3'-deoxy-5'-O-monomethoxytrityl-6-N-[2-(4-nitrophenyl)-ethoxycarbonyl]-adenosine | 97776-92-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 3'-deoxy-5'-O-monomethoxytrityl-6-N-[2-(4-nitrophenyl)-ethoxycarbonyl]-adenosine
• 英文别名: 2-(4-nitrophenyl)ethyl N-[9-[(2R,3R,5S)-3-hydroxy-5-[[(4-methoxyphenyl)-diphenylmethoxy]methyl]oxolan-2-yl]purin-6-yl]carbamate
• CAS: 97776-92-6
• 化学式: C₃₉H₃₆N₆O₈
• 分子量: 716.75
• InChiKey: XVBXWQIJQPGRJZ-QUBOUHRKSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.5
• 重原子数：
  53
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.23
• 拓扑面积：
  176
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3'-deoxy-5'-O-monomethoxytrityl-6-N-[2-(4-nitrophenyl)-ethoxycarbonyl]-adenosine 在 吡啶 作用下， 反应 17.0h， 生成 3'-deoxy-5'-O-(monomethoxytrityl)-N⁶-<2-(p-nitrophenyl)ethoxycarbonyl>adenosine 2'-<2,5-dichlorphenyl 2-(p-nitrophenyl)ethyl phosphate>
  参考文献：
  名称：

  核苷酸。第二十八部分。2'-5'-cordycepin-trimer核的化学合成†

  摘要：

  3'-脱氧腺苷-（2'-5'）-3'-脱氧腺苷基-（2'-5'）-3'-脱氧腺苷（30；三聚虫草素）的化学合成通过使用不同保护基团的三种不同途径进行描述并应用磷酸三酯方法。中间体已通过元素分析和光谱学手段进行了分离和表征。通过脱保护获得了高收率的30，使得该具有生物学活性的化合物可以制备规模获得。

  DOI：

  10.1002/hlca.19870700808
• 作为产物：
  描述：

  虫草素 在 硫酸氢铵 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 吡啶 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 39.0h， 生成 3'-deoxy-5'-O-monomethoxytrityl-6-N-[2-(4-nitrophenyl)-ethoxycarbonyl]-adenosine
  参考文献：
  名称：

  核苷酸。第二十八部分。2'-5'-cordycepin-trimer核的化学合成†

  摘要：

  3'-脱氧腺苷-（2'-5'）-3'-脱氧腺苷基-（2'-5'）-3'-脱氧腺苷（30；三聚虫草素）的化学合成通过使用不同保护基团的三种不同途径进行描述并应用磷酸三酯方法。中间体已通过元素分析和光谱学手段进行了分离和表征。通过脱保护获得了高收率的30，使得该具有生物学活性的化合物可以制备规模获得。

  DOI：

  10.1002/hlca.19870700808
• 作为试剂：
  描述：

  胆固醇 、 2'-O-<(tert-butyl)dimethylsilyl>-3'-deoxy-N⁶-<2-(4-nitrophenyl)ethoxycarbonyl>adenosine 在 4-二甲氨基吡啶 、 1,2-二氯乙烷 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙酸乙酯 、 甲苯 、 3'-deoxy-5'-O-monomethoxytrityl-6-N-[2-(4-nitrophenyl)-ethoxycarbonyl]-adenosine 为溶剂， 生成 5'-O-[2-(cholesteryloxy-carbonyl)ethylcarbonyl]-3'-deoxy-6-N-[2-(4-nitrophenyl)ethoxycarbonyl]-adenosine 、 2'-O-[2-(Cholesteryloxycarbonyl)ethylcarbonyl]-3'-deoxy-5'-O-monomethoxytrityl-6-N-[2-(4-nitrophenyl)ethoxycarbonyl]-adenosine
  参考文献：
  名称：

  Cholesterol conjugates of 2'5'-oligoadenylate derivatives and antiviral

  摘要：

  一种具有以下结构的胆固醇-腺苷酸共轭物：其中：n为1至8的整数；R.sub.1从T、T'和Y组成的群体中选择；T为T'为其中x为1至18的整数；Y为其中m为零、1、2或3；每个R.sub.2独立地从氧和硫组成的群体中选择；每个R.sub.3独立地从氢和羟基组成的群体中选择；R.sub.4从氢、羟基和T或T'组成的群体中选择；R.sub.5从氢、羟基和T或T'组成的群体中选择；前提是所有R.sub.1、R.sub.4和R.sub.5均不得为T或T'；至少一个R.sub.3为氢或R.sub.4为氢；并且至少一个R.sub.1、R.sub.4和R.sub.5必须为T或T'；或其水溶性盐。这些化合物具有增强的抗病毒活性和/或代谢稳定性。

