1-[(2R,4S,5R)-4-羟基-5-(羟基甲基)四氢噻吩-2-基]-5-甲基嘧啶-2,4-二酮 | 134111-33-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 核苷和核苷酸类似物
• 中文名称: 1-[(2R,4S,5R)-4-羟基-5-(羟基甲基)四氢噻吩-2-基]-5-甲基嘧啶-2,4-二酮
• 英文名称: 4'-thiothymidine
• 英文别名: 1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)thiolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 134111-33-4
• 化学式: C₁₀H₁₄N₂O₄S
• 分子量: 258.298
• InChiKey: IVUDHNYLTWOARV-XLPZGREQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.4
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  115
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-[(2R,4S,5R)-4-羟基-5-(羟基甲基)四氢噻吩-2-基]-5-甲基嘧啶-2,4-二酮 在 N,N-二乙基(2-氯-1,1,2-三氟乙基)胺 、 叠氮化锂 、 氯化铵 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 18.5h， 生成 3'-azido-3'-deoxy-4'-thiothymidine
  参考文献：
  名称：

  一些4'-硫代-2'-脱氧核苷类似物的合成和抗病毒活性。

  摘要：

  从苄基3,5-二-O-苄基-2-脱氧-1,4-二硫代-D-赤藓基呋喃呋喃糖苷（4）开始，合成了以下2'-脱氧核苷类似物：4'-硫代胸苷（8 ），3′-叠氮基-4′-硫代脱氧胸苷（10）和（E）-5-（2-溴乙烯基）-4′-硫代2′-脱氧尿苷（22）。第一种化合物是有毒的，第二种化合物是无毒的，也没有可检测的生物学活性，第三种化合物是无毒的，并且对某些疱疹病毒具有显着的活性。

  DOI：

  10.1021/jm00113a016
• 作为产物：
  描述：

  胸腺嘧啶 在 4-二甲氨基吡啶 、 偶氮二异丁腈 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 四丁基氟化铵 、 三正丁基氢锡 、 溶剂黄146 、 三乙胺 、 甲胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 甲苯 、 乙腈 为溶剂， 反应 7.67h， 生成 1-[(2R,4S,5R)-4-羟基-5-(羟基甲基)四氢噻吩-2-基]-5-甲基嘧啶-2,4-二酮
  参考文献：
  名称：

  Practical Synthesis of 2‘-Deoxy-4‘-thioribonucleosides:  Substrates for the Synthesis of 4‘-ThioDNA

  摘要：

  [GRAPHIC]We report herein a practical synthesis of 4'-thiothymidine (15) and appropriately protected 2'-deoxy-4'-thiocytidine (16), -thioadenosine (27), and -thioguanosine (29) derivatives, substrates for the synthesis of 4'-thioDNA, from the corresponding 4'-thioribonucleosides. 2'-Deoxy-4'-thiopyrimidine nucleosides were synthesized using a radical reaction of the corresponding 2'-alpha-bromo derivatives, which were prepared via 2,2'-O-anhydro derivatives. 2'-Deoxy-4'-thiopurine nucleosides were synthesized using the same radical reaction of the corresponding 2'-beta-bromo derivatives.

  DOI：

  10.1021/jo051248f

文献信息

• Compounds and oligomeric compounds comprising novel nucleobases
  申请人：——

  公开号：US20040033973A1

  公开（公告）日：2004-02-19

  The present invention relates to nucleoside compositions comprising novel nucleobases and oligomeric compounds comprising at least one such nucleoside. These oligomeric compounds typically have enhanced binding affinity properties compared to oligomeric compounds without the modification. The oligomeric compounds are useful, for example, for investigative and therapeutic purposes.

  本发明涉及包含新型核碱基的核苷酸组合物以及包含至少一种此类核苷酸的寡聚合物化合物。这些寡聚合物化合物通常具有比没有这种修饰的寡聚合物化合物更强的结合亲和性能。这些寡聚合物化合物可用于调查和治疗等用途。
• Synthesis and anti-HIV activity of 4'-thio-2',3'-dideoxynucleosides
  作者：John A. Secrist、Robert M. Riggs、Kamal N. Tiwari、John A. Montgomery

  DOI：10.1021/jm00081a015

  日期：1992.2

  series of 2',3'-dideoxy-4'-thionucleoside analogues of purines and pyrimidines, including 4'-thioddI (17), 4'-thioddC (27), and 4'-thioAZT (34), were synthesized and evaluated for their inhibitory activity against human immunodeficiency virus (HIV). A stereospecific synthesis of the 2,3-dideoxy-4-thioribofuranosyl carbohydrate precursor 11 starting with L-glutamic acid is described. 2',3'-Dideoxy-4'-thiocytidine

