butyldiphenylsilyl)oxy]methyl]-8,8-dimethyl-7,9-dioxatricyclo[4.3.0.0^2,4]nonan-2-amine；(1S,2R,4S,5R,6R)-5-[[tert-butyl(diphenyl)silyl]oxymethyl]-8,8-dimethyl-7,9-dioxatricyclo[4.3.0.02,4]nonan-2-amine
• CAS: 1069040-54-5
• 化学式: C₂₆H₃₅NO₃Si
• 分子量: 437.654
• InChiKey: SPSXMRUGNUUAAI-NDRZJSJOSA-N

物化性质

• 沸点：
  484.7±45.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.14±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.43
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.54
• 拓扑面积：
  53.7
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (1R,2S,5S,3R,4R)-1-amino-4-[(tert-butyldiphenylsilyloxy)methyl]-2,3-O-isopropylidene-2,3-dihydroxybicyclo[3.1.0]hexane 在 磷酸三甲酯 、 4-二甲氨基吡啶 、 ammonium hydroxide 、 2,4,6-三异丙基苯磺酰氯 、 2,3-dimethyl-1-(phenylsulfonyl)-1H-imidazolium triflate 、 1,8-双二甲氨基萘 、 三乙胺 、 三氟乙酸 、 三氯氧磷 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 乙醇 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 76.17h， 生成
  参考文献：
  名称：

  含有（S）-甲氨基甲环作为P2Y 6受体激动剂的嘧啶核苷酸

  摘要：

  UDP激活的P2Y 6受体（P2Y 6 R）的激动剂和拮抗剂已被建议用于治疗，例如癌症，炎症，神经退行性疾病和糖尿病。合成了含有南双环[3.1.0]己烷（（S）-甲氨基甲酸）环系统代替核糖环的尿嘧啶核苷酸，并在钙动员测定中显示为有效的P2Y 6 R激动剂。（S）-甲氨基甲酸酯修饰与嘧啶上的5-碘或4-甲氧基亚氨基相容，但与α，β-亚甲基5'-二磷酸不相容。（S）-Methanocarba二核苷酸效力与假定在P2Y 6结合的近端核苷上的N 4-甲氧基修饰兼容R与UDP类似；在远端核苷部分上优选（N）-甲氨基甲酸酯。这表明远端二核苷酸P2Y 6 R结合位点更喜欢可以达到（N）构象的核糖样基团，而不是（S）。通过同源性建模，对接和分子动力学模拟对二核苷酸结合进行建模，这表明凭经验发现了相同的核糖构象偏好。

  DOI：

  10.1039/c7md00397h
• 作为产物：
  描述：

  (1R,2S,5S,3R,4R)-1-benzyloxycarbonylamino-4-[(tert-butyldiphenylsilyloxy)methyl]-2,3-O-isopropylidene-2,3-dihydroxybicyclo[3.1.0]hexane 在 palladium on activated charcoal 氢气 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 2.0h， 以87%的产率得到(1R,2S,5S,3R,4R)-1-amino-4-[(tert-butyldiphenylsilyloxy)methyl]-2,3-O-isopropylidene-2,3-dihydroxybicyclo[3.1.0]hexane
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of Enantiomerically Pure (S)-Methanocarbaribo Uracil Nucleoside Derivatives for Use as Antiviral Agents and P2Y Receptor Ligands

  摘要：

  We have developed an approach toward enantiomerically pure (S)-methanocarba ribonucleosides based on several functional group transformations on a sensitive bicyclo[3.1.0]-hexane system. D-Ribose was transformed into methanocarba alcohol 3 followed by conversion of the OH group to a nitrile with inversion of configuration at C4. The nitrile group was subsequently reduced in two stages to the 5'-hydroxymethyl group. An ester group appended to a tertiary carbon (Cl) was transformed to an amino group as a nucleobase precursor.

  DOI：

  10.1021/jo801224j

文献信息

• South (S)- and North (N)-Methanocarba-7-Deazaadenosine Analogues as Inhibitors of Human Adenosine Kinase
  作者：Kiran S. Toti、Danielle Osborne、Antonella Ciancetta、Detlev Boison、Kenneth A. Jacobson

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.6b00689

  日期：2016.7.28

  0]hexane) derivatives of known inhibitors were prepared and compared as human (h) AdK inhibitors. 5'-Hydroxy (34, MRS4202 (S); 55, MRS4380 (N)) and 5'-deoxy 38a (MRS4203 (S)) analogues, containing 7- and N(6)-NH phenyl groups in 7-deazaadenine, robustly inhibited AdK activity (IC50 ∼ 100 nM), while the 5'-hydroxy derivative 30 lacking the phenyl substituents was weak. Docking in the hAdK X-ray structure and

  腺苷激酶（AdK）抑制剂可提高内源性腺苷水平，尤其是在疾病状态下，并具有治疗癫痫，神经退行性变和炎症的潜力。根据结合在AdK X射线晶体结构，（S）-和North（N）-甲氨基甲酸（双环[3.1.0]己烷）中的核苷抑制剂的South（S）核糖构象和分子动力学（MD）分析。制备了已知抑制剂的衍生物，并与人（h）AdK抑制剂进行了比较。5'-羟基（34，MRS4202（S）; 55，MRS4380（N））和5'-脱氧38a（MRS4203（S））类似物，在7-脱氮杂腺嘌呤中含有7-和N（6）-NH苯基，强烈抑制AdK活性（IC50〜100 nM），而缺少苯基取代基的5'-羟基衍生物30较弱。对接的hAdK X射线结构和MD模拟表明了一种类似于5'-deoxy-5-iodotubercidin和其他已知抑制剂的结合方式。因此，用于进一步增强效能的基于结构的设计方法是可能的。这项研究中有效的AdK