N⁶-benzoyl-9-[6,7-dideoxy-2,3-O-isopropylidene-7-C-(trimethylsilyl)-α-L-talo-hept-6-ynofuranosyl]adenine | 244263-90-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: N⁶-benzoyl-9-[6,7-dideoxy-2,3-O-isopropylidene-7-C-(trimethylsilyl)-α-L-talo-hept-6-ynofuranosyl]adenine
• 英文别名: N-[9-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-[(1S)-1-hydroxy-3-trimethylsilylprop-2-ynyl]-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]purin-6-yl]benzamide
• CAS: 244263-90-9
• 化学式: C₂₅H₂₉N₅O₅Si
• 分子量: 507.621
• InChiKey: QXSKDOGHPAJWIB-PWFQQWTISA-N

物化性质

• 密度：
  1.35±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.74
• 重原子数：
  36
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.44
• 拓扑面积：
  121
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N⁶-benzoyl-9-[6,7-dideoxy-2,3-O-isopropylidene-7-C-(trimethylsilyl)-α-L-talo-hept-6-ynofuranosyl]adenine 在 甲酸 、 水 作用下， 反应 10.0h， 以64%的产率得到N6-benzoyl-9-[6,7-dideoxy-7-C-(trimethylsilyl)-α-L-talo-hept-6-ynofuranosyl]adenine
  参考文献：
  名称：

  含核碱基主链的寡核苷，第 2 部分，腺苷衍生单体的合成和结构测定

  摘要：

  描述了新寡核苷的腺苷衍生单体结构单元的合成和结构测定。将 Me3Si-乙炔化物添加到由已知的部分保护的腺苷 1 衍生的醛中会产生差向异构的炔丙醇 2 和 3，它们被氧化成相同的酮 4，而甲硅烷基化和去保护会产生 7 和 9（方案 1）。在炔丙基甲硅烷基醚 10 和 11 的 C(8) 处引入 I 取代基并不令人满意。因此，被保护的腺苷 12 通过去质子化和用 PhSO2Cl 处理以高产率转化为 8-氯衍生物 13；以类似的方式获得碘化物15（方案2）。8-Cl 和 8-I 衍生物 13 和 15 分别转化为炔丙醇 17、18、25 和 26（方案 3）。炔丙基衍生物 2、10、17, 19, 23, 25, 27是相关的，它们的(5'R)构型是根据脱水核苷19的NOE确定的；类似地，3、11、18、20、24、26 和 28 的相关性以及 20 的 NOE 证明了它们的 (5'S) 构型。

  DOI：

  10.1002/1522-2675(20000705)83:7<1331::aid-hlca1331>3.0.co;2-z
• 作为产物：
  描述：

  N6-苯甲酰基-2',3'-O-异丙亚基腺苷 在 二氯乙酸 、 乙基溴化镁 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 0.17h， 生成 N⁶-benzoyl-9-[6,7-dideoxy-2,3-O-isopropylidene-7-C-(trimethylsilyl)-α-L-talo-hept-6-ynofuranosyl]adenine
  参考文献：
  名称：

  含核碱基主链的寡核苷，第 2 部分，腺苷衍生单体的合成和结构测定

  摘要：

  描述了新寡核苷的腺苷衍生单体结构单元的合成和结构测定。将 Me3Si-乙炔化物添加到由已知的部分保护的腺苷 1 衍生的醛中会产生差向异构的炔丙醇 2 和 3，它们被氧化成相同的酮 4，而甲硅烷基化和去保护会产生 7 和 9（方案 1）。在炔丙基甲硅烷基醚 10 和 11 的 C(8) 处引入 I 取代基并不令人满意。因此，被保护的腺苷 12 通过去质子化和用 PhSO2Cl 处理以高产率转化为 8-氯衍生物 13；以类似的方式获得碘化物15（方案2）。8-Cl 和 8-I 衍生物 13 和 15 分别转化为炔丙醇 17、18、25 和 26（方案 3）。炔丙基衍生物 2、10、17, 19, 23, 25, 27是相关的，它们的(5'R)构型是根据脱水核苷19的NOE确定的；类似地，3、11、18、20、24、26 和 28 的相关性以及 20 的 NOE 证明了它们的 (5'S) 构型。

  DOI：

  10.1002/1522-2675(20000705)83:7<1331::aid-hlca1331>3.0.co;2-z

文献信息

• Oligonucleotide Analogues with Integrated Bases and Backbone. Part 13
  作者：Xiaomin Zhang、Bruno Bernet、Andrea Vasella

  DOI：10.1002/hlca.200690259

  日期：2006.12

  The self-complementary UA and AU dinucleotide analogues 41–45, 47, 48, and 51–60 were prepared by Sonogashira coupling of 6-iodouridines with C(5′)-ethynylated adenosines and of 8-iodoadenosines with C(5′)-ethynylated uridines. The dinucleotide analogues associate in CDCl3 solution. The C(6/I)-unsubstituted AU dimers 51 and 54 prefer an anti-oriented uracilyl group and form stretched linear duplexes

