(2S,3S,5R)-3-(tert-butyldiphenylsilanyloxy)-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-tetrahydrofuran-2-carboxylic acid | 127244-82-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: (2S,3S,5R)-3-(tert-butyldiphenylsilanyloxy)-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-tetrahydrofuran-2-carboxylic acid
• 英文别名: (2S,3S,5R)-3-[tert-butyl(diphenyl)silyl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolane-2-carboxylic acid
• CAS: 127244-82-0
• 化学式: C₂₆H₃₀N₂O₆Si
• 分子量: 494.62
• InChiKey: KEJJUCOZPUDJDX-BDTNDASRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.16
• 重原子数：
  35
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  105
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2S,3S,5R)-3-(tert-butyldiphenylsilanyloxy)-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-tetrahydrofuran-2-carboxylic acid 在 N-甲基吗啉 、 吡啶 、 sodium hydroxide 、 四丁基氟化铵 、 氯甲酸异丁酯 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 27.5h， 生成 1-[(3'R,4'R)-2',5',6'-trideoxy-6'-(diethoxyphosphinyl)-β-hexofuranosyl]thymine
  参考文献：
  名称：

  糖，核苷和α-氨基酸膦酸酯的新合成。

  摘要：

  在膦酸乙烯基酯的存在下衍生自糖醛酸或α-氨基酸的N-羟基-2-硫代吡啶酮酯的光解得到相应的膦酸酯衍生物。描述了一种方便的合成AZT-5'单磷酸等位基因的途径。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(01)88721-4
• 作为产物：
  描述：

  5'-O-tritylthymidine 在 咪唑 、 ruthenium trichloride 、 氢氧化钾 、 dipotassium peroxodisulfate 、 氯化二乙基铝 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 (2S,3S,5R)-3-(tert-butyldiphenylsilanyloxy)-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-tetrahydrofuran-2-carboxylic acid
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of an oxyamide linked nucleotide dimer and incorporation into antisense oligonucleotide sequences

  摘要：

  两种胸苷的衍生物，5′-保护的3-羟胺和5′-羧基-3′-保护化合物，被制备并连接形成一个含有氧酰胺键的二核苷酸类似物；该二聚体被纳入一个寡脱氧核糖核酸中，随后显示出与自然序列具有几乎相同的结合亲和力，能够与互补DNA退火。

  DOI：

  10.1039/c39940000915

文献信息

• Preparation of 4‘-Substituted Thymidines by Substitution of the Thymidine 5‘-Esters
  作者：Michael E. Jung、Akemi Toyota

  DOI：10.1021/jo001223a

  日期：2001.4.1

  coupling constant analysis of both the initial compounds and the diols 6bcd prepared by ester reduction and by formation of the acetonides 7bc. The methyl ester of the 3'-epimer of thymidylic acid 9 was also prepared from thymidine 1 in nine steps and 74% overall yield. When the lithium trianion of 9 (prepared by treatment of 9 with excess LDA and then excess tert-butyllithum) is reacted with electrophiles

  由胸腺嘧啶核苷1分六步制备胸腺嘧啶叔丁酯3，总产率为67％。当3的三价锂离子（通过用过量的LDA处理3，然后用过量的叔丁基锂处理）与亲电试剂反应时，取决于亲电试剂，会从α面或β面立体选择性地发生捕集（方案1）。氘代甲醇中的氘代乙酸主要提供α-氘代产物（4a / 4b = 2.4：1），而所有其他亲电试剂，例如苯硒基氯，烯丙基溴和N-氟苯磺酰亚胺（NFSI），则主要（或完全）产生从beta脸攻击（5bcd / 4bcd = 3.7：1到100：0）。通过对初始化合物和通过酯还原制得的丙酮化物7bc形成的二醇6bcd的偶合常数分析，来确定产物的结构。胸苷酸9的3'-末端的甲酯也由胸腺嘧啶核苷1分九步制备，总产率为74％。当9的三价锂离子（通过用过量的LDA然后用过量的叔丁基锂处理9制备）与亲电试剂反应时，也会根据亲电试剂选择性地发生俘获，从而对α-或β面产生立体选择性的捕集（方案2） 。同样，
• A practical synthesis of benzyl esters and related derivatives
  作者：Mélanie Fauré-Tromeur、Samir Z Zard

  DOI：10.1016/s0040-4039(98)01563-9

  日期：1998.10

  Heating carboxylic acids with O-benzyl-S-propargyl xanthate in refluxing toluene gives the corresponding benzyl esters in high yield; other acidic substances such as tetrazoles and pyridinols are benzylated selectively under the same conditions.

  在回流的甲苯中，将羧酸与O-苄基-S-炔丙基黄原酸酯一起加热，得到相应的苄基酯，收率很高。在相同条件下，其他酸性物质（如四唑和吡啶醇）被选择性地苄基化。
• Stereocontrolled radical reactions in carbohydrate and nucleoside chemistry.
  作者：Derek H.R. Barton、Stephane D. Géro、Béatrice Quiclet-Sire、Mohammad Samadi

  DOI：10.1016/s0957-4166(00)86288-6

  日期：1994.11

  The radicals, generated by photolysis of 2,3-dimethyl ketals of N-hydroxy-2- thiopyridone uronic esters, reacted stereoselectively with electron deficient olefins leading to highly functionalised chain-elongated pentafuranosides, hexapyranosides and pentafuranosyl-nucleosides through the 4,5 and 4' radicals, respectively.
• Total Synthesis of the Thymidine Analogue of Sinefungin
  作者：Derek H. R. Barton、Stephan D. Gero、Guillerm Negron、Béatrice Quiclet-Sire、Mohammad Samadi、Claire Vincent

  DOI：10.1080/15257779508009744

  日期：1995.10

  The carbon skeleton of ''Sinethymidin'' 4 was constructed by two radical coupling reaction. The first step was a coupling of the radical derived from 2 and the unsaturated amide 5. The olefin 6 thus obtained was added to the radical derived from the known N-hydroxy-2-thiopyridinone aspartic ester. ''Sinethymidin'', tested for its antileismanial effect, was devoid of activity.
• Replacement of the phosphodiester linkage in oligonucleotides by an amide: Effect of backbone length on duplex stability with RNA complement
  作者：Alain De Mesmaeker、Chantal Jouanno、Romain M. Wolf、Sebastian Wendeborn

  DOI：10.1016/s0960-894x(97)00037-1

  日期：1997.2

  Five dimers containing amide linkages instead of the natural phosphodiester linkage were synthesized and incorporated into oligonucleotides. The length of the amide backbone was varied. The hybridization properties of the modified oligonucleotides with RNA complements and their conformational analysis are described and compared to previously reported amide containing oligonucleotides. In addition, the synthesis of a thioamide phosphoramidite dimer is reported. (C) 1997, Elsevier Science Ltd.