1,2-di-O-acetyl-3-O-benzyl-4-C-methanesulfonyloxymethyl-5-O-methanesulfonyl-L-threo-pentofuranose | 410076-93-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 1,2-di-O-acetyl-3-O-benzyl-4-C-methanesulfonyloxymethyl-5-O-methanesulfonyl-L-threo-pentofuranose
• 英文别名: 3-O-benzyl-1,2-di-O-acetyl-5-O-(methylsulfonyl)-4-C-(methylsulfonyloxymethyl)-α,β-L-threo-pentofuranose；3-O-benzyl-1,2-di-O-acetyl-4-C-mesyloxymethyl-5-O-mesyl-L-threo-pentofuranose；1,2-di-O-acetyl-3-O-benzyl-5-O-(methanesulfonyl)-4-C-[[(methanesulfonyl)oxy]methyl]-L-threo-pentofuranose；1,2-di-O-acetyl-5-O-methanesulfonyl-4-C-methanesulfonyloxymethyl-3-O-benzyl-L-threo-pentofuranose；[(3R,4R)-2-acetyloxy-5,5-bis(methylsulfonyloxymethyl)-4-phenylmethoxyoxolan-3-yl] acetate
• CAS: 410076-93-6
• 化学式: C₁₉H₂₆O₁₂S₂
• 分子量: 510.54
• InChiKey: ZEVFGCXHAWLZAT-OWZOALSMSA-N

物化性质

• 沸点：
  666.8±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.43±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0
• 重原子数：
  33
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.58
• 拓扑面积：
  175
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  12

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1,2-di-O-acetyl-3-O-benzyl-4-C-methanesulfonyloxymethyl-5-O-methanesulfonyl-L-threo-pentofuranose 在 吡啶 、 18-冠醚-6 、 氨 、 甲酸铵 、 四氯化锡 、 sodium hydride 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 甲苯 、 乙腈 为溶剂， 反应 96.5h， 生成 (1S,3R,4S,7R)-1-[[(4,4'-dimethoxytrityl)oxy]methyl]-7-hydroxy-3-(6-N-benzoyladenin-9-yl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane
  参考文献：
  名称：

  α-l-核糖构型锁定核酸 (α-L-LNA)：合成和性质

  摘要：

  单体核苷和 3'-O-亚磷酰胺结构单元的合成在生成 α-l-核糖构型锁核酸 (α-L-LNA) 的过程中，完全由 α-L-LNA 单体（α-l-核糖核酸）组成构型）或 α-L-LNA 和 DNA 单体的混合物（β-d-核糖构型），进行了描述，并研究了 α-L-LNA 低聚物。已制备双环 5-甲基胞嘧啶-1-基和腺嘌呤-9-基核苷衍生物，亚磷酰胺方法已用于自动寡聚化，从而产生 α-L-LNA 寡聚体。结合研究表明可以非常有效地识别单链 DNA 和 RNA 靶寡核苷酸链。因此，包含 α-L-LNA 单体和 DNA 单体混合物（“mix-mer α-L-LNA”）的立体不规则 α-L-LNA 11-mers 显示每次修改的 ΔTm 值为 +1 至 +3 °C与相应的未修饰 DNA·DNA 和 DNA·RNA 参考双链体相比，DNA 和 +4 至 +5°C 的 RNA。立体规则 f 每次修改的相应

  DOI：

  10.1021/ja0168763
• 作为产物：
  描述：

  3-O-benzyl-5-O-(methanesulfonyl)-4-C-[[(methanesulfonyl)oxy]methyl]-1,2-O-isopropylidene-β-L-threo-pentofuranose 在 吡啶 作用下， 反应 7.0h， 生成 1,2-di-O-acetyl-3-O-benzyl-4-C-methanesulfonyloxymethyl-5-O-methanesulfonyl-L-threo-pentofuranose
  参考文献：
  名称：

  α-l-核糖构型锁定核酸 (α-L-LNA)：合成和性质

  摘要：

  单体核苷和 3'-O-亚磷酰胺结构单元的合成在生成 α-l-核糖构型锁核酸 (α-L-LNA) 的过程中，完全由 α-L-LNA 单体（α-l-核糖核酸）组成构型）或 α-L-LNA 和 DNA 单体的混合物（β-d-核糖构型），进行了描述，并研究了 α-L-LNA 低聚物。已制备双环 5-甲基胞嘧啶-1-基和腺嘌呤-9-基核苷衍生物，亚磷酰胺方法已用于自动寡聚化，从而产生 α-L-LNA 寡聚体。结合研究表明可以非常有效地识别单链 DNA 和 RNA 靶寡核苷酸链。因此，包含 α-L-LNA 单体和 DNA 单体混合物（“mix-mer α-L-LNA”）的立体不规则 α-L-LNA 11-mers 显示每次修改的 ΔTm 值为 +1 至 +3 °C与相应的未修饰 DNA·DNA 和 DNA·RNA 参考双链体相比，DNA 和 +4 至 +5°C 的 RNA。立体规则 f 每次修改的相应

