6-hydroxymethyl-2,2-dimethyl-4,6a-dihydro-3aH-cyclopenta[1,3]dioxol-4-ol | 162126-83-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 6-hydroxymethyl-2,2-dimethyl-4,6a-dihydro-3aH-cyclopenta[1,3]dioxol-4-ol
• 英文别名: (3aS,4S,6aR)-6-hydroxymethyl-2,2-dimethyl-4,6a-dihydro-3aH-cyclopenta[1,3]dioxol-4-ol；(+)-(1S,4R,5S)-3-hydroxymethyl-4,5-O-isopropylidenecyclopent-2-en-1-ol；6-hydroxymethyl-2,2-dimethyl-4,6a-dihydro-3aH-cyclopenta[1,3]dioxo-4-ol；(3aR,6S,6aS)-4-(hydroxymethyl)-2,2-dimethyl-6,6a-dihydro-3aH-cyclopenta[d][1,3]dioxol-6-ol
• CAS: 162126-83-2
• 化学式: C₉H₁₄O₄
• 分子量: 186.208
• InChiKey: YGOFBNVQPCNJOH-RNJXMRFFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.2
• 重原子数：
  13
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.78
• 拓扑面积：
  58.9
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-hydroxymethyl-2,2-dimethyl-4,6a-dihydro-3aH-cyclopenta[1,3]dioxol-4-ol 在 4-二甲氨基吡啶 、 偶氮二甲酸二异丙酯 、 三乙胺 、 三苯基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 5.0h， 生成 9-{(3aS,4R,6aR)-6-{{[(1,1-dimethylethyl)dimethylsilyl]oxy}methyl}-3a,6a-dihydro-2,2-dimethyl-4H-cyclopenta[d]-1,3-dioxol-4-yl}-9H-purin-6-amine
  参考文献：
  名称：

  用于制备环戊烯基碳环核苷的手性结构单元的新途径。对映体neplanocins A的合成及其抗癌活性

  摘要：

  3-[(叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基]甲基-4,5- O-异亚丙基环戊-2-en-1-醇的两种对映体的合成基于光学非活性内消旋酒石酸二甲酯，分六个步骤完成。这种合成环戊烯基碳环核苷的关键中间体随后用于制备对映体奈普兰菌素A。研究了这些化合物对一系列悬浮和贴壁癌细胞系以及正常人成纤维细胞的毒性作用。 (−)-Neplanocin A ((−)- NPA ) 对所有测试的癌细胞系比其右旋对应物更具毒性。 MOLT-4 和 A431 细胞的毒性最高，IC 50值分别为 7 和 10 μM。此外，(-)- NPA还诱导 A431 细胞凋亡，而 (+)- NPA未观察到这种效应。

  DOI：

  10.1039/d0ra06394k
• 作为产物：
  描述：

  在 sodium tetrahydroborate 、 cerium(III) chloride heptahydrate 、 臭氧 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 6-hydroxymethyl-2,2-dimethyl-4,6a-dihydro-3aH-cyclopenta[1,3]dioxol-4-ol
  参考文献：
  名称：

  用于制备环戊烯基碳环核苷的手性结构单元的新途径。对映体neplanocins A的合成及其抗癌活性

  摘要：

  3-[(叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基]甲基-4,5- O-异亚丙基环戊-2-en-1-醇的两种对映体的合成基于光学非活性内消旋酒石酸二甲酯，分六个步骤完成。这种合成环戊烯基碳环核苷的关键中间体随后用于制备对映体奈普兰菌素A。研究了这些化合物对一系列悬浮和贴壁癌细胞系以及正常人成纤维细胞的毒性作用。 (−)-Neplanocin A ((−)- NPA ) 对所有测试的癌细胞系比其右旋对应物更具毒性。 MOLT-4 和 A431 细胞的毒性最高，IC 50值分别为 7 和 10 μM。此外，(-)- NPA还诱导 A431 细胞凋亡，而 (+)- NPA未观察到这种效应。

  DOI：

  10.1039/d0ra06394k

文献信息

• Synthesis of Cyclopentenyl Carbocyclic Nucleosides as Potential Antiviral Agents Against Orthopoxviruses and SARS
  作者：Jong Hyun Cho、Dale L. Bernard、Robert W. Sidwell、Earl R. Kern、Chung K. Chu

  DOI：10.1021/jm0509750

  日期：2006.2.1

  D-ribose (4). The key intermediate (+)-12a was utilized for the synthesis of unnatural five-membered ring heterocyclic carbocyclic nucleosides. The newly synthesized 1,2,3-triazole analogue (17c) exhibited potent antiviral activity (EC(50) 0.4 microM) against vaccinia virus and moderate activities (EC(50) 39 microM) against cowpox virus and severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARSCoV) (EC(50)

  已开发出一种实用且方便的合成手性环戊烯醇衍生物（+）-12a的方法，作为用于合成生物活性碳环核苷的关键中间体。选择性保护烯丙基羟基，然后与Grubbs催化剂进行闭环复分解（RCM）反应，可提供10 g规模的（+）-12a，D-核糖的总收率为52％（4）。关键中间体（+）-12a用于合成非天然的五元环杂环碳环核苷。新合成的1,2,3-三唑类似物（17c）对牛痘病毒显示有效的抗病毒活性（EC（50）0.4 microM），对牛痘病毒和严重的急性呼吸系统综合症冠状病毒（EC（50）39 microM）具有中等活性（EC（50）39 microM）（ SARSCoV）（EC（50）47 microM）。1,2
• Synthesis and Anti-HCV Activity of 4-Methoxy-7<i>H</i>-Pyrrolo[2,3-<i>d</i>] Pyrimidine Carbocyclic Nucleosides
  作者：Anandarajan Thiyagarajan、Masaaki Toyama、Masanori Baba、Ashoke Sharon、Chandralata Bal

