3-carbamoyl-1,2-dihydro-3H-pyrrolo<3,2-e>indole-7-carboxylate trimer methyl ester | 107474-60-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 3-carbamoyl-1,2-dihydro-3H-pyrrolo<3,2-e>indole-7-carboxylate trimer methyl ester
• 英文别名: CDPI-trimer methyl ester；methyl 6-[6-(6-carbamoyl-7,8-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole-2-carbonyl)-7,8-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole-2-carbonyl]-7,8-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole-2-carboxylate
• CAS: 107474-60-2
• 化学式: C₃₅H₂₉N₇O₅
• 分子量: 627.659
• InChiKey: VLRLXYPQDGAEDH-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.1
• 重原子数：
  47
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  9.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.2
• 拓扑面积：
  161
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-carbamoyl-1,2-dihydro-3H-pyrrolo<3,2-e>indole-7-carboxylate trimer methyl ester 在 lithium hydroxide 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 102.0h， 生成 6-carbamoyl-1,2-dihydro-3H-pyrrolo<3,2-e>indole-7-carboxylate tetramer methyl ester
  参考文献：
  名称：

  Studies on the total synthesis of CC-1065: preparation of a synthetic simplified 3-carbamoyl-1,2-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole dimer/trimer/tetramer (CDPI dimer/trimer/tetramer) and development of methodology for PDE-I dimer methyl ester formation

  摘要：

  DOI：

  10.1021/jo00384a026
• 作为产物：
  描述：

  4-吲哚甲醛 在 4-二甲氨基吡啶 、 lithium hydroxide 、 sodium methylate 、 双(2-氧代-3-恶唑烷基)次磷酰氯 、 sodium cyanoborohydride 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 溶剂黄146 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 99.0h， 生成 3-carbamoyl-1,2-dihydro-3H-pyrrolo<3,2-e>indole-7-carboxylate trimer methyl ester
  参考文献：
  名称：

  Studies on the total synthesis of CC-1065: preparation of a synthetic simplified 3-carbamoyl-1,2-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole dimer/trimer/tetramer (CDPI dimer/trimer/tetramer) and development of methodology for PDE-I dimer methyl ester formation

  摘要：

  DOI：

  10.1021/jo00384a026

文献信息

• HYBRIDIZATION AND MISMATCH DISCRIMINATION USING OLIGONUCLEOTIDES CONJUGATED TO MINOR GROOVE BINDERS
  申请人：HEDGPETH JOEL

  公开号：US20090048427A1

  公开（公告）日：2009-02-19

  Conjugates between a minor groove binding molecule, such as the trimer of 1,2-dihydro-(3H)-pyrrolo[3,2-e]indole-7-carboxylate (CDPI 3 ), and an oligonucleotide form unusually stable hybrids with complementary target sequences, in which the tethered CDPI 3 group resides in the minor groove of the duplex. These conjugates can be used as probes and primers. Due to their unusually high binding affinity, conjugates as short as 8-mers can be used as amplification primers with high specificity and efficiency. MGB conjugation also increases the discriminatory power of short oligonucleotides, providing enhanced detection of nucleotide sequence mismatches by short oligonucleotides. The MGB-conjugated probes and primers described herein facilitate various analytic and diagnostic procedures, such as amplification reactions, PCR, detection of single-nucleotide polymorphisms, gene hunting, differential display, fluorescence energy transfer, hydrolyzable probe assays and others; by allowing the use of shorter oligonucleotides, which have higher specificity and better discriminatory power.

  一种小沟结合分子（例如1,2-二氢-（3H）-吡咯并[3,2-e]吲哚-7-羧酸三聚体（CDPI3））与寡核苷酸之间的共轭体形成与互补靶序列异常稳定的杂交体，在其中，被拴在一起的CDPI3基团位于双链的小沟中。这些共轭体可用作探针和引物。由于它们的结合亲和力异常高，因此即使是长度为8个碱基的共轭体也可用作具有高特异性和效率的扩增引物。MGB共轭还增加了短寡核苷酸的鉴别能力，通过短寡核苷酸提供了更好的核苷酸序列不匹配检测。所述的MGB共轭探针和引物可促进各种分析和诊断过程，例如扩增反应，PCR，单核苷酸多态性检测，基因寻找，差异显示，荧光能量转移，可水解探针测定等；通过使用更短的寡核苷酸，从而具有更高的特异性和更好的鉴别能力。
• US7556923B1
  申请人：——

  公开号：US7556923B1

  公开（公告）日：2009-07-07
• US7794945B2
  申请人：——

  公开号：US7794945B2

  公开（公告）日：2010-09-14
• US8465921B2
  申请人：——

  公开号：US8465921B2

  公开（公告）日：2013-06-18
• Studies on the total synthesis of CC-1065: preparation of a synthetic simplified 3-carbamoyl-1,2-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole dimer/trimer/tetramer (CDPI dimer/trimer/tetramer) and development of methodology for PDE-I dimer methyl ester formation
  作者：Dale L. Boger、Robert S. Coleman、Benedict J. Invergo

  DOI：10.1021/jo00384a026

  日期：1987.4