  公开号：

  US05643889A1

文献信息

• Nucleosides. Part LX. Synthesis and Characterization of Monomeric Cordycepin-Vitamin and Cordycepin-Lipid Conjugates Model Substances for Biodegradable Ester and Carbonate Linkages in Conjugates and Potential Inhibitors of HIV-1 Replication
  作者：Marita Wasner、Wolfgang Pfleiderer、Robert J. Suhadolnik、Susan E. Horvath、Ning Kon、Ming-Xu Guan、Earl E. Henderson、Robert J. Suhadolnik、Earl E. Henderson、Martin E. Adelson

  DOI：10.1002/hlca.19960790304

  日期：1996.5.8

  In addition, the monomeric cordycepin-vitamin and -lipid conjugates inhibited HIV-1 RT activity 28–49% which compares with a 13% inhibition of HIV-1 RT observed for cordycepin. The minimal inhibition of HIV-1-induced syncytia formation and HIV-1 RT activity did not proceed by the activation of RNase L. The monomeric conjugates tested (13, 14) increased PKR expression.

  单体3'-脱氧腺苷（虫草品）在被修改的2'- ø - （13-18）和5'- ø -位（25-29）由维生素E，d 2，以及A和由两个类脂1经由琥珀酸酯或碳酸酯键的1，2-二-O-棕榈酰甘油和1，2-二-O-十六烷基甘油。碱不稳定的缀合物提供保护基团，例如2-（4-硝基-苯基）乙氧基羰基（npeoc）和单甲氧基三苯甲基（MeOTr），这些保护基团可分别裂解而不损害酯键和碳酸酯键。虫草素和维生素E，维生素d的单体结合物2，1,2-二- ø -palmitoylglycerol，和1,2-二- ö-hexadecylglycerol（参见13，14，17，18，25，26，28，和29）抑制HIV-1诱导的合胞体形成1.7至6.2倍相比1.5倍的虫草品（见表）; 25和28的IC 50值分别为257和267m̈M。此外，单体虫草素-维生素和脂质结合物可抑制HIV-1 RT活性28-49％，而虫草素对HIV-1
• Nucleotides. Part LIII. 6-Aminohexanoyl-linked conjugates of monomeric and trimeric cordycepin
  作者：Marita Wasner、Wolfgang Pfleiderer、Robert J. Suhadolnik、Susan E. Horvath、Ning Kon、Ming-Xu Guan、Earl E. Henderson、Martin E. Adelson

  DOI：10.1002/hlca.19970800405

  日期：1997.6.30

  To improve cell permeability, monomeric 3′-deoxyadenosine (cordycepin) and antivirally active trimeric 3′-deoxyadenylyl-(2′–5′)-3′-deoxyadenylyl-(2′–5′)-3′-deoxyadenosine (2′–5′)d3 (A-A-A); (cordycepin-trimer core) were modified at the 2′-O- or 5′-O-position by myristic, cholic, and folic acid = tetradecanoic, 3α, 7α, 12α -trihy-droxy-5β-cholan-24-oic, and N-4-[(2-amino-3,4-dihydro-4-oxopteridin

  为了提高细胞通透性，单体3'-脱氧腺苷（cordycepin）和抗病毒活性三聚体3'-脱氧腺苷基-（2'-5'）-3'-脱氧腺苷基-（2'-5'）-3'-脱氧腺苷（2' –5′）d 3（AAA）；（虫草素三聚体核心）在所述2'-修饰ø -或5'- ø由肉豆蔻酸，胆酸，和叶酸=十四烷，3α，7α位上，12α-trihy-羟基- 5β胆-24- ，和分别通过6-氨基六酰基间隔基连接的N- 4-[（（2-氨基-3,4-二氢-4-氧蝶呤-6-6基）甲基]氨基}苯甲酰基} -L-谷氨酸。三聚体的离析物的合成21，27，和28通过亚磷酰胺化学反应，使用β-消除的2-（4-硝基苯基）乙基（npe），2-（4-硝基苯基）乙氧基羰基（npeoc）和（9 H-芴-9-基）甲氧基羰基（fmoc）基团进行允许在非质子传递溶剂中用DBU进行脱保护而不会损害与酯结合的结合物，得到产物24 – 26和31 – 33
• Nucleotides. Part IL. Synthesis and Characterization of Cordycepin-Trimer-Vitamin and -Lipid Conjugates Potential Inhibitors of HIV-1 Replication
  作者：Marita Wasner、Wolfgang Pfleiderer、Robert J. Suhadolnik、Susan E. Horvath、Ning Kon、Ming-Xu Guan、Earl E. Henderson、Martin E. Adelson、Earl E. Henderson、Robert J. Suhadolnik

