3'-deoxy-N⁶,2'-O-bis[2-(p-nitrophenyl)ethoxicarbonyl]adenosine | 97776-94-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 3'-deoxy-N⁶,2'-O-bis[2-(p-nitrophenyl)ethoxicarbonyl]adenosine
• 英文别名: [(2R,3R,5S)-5-(hydroxymethyl)-2-[6-[2-(4-nitrophenyl)ethoxycarbonylamino]purin-9-yl]oxolan-3-yl] 2-(4-nitrophenyl)ethyl carbonate
• CAS: 97776-94-8
• 化学式: C₂₈H₂₇N₇O₁₁
• 分子量: 637.563
• InChiKey: WNAZVJZMDWOLAM-VVZHRXSXSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3
• 重原子数：
  46
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  239
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  14

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3'-deoxy-N⁶,2'-O-bis[2-(p-nitrophenyl)ethoxicarbonyl]adenosine 在 4-二甲氨基吡啶 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 吡啶 为溶剂， 反应 41.0h， 生成 4-O-[[(2S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxyoxolan-2-yl]methyl] 1-O-[(2E,4E,6E,8E)-3,7-dimethyl-9-(2,6,6-trimethylcyclohexen-1-yl)nona-2,4,6,8-tetraenyl] butanedioate
  参考文献：
  名称：

  核苷。第LX部分。虫草素-维生素和虫草素-脂质缀合物的单体模型分子的合成和表征，可共轭和潜在抑制HIV-1复制的生物可降解酯和碳酸盐键† ‡

  摘要：

  单体3'-脱氧腺苷（虫草品）在被修改的2'- ø - （13-18）和5'- ø -位（25-29）由维生素E，d 2，以及A和由两个类脂1经由琥珀酸酯或碳酸酯键的1，2-二-O-棕榈酰甘油和1，2-二-O-十六烷基甘油。碱不稳定的缀合物提供保护基团，例如2-（4-硝基-苯基）乙氧基羰基（npeoc）和单甲氧基三苯甲基（MeOTr），这些保护基团可分别裂解而不损害酯键和碳酸酯键。虫草素和维生素E，维生素d的单体结合物2，1,2-二- ø -palmitoylglycerol，和1,2-二- ö-hexadecylglycerol（参见13，14，17，18，25，26，28，和29）抑制HIV-1诱导的合胞体形成1.7至6.2倍相比1.5倍的虫草品（见表）; 25和28的IC 50值分别为257和267m̈M。此外，单体虫草素-维生素和脂质结合物可抑制HIV-1 RT活性28-49％，而虫草素对HIV-1

  DOI：

  10.1002/hlca.19960790304
• 作为产物：
  描述：

  [(2R,3R,5S)-5-[[(4-methoxyphenyl)-diphenylmethoxy]methyl]-2-[6-[2-(4-nitrophenyl)ethoxycarbonylamino]purin-9-yl]oxolan-3-yl] 2-(4-nitrophenyl)ethyl carbonate 生成 3'-deoxy-N⁶,2'-O-bis[2-(p-nitrophenyl)ethoxicarbonyl]adenosine
  参考文献：
  名称：

  CHARUBALA, RAMAMURTHY;UHLMANN, EUGEN;HIMMELSBACH, FRANK;PFLEIDERER, WOLFG+, HELV. CHIM. ACTA, 70,(1987) N 8, 2028-2038

  摘要：

  DOI：

文献信息

• Nucleotides. Part XXVIII. Chemical syntheses of the 2?-5?-cordycepin-trimer core
  作者：Ramamurthy Charubala、Eugen Uhlmann、Frank Himmelsbach、Wolfgang Pfleiderer

  DOI：10.1002/hlca.19870700808

  日期：1987.12.16

  The chemical synthesis of 3′-deoxyadenyly-(2′-5′)-3′-deoxyadenylyl-(2′-5′)-3′-deoxyadenosine (30; trimeric cordycepin) is described by three different routes using various protecting groups and applying the phosphotriester approach. The intermediates have been isolated and characterized by elemental analyses and spectroscopic means. High yields of 30 have been obtained on deprotection making this biologically