  DOI：

  10.1021/ja0168763

文献信息

• [EN] SYNTHESIS OF LOCKED NUCLEIC ACID DERIVATIVES<br/>[FR] SYNTHÈSE DE DÉRIVÉS D'ACIDES NUCLÉIQUES LNA
  申请人：SANTARIS PHARMA AS

  公开号：WO2003095467A1

  公开（公告）日：2003-11-20

  The invention relates to a novel strategy for the synthesis of Locked Nucleic Acid derivatives, such as α-L-oxy-LNA, amino-LNA, α-L-amino-LNA, thio-LNA, α-L-thio-LNA, seleno-LNA and methylene LNA, which provides scalable high yielding reactions utilising intermediates that also can produce other LNA analogues such as oxy-LNA. Also, the compounds of the formula X are important intermediates that may be reacted with varieties of nucleophiles leading to a wide variety of LNA analogues. (Formula I)

  该发明涉及一种用于合成锁定核酸衍生物的新策略，例如α-L-氧基-LNA、氨基-LNA、α-L-氨基-LNA、硫基-LNA、α-L-硫基-LNA、硒基-LNA和亚甲基-LNA，该策略利用中间体进行可扩展高产率反应，这些中间体还可以产生其他LNA类似物，如氧基-LNA。此外，式X的化合物是重要的中间体，可以与多种亲核试剂发生反应，从而形成各种LNA类似物。
• XNA (xylo Nucleic Acid): A Summary and New Derivatives
  作者：B. Ravindra Babu、Raunak、Nicolai E. Poopeiko、Martin Juhl、Andrew D. Bond、Virinder S. Parmar、Jesper Wengel

  DOI：10.1002/ejoc.200500023

  日期：2005.6

  furanose conformation. Besides, an efficient synthesis of known xylo-LNA phosphoramidite 19, required for the incorporation of 1-(2'-O,4'-C-methylene-β-D-xylofuranosyl)thymine (monomer L) is described. For comparison, hydridization data of various XNAs reported in the literature are included in the discussion section. The thermal denaturation studies show that XNAs containing conformationally locked

  完全修饰的同型嘧啶 2'-脱氧-木核酸 (dXNA) 与互补的 DNA/RNA 形成三螺旋，其热稳定性与相应的 DNA:DNA 和 DNA:RNA 双链体的热稳定性相当。然而，在 DNA 链中插入单个或几个 dXNA 单体会显着降低双链体的稳定性。已知 dXNA 单体在溶液中主要采用 N 型呋喃糖构象。为了提高结合亲和力，已经合成了七种糖修饰的 XNA 单体（H、F、N、M、K、P 和 Q），并研究了它们对 DNA 和 RNA 互补物杂交的影响。预计引入 2'-氟和 2'-羟基取代基会导致对衍生自 1-(2'-deoxy-2' 的单体 F 的 C3'-内型呋喃糖构象的构象限制 -氟-β-D-呋喃木糖基）胸腺嘧啶和衍生自 1-（β-D-呋喃木糖基）胸腺嘧啶的单体 H。存在面向小沟的官能团，如 1-(2'-amino-2'-deoxy-2'-N,4'-C-methylene-β-D-xylofuranosyl)thymine
• Synthesis and Characterization of Oligodeoxyribonucleotides Modified with 2′-Amino-α-<scp>l</scp>-LNA Adenine Monomers: High-Affinity Targeting of Single-Stranded DNA
  作者：Nicolai K. Andersen、Brooke A. Anderson、Jesper Wengel、Patrick J. Hrdlicka

  DOI：10.1021/jo4022937

  日期：2013.12.20

  acid targets, improved binding specificity, and enhanced enzymatic stability relative to unmodified strands. Here we present the synthesis and biophysical characterization of oligodeoxyribonucleotides (ONs) modified with 2′-amino-α-l-LNA adenine monomers W–Z. The synthesis of the target phosphoramidites 1–4 is initiated from pentafuranose 5, which upon Vorbrüggen glycosylation, O2′-deacylation, O2′-activation