  自身互补UA和AU二核苷酸类似物41 - 45，47，48，和51 - 60通过制备的Sonogashira与6- iodouridines耦合C（5'） -ethynylated腺苷和与8- iodoadenosines C（5'） -乙炔化尿苷。二核苷酸类似物在CDCl 3溶液中缔合。的C（6 / I） -未被取代的AU二聚体51和54更喜欢抗拉伸线性双链体取向uracilyl组和形式。UA炔丙醇41和43 – 45具有持久的分子内O（5'/ I）H⋅⋅⋅N（3 / I）H-键，因此，一个顺式取向的腺嘌呤基和GT -或TG取向乙炔基部分; 它们形成波纹状线性双工。所有其他的二聚体形成特征的循环复式顺式取向的核碱基。乙炔基部分的首选方向（C（4'），C（5'）扭转角）定义了gg和乙炔基超过O（4'/ I）的构象。所述UA二聚体42,47，和48形式的Watson-Crick氢键，该AU二聚体56和58
• Oligonucleosides with a Nucleobase-Including Backbone, Part 3, Synthesis of Acetyleno-Linked Adenosine Dimers
  作者：Hiroki Gunji、Andrea Vasella

  DOI：10.1002/1522-2675(20001108)83:11<2975::aid-hlca2975>3.0.co;2-2

  日期：2000.11.8

  C(5′)-ethynylated adenosine derivatives 5, 6, 11, and 12 (Scheme 4). Similarly, the 5′-epimeric dimer 16 was prepared by coupling 3 with the alkyne 8 (Scheme 5). The propargylic alcohol 4 was transformed into the N-benzoylated alkyne 5 and into the amine 6, while the epimeric alcohol 7 was converted to the epimeric amine 8 and the 5′-deoxy analogues 11 and 12 (Scheme 3). Cross-coupling of the iodoadenosine

  腺苷衍生的二聚体 14a-d 和 15b-d 是通过将受保护的 8-碘腺苷 3 和 13 与 C(5')-乙炔化腺苷衍生物 5、6、11 和 12 偶联制备的（方案 4）。类似地，5'-差向异构体二聚体 16 通过将 3 与炔烃 8 偶联来制备（方案 5）。炔丙醇 4 转化为 N-苯甲酰化炔烃 5 和胺 6，而差向异构醇 7 转化为差向异构胺 8 和 5'-脱氧类似物 11 和 12（方案 3）。碘腺苷 13 与炔烃 5 至 14a 的交叉偶联得到优化；它受炔烃的 N-苯甲酰基和 Et3SiO 基团的影响，但几乎不受 8-碘腺苷的 N-苯甲酰基影响。炔烃在 O-甲硅烷基化而不是 N-苯甲酰化时最具反应性。5'-脱氧炔烃的交叉偶联进行得更慢。二聚体 14a – d、15b – d 和 16 的收率良好（表 2）。14d 和 16 的去保护分别导致 18 和 20（方案 5）。二醇 17 和 19
• Oligonucleosides with a Nucleobase-Including Backbone. Part 12
  作者：Simon Eppacher、Punit Kumar Bhardwaj、Bruno Bernet、José Luis Bravo Gala、Thomas Knöpfel、Andrea Vasella

  DOI：10.1002/hlca.200490269

  日期：2004.12

  In contradistinction to the corresponding Grignard reagent, bis[(trimethylsilyl)ethynyl]zinc reacted with the 5′-oxoadenosine 3 diastereoselectively to the β-D-allo-hept-6-ynofuranosyladenine 5. Lithiation/iodination of the monomeric propargyl alcohol 5 and of the dimeric propargyl alcohol 22 provided the 8-iodoadenosines 7 and 18, respectively, considerably shortening the synthesis of the dimeric

  在对比相应的格氏试剂，双[（三甲基甲硅烷基）乙炔基]锌与5'-oxoadenosine反应3非对映选择性的β -D-同种异体-庚-6- ynofuranosyladenine 5。单体炔丙醇5和二聚炔丙醇22的锂化/碘化分别提供了8-碘腺苷7和18，大大缩短了二聚O-甲硅烷基化的8-碘腺苷25的合成。尿苷和腺苷混合的四聚体21和32被合成了。通过线性序列制备四聚体21。Sonogashira的9和13偶联产生了三聚体16，它被C-去甲硅烷基化为17。17和19的第二次Sonogashira偶联产生了四聚体21。通过汇聚路线，将乙炔29和碘化物30偶联，以更高的产率制备四聚体32。尿苷衍生的碘化物被证明比腺苷衍生的类似物和N 6具有更高的反应活性。-未保护的腺苷衍生的炔烃比其N 6-苯甲酰化的类似物更具反应性。