crotonyl-CoA | 992-67-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: crotonyl-CoA
• 英文别名: crotonoyl CoA；Butenoyl-Coenzyme A；crotonoyl-CoA；S-[2-[3-[[(2R)-4-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-3-phosphonooxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxy-2-hydroxy-3,3-dimethylbutanoyl]amino]propanoylamino]ethyl] (E)-but-2-enethioate
• CAS: 992-67-6；38795-21-0
• 化学式: C₂₅H₄₀N₇O₁₇P₃S
• 分子量: 835.617
• InChiKey: KFWWCMJSYSSPSK-PAXLJYGASA-N

物化性质

• 密度：
  1.82±0.1 g/cm3(Predicted)
• 物理描述：
  Solid

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.8
• 重原子数：
  53
• 可旋转键数：
  21
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  389
• 氢给体数：
  9
• 氢受体数：
  22

制备方法与用途

巴豆酰辅酶A是丁酸发酵、赖氨酸和色氨酸代谢过程中的重要中间体，在脂肪酸和氨基酸的代谢中也扮演着关键角色。[1]

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  crotonyl-CoA 在 enoyl-Co hydratase(L) 作用下， 生成 (S)-3-hydroxybutyryl-Coenzyme A
  参考文献：
  名称：

  动物组织脂肪酸氧化系统的研究。九。不饱和酰基CoA水解酶的立体特异性。

  摘要：

  DOI：

  10.1016/0006-3002(56)90473-5
• 作为产物：
  描述：

  pantetheine dimethyl ketal 在 CoaA, CoaD and CoaE enzymes were amplified from a colony of E_. coli BL₂₁(DE₃) 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 21.0h， 生成 crotonyl-CoA
  参考文献：
  名称：

  酰基辅酶A底物的化学酶法合成使小分子和蛋白质的原位标记成为可能。

  摘要：

  描述了一种化学酶促方法，其产生全功能的酰基辅酶A分子，然后将其用作底物以驱动原位酰基转移反应。还说明了基于质谱的测定法，以验证酰基辅酶A酶产物的身份。该方法响应于可以修饰为其相应的辅酶A硫酯的各种羧酸，在利用酰基辅酶A底物的广泛化学生物学研究中具有潜在的应用前景。

  DOI：

  10.1021/acs.orglett.5b02113

文献信息

• Characterization of Arylalkylamine <i>N</i>-Acyltransferase from <i>Tribolium castaneum</i>: An Investigation into a Potential Next-Generation Insecticide Target
  作者：Brian G. O’Flynn、Eric M. Lewandowski、Karin Claire Prins、Gabriela Suarez、Angelica N. McCaskey、Nasha M. Rios-Guzman、Ryan L. Anderson、Britney A. Shepherd、Ioannis Gelis、James W. Leahy、Yu Chen、David J. Merkler

  DOI：10.1021/acschembio.9b00973

  日期：2020.2.21

  short-chain acyl-CoAs (C2-C10), benzoyl-CoA, and succinyl-CoA functioning in the role of acyl donor. Recombinant TcAANAT0 was expressed and purified from E. coli and was used to investigate the kinetic and chemical mechanism of catalysis. The kinetic mechanism is an ordered sequential mechanism with the acyl-CoA binding first. pH-rate profiles and site-directed mutagenesis studies identified amino acids critical

  杀虫剂抗性问题日益严重，这意味着确定新的杀虫剂目标变得前所未有的重要。芳烷基胺 N-酰基转移酶 (AANATs) 已被建议作为潜在的新目标。这些混杂的酶参与生物胺的 N-酰化以形成 N-酰胺。在昆虫中，这个过程是黑色素、角质层硬化、生物胺去除和脂肪酸酰胺生物合成的关键步骤。表征的每个 AANAT 同种型的独特性质表明每个生物体都容纳了该生物体相对专有的离散 AANAT 组装。这意味着在杀虫剂设计中具有很高的选择性，同时也保持了多药性。此处介绍了对 AANAT 的全面动力学和结构分析，该分析在世界上所有植物商品中最常见的次生害虫之一 Tribolium castaneum 中发现。这种名为 TcAANAT0 的酶催化短链 N-酰基芳基烷基胺的形成，其中短链酰基辅酶 A (C2-C10)、苯甲酰辅酶 A 和琥珀酰辅酶 A 在酰基供体的作用下起作用。从大肠杆菌中表达和纯化重组 TcAANAT0，
• Stereospecific Formation of <i>E</i>- and <i>Z</i>-Disubstituted Double Bonds by Dehydratase Domains from Modules 1 and 2 of the Fostriecin Polyketide Synthase
  作者：Dhara D. Shah、Young-Ok You、David E. Cane