  DOI：10.1080/15257770.2016.1163374

  日期：2016.6.2

  ABSTRACT The present study includes the exploration of new possible nucleoside mimetics based on 4-methoxy-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine carbocyclic nucleosides (4a–g), which were synthesized by 10–15 synthetic steps and characterized adequately. We report the anti-HCV activities and cytotoxicities of 4a–g. Compound 4a was analyzed by single crystal X-ray diffraction which showed some puckering in the

  摘要本研究包括探索基于 4-甲氧基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶碳环核苷（4a-g）的新型核苷模拟物，该核苷通过10-15个合成步骤合成并充分表征。我们报告了 4a-g 的抗 HCV 活性和细胞毒性。通过单晶 X 射线衍射分析化合物 4a，其显示具有 2'-内构象和反碱配置 (χ = -125.7°) 的环戊烯环中存在一些褶皱。
• Total Synthesis of (−)-Neplanocin A by Using Lithium Thiolate-Initiated Michael−Aldol Tandem Cyclization Reaction
  作者：Masashi Ono、Katsumi Nishimura、Hiroshi Tsubouchi、Yasuo Nagaoka、Kiyoshi Tomioka

  DOI：10.1021/jo016090n

  日期：2001.11.1

  of this synthesis is a stereoselective construction of five-membered ring of neplanocin A by intramolecular aldol reaction of the lithium enolate that was generated by conjugate addition of lithium thiolate. TBS-protected chiral omega-oxo-alpha,beta-unsaturated ester 16, which was prepared from D-mannitol, was treated with 1.2 equiv of lithium benzylthiolate in THF at -20 degrees C to give three separable

  合成（-）-Neplanocin A（1），S-腺苷同型半胱氨酸水解酶抑制剂。该合成的特征是通过烯醇锂的分子内醇醛羟醛缩合反应的分子内醛醇缩合反应，形成的新霉素A的五元环的立体选择性构建，该烯醇式锂通过共轭加成硫醇锂而产生。由D-甘露糖醇制备的TBS保护的手性ω-氧代-α，β-不饱和酯16在-20℃下用1.2当量苄基硫醇锂的THF溶液处理，得到三种可分离的环化产物，收率和立体选择性好。在保护基团转化之后，通过氧化成亚砜并随后热消除，除去21的苄基硫烷基部分，得到所需的双键。通过30的官能团转化，完成了（-）-neplanocin A（1）的全合成。
• The isolation and absolute configuration of (1S,2S,3R)-4- Hydroxymethylcyclopent-4-ene-1,2,3-triol: A putative intermediate in the biosynthesis of aristeromycin by Streptomyces citricolor
  作者：Stanley M. Roberts、Andrew J. Thorpe、Nicholas J. Turner、W.Michael Blows、Antony D. Buss、Michael J. Dawson、David Noble、Brian A.M. Rudd、Phillip J. Sidebottom、Wilfred F. Wall

  DOI：10.1016/s0040-4039(00)60621-4

  日期：1993.6

  The novel tetrol 5 has been isolated from cultures of Strepromyces citricolor and shown to have the absolute configuration 1S,2S,3R. Addition of 5 to an aris teromycin non-producing mutant of S. citricolor supported production of both aristeromycin 1 and neplanocin A 2, suggesting that 5 is an intermediate on the biosynthetic pathway.

  该新型四醇5已经从培养物中分离Strepromyces citricolor和示出为具有绝对构型1小号，2小号，3 - [R 。另外的5到ARIS teromycin非生产突变体S. citricolor支持生产两者的芒霉素1和neplanocin阿2，这表明5是在生物合成途径中的中间体。
• Synthesis of 3-deazaneplanocin A analogs and their antiviral activity against RNA-viruses
  作者：Se Myeong Choi、Yeon Jin An、Eun Rang Choi、Ye Eun Nam、Eun Woo Seo、Changhyun Kang、Soo Bin Ahn、Uk-Il Kim、Meehyein Kim、Kyungjin Kim、Jong Hyun Cho

  DOI：10.1016/j.molstruc.2022.134775

  日期：2023.4

  spectrum of biological activity against some cancers and DNA/RNA viruses as a promising inhibitor of the S-adenosyl-L-homocysteine (SAH) hydrolase and the enhancer of zeste homolog 2 (EZH2). Recently, 3-halogenated DZNep analogs were reported as potent inhibitors against RNA viruses as an inhibitor of SAH hydrolase, but 6-halogenated DZNep and its analogs was not studied as an antiviral agent to date

  3-Deazaneplanosin A (DZNep, 2 ) 类似物作为 S-腺苷-L-高半胱氨酸 (SAH) 水解酶抑制剂和 zeste 同系物 2 的增强剂，显示出对某些癌症和 DNA/RNA 病毒具有广泛的生物活性（ EZH2). 最近，据报道 3-卤代 DZNep 类似物作为 SAH 水解酶抑制剂可作为 RNA 病毒的有效抑制剂，但迄今为止尚未研究 6-卤代 DZNep 及其类似物作为抗病毒剂。因此，使用3-脱氮嘌呤衍生物与手性环戊烯-1-醇衍生物( 22a -b ). 通过对先前合成方法的改进程序，从D-核糖中以 50% 的总收率制备了手性22a和22b。此外，3-脱氮嘌呤类似物包括 2,6-二溴-3-脱氮嘌呤30a 、 2,6-二氯-3-脱氮嘌呤30b、6-叠氮基-3-脱氮嘌呤36、N 6 -Bz-3-脱氮嘌呤38a和N如图6所示，N 6 -bisBz-3-脱氮嘌呤38b的合成总收率为