  由于在反义、反基因和其他基因靶向策略中的成功应用，构象受限核苷酸构建模块的开发继续吸引着相当大的兴趣。锁核酸 (LNA) 及其非对映异构体 α- 1- LNA 是其中两个有趣的例子。相对于未修饰的链，用这些单元修饰的寡核苷酸显示出对核酸靶标的极大增加的亲和力、改进的结合特异性和增强的酶稳定性。在这里，我们展示了用 2'-氨基-α - l - LNA 腺嘌呤单体W - Z修饰的寡脱氧核糖核苷酸 (ON) 的合成和生物物理表征。目标亚磷酰胺的合成1 –4从五呋喃糖5 开始，在 Vorbrüggen 糖基化、O2'-脱酰化、O2'-活化和 C2'-叠氮化物引入后产生核苷8。一锅串联施陶丁格/分子内亲核取代将8转化为 2'-氨基-α - l -LNA 腺嘌呤中间体9，经过一系列非平凡的保护基操作后提供关键中间体15。随后的化学选择性N2'官能化和O3'-亚磷酸化给予目标1 - 4在~1-3％的总收率从超过11个步骤5。用芘功能化的
• Synthesis and Biological Evaluation of 2-oxo-pyrazine-3-carboxamide-yl Nucleoside Analogues and Their Epimers as Inhibitors of Influenza A Viruses
  作者：Jingjing Gao、Xianjin Luo、Yuhuan Li、Rongmei Gao、Haifeng Chen、Dingjue Ji

  DOI：10.1111/cbdd.12382

  日期：2015.3

  Novel 2‐oxo‐pyrazine‐3‐carboxamide‐yl nucleoside analogues and their epimers were designed, synthesized and evaluated for their activities against influenza A viruses H1N1 and H3N2 in Madin‐Darby canine kidney cells. All the compounds showed low cytotoxicities in these anti‐influenza tests. One of the epimers, 4‐[(1S, 3R, 4R, 7R)‐7‐hydroxy‐1‐(hydroxymethyl)‐2,5‐dioxabicyclo[2.2.1]heptan‐3‐yl]‐3‐oxo‐3

  设计，合成并评估了新型2-氧-吡嗪-3-羧酰胺基核苷类似物及其差向异构体在Madin-Darby犬肾细胞中对抗甲型流感病毒H1N1和H3N2的活性。在这些抗流感测试中，所有化合物均显示出低细胞毒性。差向异构体之一，4 ‐ [（（1S，3R，4R，7R）‐7‐羟基‐1‐（羟甲基）‐2,5‐二氧杂双环[2.2.1]庚烷‐3‐yl] ‐3‐oxo‐3 ，4-二氢吡嗪-2-甲酰胺8一个，具有高的抗病毒活性（IC 50  = 7.41，5.63  μ米为 和H1N1，分别地）和显着的低细胞毒性（TC 50  > 200  μ米），具有进一步发展的潜力很大作为一种新型的抗甲型流感药物。化合物的分子对接进行了8a依赖RNA的RNA聚合酶的研究，以了解这些抑制剂与RdRp活性位点之间的结合模式并合理化一些SAR。
• Conformationally restricted triplex-forming oligonucleotides (TFOs). Binding properties of α-l-LNA and introduction of the N7-glycosylated LNA-guanosine
  作者：Alexei A. Koshkin

  DOI：10.1016/j.tet.2006.04.016

  日期：2006.6

  The method for scaled-up production of alpha-L-LNA phosphoramidite building blocks containing thymine and 5-methylcytosine nucleobases is described. Binding properties of pyrimidine TFOs modified with alpha-L-LNA are reported. In contrast to LNA TFOs, the fully modified a-L-LNA forms a stable triplex with a model DNA duplex. Pyrimidine DNA/LNA/alpha-L-LNA chimeras also efficiently hybridize with a model DNA duplex in the parallel mode. LNA nucleoside containing unnatural N-7-glycosylated guanine (LNA-(7) G) was synthesized by a convergent method and incorporated into LNA oligonucleotides. The triplex-forming alternating DNA/LNA oligonucleotides containing a single LNA-(7) G modification instead of internal LNA-mC demonstrate improved pH-dependent properties. The single LNA-(7) G modification can also discriminatively reduce competitive binding of TFOs to natural nucleic acids in the antiparallel duplex mode. (c) 2006 Elsevier Ltd. All rights reserved.