Exploration of zinc-binding groups for the design of inhibitors for the oxytocinase subfamily of M1 aminopeptidases
作者:Sofia Tsoukalidou、Magdalini Kakou、Ioannis Mavridis、Despoina Koumantou、Vito Calderone、Marco Fragai、Efstratios Stratikos、Athanasios Papakyriakou、Dionisios Vourloumis
DOI:10.1016/j.bmc.2019.115177
日期:2019.12
of the enzymes via strong interactions with the catalytic zinc(II) atom and, while achieving increased potency, they suffer in selectivity. Continuing our earlier efforts on weaker zinc(II) binding groups (ZBG), like the 3,4-diaminobenzoic acid derivatives (DABA), we herein synthesized and biochemically evaluated analogues of nine potentially weak ZBGs, based on differential substitutions of functionalized
M1氨基肽酶的催产素酶亚家族由三个成员ERAP1,ERAP2和IRAP组成,这些成员起着重要的生物学作用,包括在驱动人类免疫应答的抗原肽的产生中发挥关键作用。它们代表了免疫系统药理学控制的新兴目标,尽管缺乏选择性抑制剂阻碍了这些努力。大多数以前探索的小分子结合剂通过与催化性锌(II)原子的强相互作用而靶向酶的活性位点,并且在获得增强的效价的同时,它们也具有选择性。继续我们先前对弱锌(II)结合基团(ZBG)(如3,4-二氨基苯甲酸衍生物(DABA))的研究,我们在此合成并通过生物化学方法评估了9种潜在的弱ZBG的类似物,基于官能化的吡啶酮和吡啶硫酮骨架,烟酸,异烟酸,氨基苯甲酸和肼基苯甲酸的差异取代。两种类似物与金属蛋白酶(MMP-12)的结晶学分析显示出意料之外的结合拓扑,与观察到的亲和力一致。我们的结果表明,该化合物作为ERAP1,ERAP2和IRAP抑制剂的效力主要是由占据活性位点的特异性口袋及其在酶中的正确方向决定的。