  3'-脱氧腺苷-（2'-5'）-3'-脱氧腺苷基-（2'-5'）-3'-脱氧腺苷（30；三聚虫草素）的化学合成通过使用不同保护基团的三种不同途径进行描述并应用磷酸三酯方法。中间体已通过元素分析和光谱学手段进行了分离和表征。通过脱保护获得了高收率的30，使得该具有生物学活性的化合物可以制备规模获得。
• Nucleotides. Part LIII. 6-Aminohexanoyl-linked conjugates of monomeric and trimeric cordycepin
  作者：Marita Wasner、Wolfgang Pfleiderer、Robert J. Suhadolnik、Susan E. Horvath、Ning Kon、Ming-Xu Guan、Earl E. Henderson、Martin E. Adelson

  DOI：10.1002/hlca.19970800405

  日期：1997.6.30

  To improve cell permeability, monomeric 3′-deoxyadenosine (cordycepin) and antivirally active trimeric 3′-deoxyadenylyl-(2′–5′)-3′-deoxyadenylyl-(2′–5′)-3′-deoxyadenosine (2′–5′)d3 (A-A-A); (cordycepin-trimer core) were modified at the 2′-O- or 5′-O-position by myristic, cholic, and folic acid = tetradecanoic, 3α, 7α, 12α -trihy-droxy-5β-cholan-24-oic, and N-4-[(2-amino-3,4-dihydro-4-oxopteridin

  为了提高细胞通透性，单体3'-脱氧腺苷（cordycepin）和抗病毒活性三聚体3'-脱氧腺苷基-（2'-5'）-3'-脱氧腺苷基-（2'-5'）-3'-脱氧腺苷（2' –5′）d 3（AAA）；（虫草素三聚体核心）在所述2'-修饰ø -或5'- ø由肉豆蔻酸，胆酸，和叶酸=十四烷，3α，7α位上，12α-trihy-羟基- 5β胆-24- ，和分别通过6-氨基六酰基间隔基连接的N- 4-[（（2-氨基-3,4-二氢-4-氧蝶呤-6-6基）甲基]氨基}苯甲酰基} -L-谷氨酸。三聚体的离析物的合成21，27，和28通过亚磷酰胺化学反应，使用β-消除的2-（4-硝基苯基）乙基（npe），2-（4-硝基苯基）乙氧基羰基（npeoc）和（9 H-芴-9-基）甲氧基羰基（fmoc）基团进行允许在非质子传递溶剂中用DBU进行脱保护而不会损害与酯结合的结合物，得到产物24 – 26和31 – 33
• Nucleotides. Part XLVI. The synthesis of phospholipid conjugates of antivirally active nucleosides by the improved phosphoramidite methodology
  作者：Harald Sigmund、Wolfgang Pfleiderer

  DOI：10.1002/hlca.19960790210

  日期：1996.3.20

  respectively. These protected nucleosides and the 3′-azido-3′-de-oxythymidine (6) reacted with newly synthesized and properly characterized lipid-phosphoramidites 21–25, catalyzed by 1H-tetrazole, to the corresponding nucleoside-phospholipid conjugates 26–38 in high yield. The deprotection was accomplished via β-elimination with 1,8-diazabicyclo[5.4.0]undec-7-ene (DBU) in aprotic solvents to give analytically

  将改进的亚磷酰胺策略用于使用β-消除保护基团合成寡核苷酸到磷脂化学中的应用为合成AZT（6）和虫草素的磷脂结合物提供了可能性。3'-叠氮基-3'-脱氧胸腺嘧啶核苷（6）的合成是通过一种新的分离方法完成的，无需色谱纯化步骤，总产率为50％。保护虫草素（= 3'-脱oxyadenosine）衍生物，该Ñ 6，2,2'-双[2-（4-硝基苯基）乙氧基羰基]虫草素（12）和所述Ñ 6，5'-双[2-（4-硝基苯]乙氧基羰基] cordycepin（13）通过已知方法制备，并直接将N酰化6- [2-（4-硝基苯基）乙氧基羰基] cordycepin（9）。这些受保护的核苷和3'-叠氮基-3'-脱oxythymidine（6）与反应新合成的和正确表征的脂质-亚磷酰胺21-25，由1个催化ħ四唑，为相应的核苷的缀合物的磷脂26-38高产。脱保护作用是通过在质子惰性溶剂中用1,8-二氮杂双环[5.4.0]
• Nucleotides. Part IL. Synthesis and Characterization of Cordycepin-Trimer-Vitamin and -Lipid Conjugates Potential Inhibitors of HIV-1 Replication
  作者：Marita Wasner、Wolfgang Pfleiderer、Robert J. Suhadolnik、Susan E. Horvath、Ning Kon、Ming-Xu Guan、Earl E. Henderson、Martin E. Adelson、Earl E. Henderson、Robert J. Suhadolnik