  合成了一系列嘌呤和嘧啶的2'，3'-二脱氧-4'-硫代核苷类似物，包括4'-thioddI（17），4'-thioddC（27）和4'-thioAZT（34），并评估其对人类免疫缺陷病毒（HIV）的抑制活性。描述了以L-谷氨酸为起始的2，3-二脱氧-4-硫代呋喃呋喃糖基碳水化合物前体11的立体有择合成。2'，3'-Dideoxy-4'-thiocytidine（27）在体外对人免疫缺陷病毒显示出显着但适度的活性。
• Highly efficient syntheses of [methyl-11C]thymidine and its analogue 4′-[methyl-11C]thiothymidine as nucleoside PET probes for cancer cell proliferation by Pd0-mediated rapid C-[11C]methylation
  作者：Hiroko Koyama、Siqin、Zhouen Zhang、Kengo Sumi、Yuma Hatta、Hiroko Nagata、Hisashi Doi、Masaaki Suzuki

  DOI：10.1039/c0ob01249a

  日期：——

  then [11C]CH3I) with excess 5-tributylstannyl-2′-deoxyuridine and -4′-thio-2′-deoxyuridine were investigated for the syntheses of [methyl-11C]thymidine and its stable analogue, 4′-[methyl-11C]thiothymidine as PET probes for cancer diagnosis. The previously reported conditions were attempted using Pd2(dba)3/P(o-CH3C6H4)3 (1 : 4 in molar ratio) at 130 °C for 5 min in DMF, giving desired products only in

  Pd 0介导的CH 3 I（然后是[ 11 C] CH 3 I）与过量的快速偶联5-三丁基锡烷基-2'-脱氧尿苷和-4'-硫代-2'-脱氧尿苷进行了调查[甲基的合成11 C]胸腺嘧啶脱氧核苷及其稳定类似物，4' - [甲基- 11 C]硫代胸苷作为PET探针用于癌症诊断。在DMF中于130°C下使用Pd 2（dba）3 / P（o -CH 3 C 6 H 4）3（摩尔比为1：4 ）尝试5分钟，仅在32和30％的收益率。因此，我们调整了实验室中针对杂芳族化合物开发的当前反应条件。使用CH 3 I /锡烷/ Pd 2（dba）3 / P（o在80°C下生成-CH 3 C 6 H 4）3 / CuCl / K 2 CO 3（1：25：1：32：2：5）胸苷收率达85％。而CH 3 I /锡烷/ Pd 2（dba）3 / P（o -CH 3 C 6 H 4）3 / CuBr / CsF（1：25：1：32：2：5），包括另一个CuBr
• The Synthesis and Biological Activity of Certain 4'-Thionucleosides
  作者：John Secrist、William Parker、Kamal Tiwari、Lea Messini、Sue Shaddix、Lucy Rose、L. Lee Bennett、John Montgomery

  DOI：10.1080/15257779508012449

  日期：1995.5.1

  Abstract Results are presented on the synthesis and biological activity of several types of 4′-thionucleosides as potential anticancer agents. Detailed studies on the mechanism of action of 4′-thiothymidine are also presented.

  摘要介绍了几种类型的4'-硫代核苷作为潜在抗癌剂的合成和生物学活性。还介绍了有关4'-硫代胸苷的作用机理的详细研究。
• Kinetic parameters and recognition of thymidine analogues with varying functional groups by thymidine phosphorylase
  作者：Akihiko Hatano、Aiko Harano、Yoshikatsu Takigawa、Yasuhiro Naramoto、Keisuke Toda、Yuuichi Nakagomi、Hideyuki Yamada

  DOI：10.1016/j.bmc.2008.01.038

  日期：2008.4.1

  The replacement of 3'-OH of thymidine markedly influenced its catalytic activity with TP. The conversion of pyrimidine nucleosides with modified base moieties to the corresponding 1-phosphate form was poor. The leaving group activity decreased with an increase in aromaticity of the pyrimidine base moiety, because of increased difficulty in polarizing the base by the amino acids local to the active site

  胸苷磷酸化酶（TP，EC 2.4.2.4）通过碱基和核糖基部分均以高特异性识别底物的结构。胸苷的3'-OH取代显着影响TP的催化活性。具有修饰的碱基部分的嘧啶核苷向相应的1-磷酸酯形式的转化很差。离开基团的活性随着嘧啶碱基部分的芳香性的增加而降低，这是因为增加了通过活性位点局部氨基酸使碱基极化的难度。3'和5'官能团的替换趋于降低反应速率和TP转化率。特别地，核糖基3'羟基在结构上对于酶与底物的结合是重要的。