methyl 2-((1H-indol-3-yl)methyl)acrylate | 72629-44-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: methyl 2-((1H-indol-3-yl)methyl)acrylate
• 英文别名: methyl 2-(1H-indol-3-ylmethyl)prop-2-enoate
• CAS: 72629-44-8
• 化学式: C₁₃H₁₃NO₂
• 分子量: 215.252
• InChiKey: NPEPWABQLCBSMB-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 熔点：
  69-71 °C(Solv: hexane (110-54-3))
• 沸点：
  387.3±30.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.178±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.9
• 重原子数：
  16
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.15
• 拓扑面积：
  42.1
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  2

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl 2-((1H-indol-3-yl)methyl)acrylate 在 potassium hydroxide 作用下， 以 甲醇 、 水 为溶剂， 反应 24.5h， 以77%的产率得到2-((1H-indol-3-yl)methyl)acrylic acid
  参考文献：
  名称：

  紫罗兰色杆菌中紫堇青素的生物合成，1-色氨酸氧化酶VioA的结构和功能。

  摘要：

  紫罗兰素是紫罗兰色杆菌的天然紫色颜料，具有潜在的医学应用，如抗微生物，抗病毒和抗癌药。紫胶素生物合成的第一步是通过黄酮酶L-色氨酸氧化酶（VioA）将L-色氨酸氧化转化为相应的α-亚胺。与底物相关的（3-（1H-吲哚-3-基）-2-甲基丙酸）和与产品相关的（2-（1H-吲哚-3-基甲基）丙-2-烯酸）竞争性VioA抑制剂是合成用于后续的动力学和X射线晶体学研究。解析了二元VioA·FADH2和三元VioA·FADH2·2-（1H-吲哚-3-基甲基）丙-2-烯酸配合物的结构。VioA形成“松散相关”的同型二聚体，如小角度X射线散射实验所示。根据结构保守的辅因子结合结构域，VioA属于FAD依赖性氧化还原酶的谷胱甘肽还原酶家族2。VioA的底物结合域主要负责l-色氨酸的特异性识别。其他典型的氨基酸被有效区分，只有少量的1-苯丙氨酸转化。此外，7-氮杂-色氨酸，1-甲基-色氨酸，5-甲基-色氨酸

  DOI：

  10.1074/jbc.m116.741561
• 作为产物：
  描述：

  吲哚 、 2-(溴甲基)丙烯酸甲酯 在 甲基氯化镁 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 2.16h， 以55%的产率得到methyl 2-((1H-indol-3-yl)methyl)acrylate
  参考文献：
  名称：

  通过使用自由基加成反应和SAM类似物扩展自由基SAM化学

  摘要：

  激进小号-adenosyl-升蛋氨酸（SAM）酶利用[4Fe-4S]簇结合SAM，并还原性裂解其碳硫键，产生高反应性5'-脱氧腺苷（dAdo）自由基。在几乎所有情况下，dAdo自由基都会从底物或酶中提取氢原子，从而引发一系列高度多样化的反应。在此，我们报道了基于dAdo自由基的化学在自由基SAM酶NosL反应中从夺氢到自由基加成的变化。这种变化是通过使用含有烯烃部分的底物类似物来实现的。我们还表明，含有不同核苷官能团的两个SAM类似物可高效启动基于自由基的反应。发现反应中生成的烯烃与自由基加合物进行了两个发散反应，并详细研究了该过程的机械原理。我们的研究证明了扩大自由基SAM化学的一种有前途的策略，它提供了一种通过使用自由基SAM依赖性反应来访问含核苷的化合物的有效方法。

  DOI：

  10.1002/anie.201605917

文献信息

• C–H Alkenylation of Heteroarenes: Mechanism, Rate, and Selectivity Changes Enabled by Thioether Ligands
  作者：Bradley J. Gorsline、Long Wang、Peng Ren、Brad P. Carrow

  DOI：10.1021/jacs.7b03887

  日期：2017.7.19

  catalytic intermediate in these reactions may also account for unusual catalyst-controlled site selectivity wherein C–H alkenylation of five-atom heteroarenes can occur under electronic control with thioether ligands even when this necessarily involves reaction at a more hindered C–H bond. The thioether effect also enables short reaction times under mild conditions for many O-, S-, and N-heteroarenes (55 examples)

  已确定硫醚辅助配体可以大大促进O-，S-和N的C–H烯基化-杂芳烃。动力学数据表明，硫醚-Pd催化的反应比经典的无配体系统快800倍之多。此外，机理研究表明，C–H键的裂解是限制周转的步骤，硫醚配位时的速率加速与该关键步骤从中性途径向阳离子途径的变化相关。在这些反应中形成阳离子型，低配位的催化中间体也可能说明了催化剂控制位点的异常，其中五原子杂芳烃的CH链烯基化可以在硫代配体的电子控制下发生，即使这必然涉及在更阻碍了CH键的键合。硫醚效应还使得许多O-，S-和N-杂芳烃（55个实例），包括晚期药物衍生化的实例。
• Stereoselective Syntheses of 4-Hydroxy 4-Substituted Glutamic Acids
  作者：Osamu Tamura、Tomoya Shiro、Mizuho Ogasawara、Atsushi Toyao、Hiroyuki Ishibashi

