原卟啉原 IX 氧化酶(
PPO,
EC 1.3.3.4)是绿色
除草剂发现的一个有前景的目标。然而,
配体构型对
PPO 活性的影响仍知之甚少。在此,我们利用之前开发的活性片段交换和连接(AFEL)方法设计了3-( N-苯基尿
嘧啶)but-2-enoates,并合成了一系列具有纳摩尔范围的烟草
PPO(Nt
PPO)抑制效力和前景广阔的新型化合物。除草效力。我们的系统结构-活性关系研究表明,3-( N-苯基尿
嘧啶)but-2-烯酸酯的E异构体比其相应的Z异构体表现出更高的
生物活性。通过分子模拟研究,我们发现E异构体比Z异构体表现出相对较低的熵变,并且可以采样到与受体更稳定的结合构象。我们的密度泛函理论(DFT)计算表明, E异构体比相应的Z异构体表现出更高的
化学反应性和更低的电子
化学势。化合物E - Ic成为最佳化合物,其针对 Nt
PPO 的K i值为 3.0 nM,在 37.5–75 g ai/ha