  DOI：10.1021/jacs.7b08896

  日期：2017.10.11

  shown to catalyze the NADPH-dependent stereospecific reduction of 3-ketobutyryl-FosACP2 (23) to (3S)-3-hydroxybutyryl-FosACP2 (8). Consistent with this finding, FosDH2 catalyzed the interconversion of the corresponding triketide substrates (3R,4E)-3-hydroxy-4-hexenoyl-FosACP2 (18) and (2Z,4E)-2,4-hexadienoyl-FosACP2 (21). FosDH2 also catalyzed the stereospecific hydration of (Z)-2-butenoyl-FosACP2 (14)

  邻苯二酚聚酮合酶（PKS）模块1的脱水酶结构域FosDH1催化了（3 R）-3-羟基丁酰-FosACP1（5）和（E）-2-丁烯酰基-FosACP1（11）的立体有择互变。直接LC-MS / MS和手性GC-MS的组合。FosDH1既不作用于（3 S）-3-羟基丁酰基-FosACP1（6）也不作用于（Z）-2-丁烯酰基-FosACP1（12）。研究显示，FosKR2是一种从邻苯二酸PKS的模块2还原而来的酮还原酶，通常可为FosDH2提供天然底物，该酶可催化NADPH依赖性的3-酮丁酰-FosACP2（23）立体定向还原至（3 S）-3-羟基丁酰基-FosACP2（8）。符合这一发现，FosDH2催化了相应的三酮化合物底物（3 R，4 E）-3-羟基-4-己烯酰基-FosACP2（18）和（2 Z，4 E）-2,4-己二烯酰基-FosACP2的相互转化（21）。FosDH2还催化了（Z）-
• Discovery and Engineering of Pathways for Production of α-Branched Organic Acids
  作者：Michael R. Blaisse、Hongjun Dong、Beverly Fu、Michelle C. Y. Chang

  DOI：10.1021/jacs.7b07400

  日期：2017.10.18

  branch using a propionyl-CoA extender unit. Engineering synthetic pathways for production of α-methyl acids in Escherichia coli using these enzymes allows the construction of microbial strains that produce either chiral 2-methyl-3-hydroxy acids (1.1 ± 0.2 g L-1) or branched enoic acids (1.12 ± 0.06 g L-1) in the presence of a dehydratase at 44% and 87% yield of fed propionate, respectively. In vitro characterization

  基于细胞的合成为从简单的可再生碳源制备小分子提供了许多机会，通过将多个反应伸缩到一个发酵步骤中。该领域的一个挑战是开发酶促碳-碳键形成循环，使目标结构模块化断开为细胞构建块。在这方面，基于硫解酶催化酰基辅酶 A (CoA) 底物之间初始碳-碳键形成步骤的合成途径为生物合成提供了通用途径，但目前此类途径的底物多样性有限。在本报告中，我们描述了参与蛔虫蛔虫中分支酸产生的硫解酶-酮还原酶对的鉴定和生化表征，这证明了使用丙酰辅酶 A 扩展单元形成具有 α-甲基支链的产物的选择性。使用这些酶在大肠杆菌中设计用于生产 α-甲基酸的工程合成途径，可以构建生产手性 2-甲基-3-羟基酸 (1.1 ± 0.2 g L-1) 或支链烯酸 (1.12 ± 0.06 g L-1) 在脱水酶的存在下，进料丙酸盐的产率分别为 44% 和 87%。体外表征和体内分析表明，酮还原酶是选择性的关键驱动因素，即使与高度偏爱无
• Establishing a Toolkit for Precursor-Directed Polyketide Biosynthesis: Exploring Substrate Promiscuities of Acid-CoA Ligases
  作者：Maybelle Kho Go、Jeng Yeong Chow、Vivian Wing Ngar Cheung、Yan Ping Lim、Wen Shan Yew

