5'-(1-pyrenylmethyl)thymidine | 156332-30-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芘
• 英文名称: 5'-(1-pyrenylmethyl)thymidine
• 英文别名: 5'-O-[(pyren-1-yl)methyl]thymidine；1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(pyren-1-ylmethoxymethyl)oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 156332-30-8
• 化学式: C₂₇H₂₄N₂O₅
• 分子量: 456.498
• InChiKey: JYHRDMLZCIBPEF-YTFSRNRJSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.4
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.26
• 拓扑面积：
  88.1
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  双(二乙基氨基)氯膦 、 5'-(1-pyrenylmethyl)thymidine 生成 5'-(pyr)T 3'-phosphorobisdiethylamidite
  参考文献：
  名称：

  将a基引入寡核苷酸末端的新方法

  摘要：

  已经描述了将a烯基甲基引入寡核苷酸的5'-或3'-末端羟基官能团的方法。通过制备5'-（1-吡啶基甲基）胸苷3'-磷酸双二乙基酰胺基铝来完成将of掺入5'-末端，该固相用于5'-py修饰的寡核苷酸的固相合成。制备了5'-二甲氧基三苯甲基3'-（1-苯甲基甲基）尿苷负载的二氧化硅，并将其用于3'-修饰的寡核苷酸的固相合成。如此合成的寡核苷酸-re偶联物的纯化通过反相HPLC进行。与互补DNA杂交形成后，这些寡核苷酸的荧光没有被淬灭。

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(00)77169-3
• 作为产物：
  描述：

  1-氯甲基芘 、 3’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷 在 氢氧化钾 、 溶剂黄146 作用下， 生成 5'-(1-pyrenylmethyl)thymidine
  参考文献：
  名称：

  将a基引入寡核苷酸末端的新方法

  摘要：

  已经描述了将a烯基甲基引入寡核苷酸的5'-或3'-末端羟基官能团的方法。通过制备5'-（1-吡啶基甲基）胸苷3'-磷酸双二乙基酰胺基铝来完成将of掺入5'-末端，该固相用于5'-py修饰的寡核苷酸的固相合成。制备了5'-二甲氧基三苯甲基3'-（1-苯甲基甲基）尿苷负载的二氧化硅，并将其用于3'-修饰的寡核苷酸的固相合成。如此合成的寡核苷酸-re偶联物的纯化通过反相HPLC进行。与互补DNA杂交形成后，这些寡核苷酸的荧光没有被淬灭。

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(00)77169-3

文献信息

• Composition and method for the treatment or prophylaxis of viral
  申请人：Sankyo Company, Limited

  公开号：US05807837A1

  公开（公告）日：1998-09-15

  A composition and method of treatment or prophylaxis of a viral infection in a mammal, such as a human, are provided. The compounds in the composition and which are administered in the method, are oligodeoxyribonucleic acid derivatives of the formula (1): ##STR1## wherein R.sub.1, R.sub.2 and R.sub.3 are hydrogen atoms, alkyl groups, aryl groups, and anthraquinonyl groups; Z is carbon or silicon; or R.sub.2, R.sub.3 and Z together represent fluorenyl or xanthenyl; R.sub.4 is a hydrogen atom, an alkyl group or an aryl group; Y.sub.1, Y.sub.3 and Y.sub.4 are oxygen, sulfur or >NH; Y.sub.2 is oxygen, sulfur, >NH, alkylene or phenylene; X is an alkylene group; m and n are each 0 to 10; and B is an oligodeoxyribonucleotide of a chain length of 3 to 9, or salts thereof.

  提供了哺乳动物，如人类的病毒感染的组合物和治疗或预防方法。组合物中的化合物以及在方法中被管理的化合物是公式（1）的寡脱氧核糖核酸衍生物：##STR1##其中R.sub.1，R.sub.2和R.sub.3是氢原子，烷基，芳基和蒽醌基；Z是碳或硅；或R.sub.2，R.sub.3和Z一起代表芴基或黄酮基；R.sub.4是氢原子，烷基或芳基；Y.sub.1，Y.sub.3和Y.sub.4是氧，硫或>NH；Y.sub.2是氧，硫，>NH，烷基或苯基；X是烷基；m和n分别为0至10；B是链长为3至9的寡脱氧核糖核酸或其盐。
• Modified oligodeoxyribonucleotides, their preparation and their therapeutic use
  申请人：SANKYO COMPANY LIMITED

  公开号：EP0611075B1

  公开（公告）日：1996-12-18
• US5674856A
  申请人：——

  公开号：US5674856A

  公开（公告）日：1997-10-07
• US5807837A
  申请人：——

  公开号：US5807837A

  公开（公告）日：1998-09-15
• A new method for introduction of a pyrene group into a terminal position of an oligonucleotide
  作者：Kazushige Yamana、Kenji Nunota、Hidehiko Nakano、Osamu Sangen

  DOI：10.1016/s0040-4039(00)77169-3

  日期：1994.4

  The method for introduction of a pyrenylmethyl group into a 5′- or 3′-terminal hydroxyl function of oligonucleotides has been described. The incorporation of pyrene into the 5′-end was accomplished by preparation of 5′-(1-pyrenylmethyl)thymidine 3′-phosphorobisdiethylamidite which was used for the solid-phase synthesis of 5′-pyrene-modified oligonucleotides. 5′-Dimethoxytrityl 3′-(1-pyrenylmethyl)uridine

  已经描述了将a烯基甲基引入寡核苷酸的5'-或3'-末端羟基官能团的方法。通过制备5'-（1-吡啶基甲基）胸苷3'-磷酸双二乙基酰胺基铝来完成将of掺入5'-末端，该固相用于5'-py修饰的寡核苷酸的固相合成。制备了5'-二甲氧基三苯甲基3'-（1-苯甲基甲基）尿苷负载的二氧化硅，并将其用于3'-修饰的寡核苷酸的固相合成。如此合成的寡核苷酸-re偶联物的纯化通过反相HPLC进行。与互补DNA杂交形成后，这些寡核苷酸的荧光没有被淬灭。