  DOI：10.1021/jo040296h

  日期：2005.6.1

  The 4-hydroxy 4-substituted glutamic acid moiety is a common substructure of biologically important natural products such as monatin [(2S,4S)-2], lycoperdic acid (3), and dysiherbaine (4). To develop methodology for syntheses of these natural products, cycloadditions of nitrone 5 with 2-substituted 2-propen-1-ols 6 and 2-substituted acrylates 8 were investigated. Reactions of nitrone 5 with alcohols

  4-羟基4-取代的谷氨酸部分是生物学上重要的天然产物（如莫纳甜[[2S，4S）-2]，糖过磷酸（3）和dysiherbaine（4））的常见亚结构。为了开发合成这些天然产物的方法，研究了硝酮5与2-取代的2-丙烯-1-醇6和2-取代的丙烯酸酯8的环加成。在MgBr2OEt2存在下，硝酮5与醇6的反应以高度立体选择性的方式得到环加合物7，而5与丙烯酸8的非催化反应得到加合物9。使用前一反应，合成莫纳甜[[2S，4S）-2] ，完成了莫纳甜衍生物18和lycoperdic酸（3）。莫纳甜[（2S，4R）-2）的C4-表位也通过使用后者的环加成反应合成。
• Palladium-catalyzed functionalization of indoles with 2-acetoxymethyl substituted electron-deficient alkenes
  作者：Shengming Ma、Shichao Yu

  DOI：10.1016/j.tetlet.2004.08.178

  日期：2004.11

  A new functionalization of indoles via palladium-catalyzed reaction of indoles and 2-acetoxymethyl substituted electron-deficient alkenes is reported. The reaction was carried out under neutral condition and no isomerization of the carbon–carbon double bond was observed.

  据报道，通过钯催化的吲哚与2-乙酰氧基甲基取代的电子缺陷型烯烃的反应，使吲哚具有新的功能化。该反应在中性条件下进行，未观察到碳-碳双键的异构化。
• Biosynthesis of Violacein, Structure and Function of l-Tryptophan Oxidase VioA from Chromobacterium violaceum
  作者：Janis J. Füller、René Röpke、Joern Krausze、Kim E. Rennhack、Nils P. Daniel、Wulf Blankenfeldt、Stefan Schulz、Dieter Jahn、Jürgen Moser

  DOI：10.1074/jbc.m116.741561

  日期：2016.9

  a natural purple pigment of Chromobacterium violaceum with potential medical applications as antimicrobial, antiviral, and anticancer drugs. The initial step of violacein biosynthesis is the oxidative conversion of l-tryptophan into the corresponding α-imine catalyzed by the flavoenzyme l-tryptophan oxidase (VioA). A substrate-related (3-(1H-indol-3-yl)-2-methylpropanoic acid) and a product-related

  紫罗兰素是紫罗兰色杆菌的天然紫色颜料，具有潜在的医学应用，如抗微生物，抗病毒和抗癌药。紫胶素生物合成的第一步是通过黄酮酶L-色氨酸氧化酶（VioA）将L-色氨酸氧化转化为相应的α-亚胺。与底物相关的（3-（1H-吲哚-3-基）-2-甲基丙酸）和与产品相关的（2-（1H-吲哚-3-基甲基）丙-2-烯酸）竞争性VioA抑制剂是合成用于后续的动力学和X射线晶体学研究。解析了二元VioA·FADH2和三元VioA·FADH2·2-（1H-吲哚-3-基甲基）丙-2-烯酸配合物的结构。VioA形成“松散相关”的同型二聚体，如小角度X射线散射实验所示。根据结构保守的辅因子结合结构域，VioA属于FAD依赖性氧化还原酶的谷胱甘肽还原酶家族2。VioA的底物结合域主要负责l-色氨酸的特异性识别。其他典型的氨基酸被有效区分，只有少量的1-苯丙氨酸转化。此外，7-氮杂-色氨酸，1-甲基-色氨酸，5-甲基-色氨酸
• Tryptophan Lyase (NosL): A Cornucopia of 5′-Deoxyadenosyl Radical Mediated Transformations
  作者：Dhananjay M. Bhandari、Dmytro Fedoseyenko、Tadhg P. Begley

  DOI：10.1021/jacs.6b06139

  日期：2016.12.21

  Tryptophan lyase (NosL) is a radical S-adenosyl-l-methionine (SAM) enzyme that catalyzes the formation of 3-methyl-2-indolic acid from l-tryptophan. In this paper, we demonstrate that the 5'-deoxyadenosyl radical is considerably more versatile in its chemistry than previously anticipated: hydrogen atom abstraction from Nα-cyclopropyltryptophan occurs at Cα rather than the amino group with NosL Y90A

  色氨酸裂解酶 (NosL) 是一种自由基 S-腺苷-l-甲硫氨酸 (SAM) 酶，可催化从 l-色氨酸形成 3-甲基-2-吲哚酸。在本文中，我们证明了 5'-脱氧腺苷基团在其化学中的用途比以前预期的要多得多：从 Nα-环丙基色氨酸中提取氢原子发生在 Cα 处，而不是使用 NosL Y90A 的氨基，并用酮代替底物胺或烯烃将化学反应从氢原子提取变为双键加成。此外，5'-脱氧腺苷自由基可以添加到 [4Fe-4S] 簇中，并且连二亚硫酸盐可用于在活性位点捕获自由基。