  DOI：10.1021/bi300425j

  日期：2012.6.5

  biosynthesized from acyl-CoA precursors by polyketide synthases. One of the limitations to combinatorial biosynthesis of polyketides has been the lack of a toolkit that describes the means of delivering novel acyl-CoA precursors necessary for polyketide biosynthesis. Using five acid-CoA ligases obtained from various plants and microorganisms, we biosynthesized an initial library of 79 acyl-CoA thioesters by screening

  聚酮化合物是化学上多样化且具有医学上重要意义的生物化学物质，它们是通过聚酮化合物合酶从酰基辅酶A前体生物合成的。聚酮化合物的组合生物合成的局限性之一是缺少工具包，该工具包描述了递送聚酮化合物生物合成所必需的新型酰基-CoA前体的方法。使用从各种植物和微生物中获得的5种酸性CoA连接酶，我们通过针对123种羧酸的文库筛选每种酸性CoA连接酶，生物合成了79种酰基CoA硫酯的初始文库。酰基-CoA硫酯库包括肉桂基-CoA，3-苯基丙酰基-CoA，苯甲酰基-CoA，苯乙酰基-CoA，丙二酰-CoA，饱和和不饱和脂族CoA硫酯和双环芳族CoA硫酯的衍生物。在我们对新型酰基辅酶A前体的生物合成路线的搜索中，我们发现了两种以前未报道过的丙二酰辅酶A衍生物（3-硫代苯丙氨酰辅酶A和苯基丙二酰辅酶A），无法通过规范的丙二酰辅酶A合成酶生产。该报告强调了确定常规底物池之外底物混杂的实用性和重要性，并描述了建
• Cloning, sequencing and characterization of the biosynthetic gene cluster of sanglifehrin A, a potent cyclophilin inhibitor
  作者：Xudong Qu、Nan Jiang、Fei Xu、Lei Shao、Gongli Tang、Barrie Wilkinson、Wen Liu

  DOI：10.1039/c0mb00234h

  日期：——

  for generation of the putative unusual PKS starter unit (2R)-2-ethylmalonamyl-CoA, an iterative type I PKS for the putative atypical extender unit (2S)-2-(2-oxo-butyl)malonyl-CoA and a phenylalanine hydroxylase for the NRPS extender unit (2S)-m-tyrosine. A spontaneous ketalization of significant note, may trigger spirolactam formation in a stereo-selective manner. This study provides a framework for the

  Sanglifehrin A（SFA）是由黄链霉菌DSM 9954生产的有效亲环素抑制剂，具有独特的[5.5]螺内酰胺部分，通过线性碳链与22元，高度官能化的大环内酯共轭。SFA具有多种生物活性，并具有巨大的治疗潜力。但是，SFA的结构复杂性对通过化学合成开发新的类似物构成了巨大的挑战。基于其生物合成来源的合理预测，在此我们报道了负责SFA生物合成的基因簇的克隆，测序和表征。对92 776 bp连续DNA区域的分析揭示了混合的聚酮化合物合酶（PKS）/非核糖体肽合成酶（NRPS）途径，其中包括异常PKS和NRPS构建模块形成的多种独特特征。我们的发现表明SFA的生物合成需要巴豆酰-CoA还原酶/羧化酶（CCR）来生成推定的不常见的PKS起始剂单元（2R）-2-乙基丙二酰-CoA，这是假定的非典型扩展剂单元（2S）的I型迭代PKS。 NRPS补充剂单元（2S）-m-酪氨酸的-2-（2-氧代丁