  DOI：10.1002/hlca.19960790305

  日期：1996.5.8

  that inhibit HIV-1-induced syncytia formation with IC50 values of 7, 18, and 24 m̈M for 39, 29, and 42, respectively, and inhibit HIV-1 reverse transcriptase (RT) activity from 14 to 96% (see Table). Of the nine conjugates tested, inhibition of HIV-1 replication by 28, 29, 32, 40, and 42 may be attributed in part to the activation of the RNase L/PKR antiviral pathways. Trimer conjugate 42 showed the greatest

  抗病毒活性3'-脱氧腺烯基-（2'-5'）-3'-脱氧腺烯基-（2'-5'的可生物降解的2'-和5'-酯和2'-和5'-碳酸酯结合物的合成首先通过制备获得具有维生素E，D 2和A以及脂质1,2-二-O-棕榈酰甘油和1,2-二-O-十六烷基甘油的）-3'-脱氧腺苷（cordycepin-三聚体核心）三聚体离析物19-21（方案1）。其次，这些物质通过琥珀酸酯或碳酸盐连接基与亲脂性残基缩合，然后通过β-消除npeoc和npe保护基团进行脱保护，并进行酸处理以进行去三苯甲基化反应，而不会分别损害酯和碳酸盐的功能（方案2）。代谢稳定的虫草素-三聚体的维生素和-脂质共轭物是一类新生物缀合物的抑制HIV-1的诱导的合胞体形成的IC 50个值的7，18，和24毫米为39，29，和42，分别和禁止HIV-1逆转录酶（RT）活性从14％上升到96％（请参阅表）。在测试的九种结合物中，HIV-1复制受到28、
• Nucleotides. Part XLIV. Synthesis, characterization, and biological activity of monomeric and trimeric cordycepin-cholesterol conjugates and inhibition of HIV-1 replication
  作者：Marita Wasner、Wolfgang Pfleiderer、Earl E. Henderson、Robert J. Suhadolnik

  DOI：10.1002/hlca.19940770707

  日期：1994.11.2

  bonds of the conjugate trimers. The syntheses were performed in solution using phosphoramidite chemistry. The fully protected trimer conjugates 13, 14, and 26 as well as all intermediates were characterized by elemental analyses, UV and 1H-NMR spectra. The deblocked conjugates 15, 16, and 27 were pure according to HPLC and showed the correct compositions by mass spectra. Comparative biological studies indicated

  抗病毒活性3'-脱氧腺苷基-（2'-5'）-3'-脱氧腺苷基-（2'-5'）-3'-脱氧腺苷（cordycepin三聚体核心）在2'-或5'-末端修饰通过经由碳酸酯键（15）或琥珀酸酯连接子（16和27）附着胆固醇来改善细胞通透性。相应的单体结合物4，7，和21虫草素制备成模型物质，研究预期的保护基团的适用性-的单甲氧（MeOTr）时，（叔-丁基）二甲基甲硅烷基（tbds），以及消除β-的2-（4-硝基苯基）乙基（npe）和2-（4-硝基苯基）乙氧羰基（npeoc）基团–用于最后的脱保护步骤，而不会损害酯的酯键共轭三聚体。使用亚磷酰胺化学方法在溶液中进行合成。完全保护的三聚体缀合物13，14，和26通过元素分析，UV和以及所有中间体进行了表征1 H-NMR光谱。解块缀合物15，16，和27根据HPLC是纯粹的，并显示通过质谱正确组合物。比较生物学研究表明，虫草素胆固醇共轭三聚体16和27分