  DOI：10.1002/hlca.19960790305

  日期：1996.5.8

  that inhibit HIV-1-induced syncytia formation with IC50 values of 7, 18, and 24 m̈M for 39, 29, and 42, respectively, and inhibit HIV-1 reverse transcriptase (RT) activity from 14 to 96% (see Table). Of the nine conjugates tested, inhibition of HIV-1 replication by 28, 29, 32, 40, and 42 may be attributed in part to the activation of the RNase L/PKR antiviral pathways. Trimer conjugate 42 showed the greatest

  抗病毒活性3'-脱氧腺烯基-（2'-5'）-3'-脱氧腺烯基-（2'-5'的可生物降解的2'-和5'-酯和2'-和5'-碳酸酯结合物的合成首先通过制备获得具有维生素E，D 2和A以及脂质1,2-二-O-棕榈酰甘油和1,2-二-O-十六烷基甘油的）-3'-脱氧腺苷（cordycepin-三聚体核心）三聚体离析物19-21（方案1）。其次，这些物质通过琥珀酸酯或碳酸盐连接基与亲脂性残基缩合，然后通过β-消除npeoc和npe保护基团进行脱保护，并进行酸处理以进行去三苯甲基化反应，而不会分别损害酯和碳酸盐的功能（方案2）。代谢稳定的虫草素-三聚体的维生素和-脂质共轭物是一类新生物缀合物的抑制HIV-1的诱导的合胞体形成的IC 50个值的7，18，和24毫米为39，29，和42，分别和禁止HIV-1逆转录酶（RT）活性从14％上升到96％（请参阅表）。在测试的九种结合物中，HIV-1复制受到28、
• Nucleotides Part XL. Synthesis and Characterization of Modified 2?-5? Adenylate Trimers-Potential Antiviral Agents
  作者：Helga Schirmeister、Wolfgang Pfleiderer

  DOI：10.1002/hlca.19940770104

  日期：1994.2.9

  2′–5′ Adenylate trimers 41–44 carrying the (tert-butyl)dimethylsilyl (tbds) group at the 3′-OH position of various sugar moieties were synthesized via the phosphoramidite method. The use of the (tert-butyloxy)carbonyl (boc) and 2-(4-nitrophenyl)ethylsulfonyl (npes) groups for 2′-OH protection in neighbourhood to the 3′-O-tbds residue was compared during the synthesis of the target trimers. For other

  通过亚磷酰胺法合成了在各种糖部分的3'-OH位置带有（叔丁基）二甲基甲硅烷基（tbds）的2'-5'腺苷酸三聚体41-44。比较了（叔丁氧基）羰基（boc）和2-（4-硝基苯基）乙基磺酰基（npes）基团在3'- O- tbds残基附近用于2'-OH保护的用途。目标三聚体。对于其他功能位置，赞成使用2-（4-硝基苯基）乙基（npe）和2-（4-硝基苯基）乙氧基羰基（npeoc）保护基。
• Nucleotides. Part XLIV. Synthesis, characterization, and biological activity of monomeric and trimeric cordycepin-cholesterol conjugates and inhibition of HIV-1 replication
  作者：Marita Wasner、Wolfgang Pfleiderer、Earl E. Henderson、Robert J. Suhadolnik

  DOI：10.1002/hlca.19940770707

  日期：1994.11.2

  bonds of the conjugate trimers. The syntheses were performed in solution using phosphoramidite chemistry. The fully protected trimer conjugates 13, 14, and 26 as well as all intermediates were characterized by elemental analyses, UV and 1H-NMR spectra. The deblocked conjugates 15, 16, and 27 were pure according to HPLC and showed the correct compositions by mass spectra. Comparative biological studies indicated

  抗病毒活性3'-脱氧腺苷基-（2'-5'）-3'-脱氧腺苷基-（2'-5'）-3'-脱氧腺苷（cordycepin三聚体核心）在2'-或5'-末端修饰通过经由碳酸酯键（15）或琥珀酸酯连接子（16和27）附着胆固醇来改善细胞通透性。相应的单体结合物4，7，和21虫草素制备成模型物质，研究预期的保护基团的适用性-的单甲氧（MeOTr）时，（叔-丁基）二甲基甲硅烷基（tbds），以及消除β-的2-（4-硝基苯基）乙基（npe）和2-（4-硝基苯基）乙氧羰基（npeoc）基团–用于最后的脱保护步骤，而不会损害酯的酯键共轭三聚体。使用亚磷酰胺化学方法在溶液中进行合成。完全保护的三聚体缀合物13，14，和26通过元素分析，UV和以及所有中间体进行了表征1 H-NMR光谱。解块缀合物15，16，和27根据HPLC是纯粹的，并显示通过质谱正确组合物。比较生物学研究表明，虫草素胆固醇共轭三聚体16和27分