synthesized DNA-encoded libraries based on two representatives of these scaffolds, a benzodiazepine and a pyrazolopyrimidine, and additionally a third library based on propargyl glycine. All three core structures possess a carboxylic acid to couple them to aminolinker-modified DNA. For subsequent library synthesis they contained an amino function to which a set of carboxylic acid building blocks were coupled
药物样小分子的大型DNA编码文库的基于选择的筛选是鉴定
生物活性化合物的有效方法。在
生物活性化合物的
化学空间中,某些支架结构得到了很好的体现。这些通常称为“特权支架”。我们已经基于这些支架的两个代表,即苯二氮卓和
吡唑并
嘧啶,以及基于炔丙基甘
氨酸的第三个库,合成了DNA编码的库。所有三个核心结构均具有将其偶联至
氨基接头修饰的DNA的
羧酸。对于随后的文库合成,它们包含一个
氨基官能团,一组
羧酸构件与该
氨基官能团偶联,一个末端
炔烃与一组
叠氮化物反应以提供三唑。两组构建基块,在
化学信息学方法的帮助下选择了114种
羧酸和104种
叠氮化物,以控制最终文库的理化性质,去除不需要的亚结构并最大限度地提高多样性。一组构建基包含脱
硫生物素,可用于验证文库合成。通过分池合并
化学合成了DNA编码的文库,产生了三个包含28.254种化合物的文库。对于DNA条形码,将具有四个碱基突出端的5'-
磷酸化的双链编码DNA序列与