α-galactosyl fluoride | 2021-84-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: α-galactosyl fluoride
• 英文别名: α-D-glucopyranosyl fluoride；alpha-D-galactosyl fluoride；(2R,3R,4S,5R,6R)-2-fluoro-6-(hydroxymethyl)oxane-3,4,5-triol
• CAS: 2021-84-3
• 化学式: C₆H₁₁FO₅
• 分子量: 182.149
• InChiKey: ATMYEINZLWEOQU-PHYPRBDBSA-N

物化性质

• 沸点：
  371.3±42.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.59±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.6
• 重原子数：
  12
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  1.0
• 拓扑面积：
  90.2
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  α-galactosyl fluoride 在 β1,3-N-acetylglucosaminyltransferase from Helicobacter pylori 、 galactosynthase His₆BgaC/Glu₂₃₃Gly from Bacillus circulans 、 potassium chloride 、 sodium hydroxide 、 magnesium chloride 、 1,4-二巯基-2,3-丁二醇 作用下， 以 aq. phosphate buffer 为溶剂， 反应 84.0h， 生成 tert-butyl N-[2-[[(2R,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-4-[(2R,3R,4S,5S,6R)-4-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-5-hydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]carbamothioylamino]ethyl]carbamate
  参考文献：
  名称：

  糖基转移酶和糖合酶在顺序反应和一锅反应中的组合，用于合成1型和2型N-乙酰乙酰氨基低聚物

  摘要：

  N-乙酰基乳糖胺（LacNAc）1型和2型以及poly-LacNAc的二糖单元参与许多生物识别事件。我们通过两种重组糖基转移酶β1,3的组合报告了1型（3Galβ1-3GlcNAcβ1-; Gal = d-半乳糖，GlcNAc = N-乙酰基d-葡糖胺）和2型（3Galβ1-4GlcNAcβ1-4）的LacNAc寡聚体的模块化设计。- ñ从-acetylglucosaminyltransferase幽门螺杆菌和人类β1,4半乳糖转移酶1，用galactosynthase他6 BgaC / Glu233Gly从环状芽孢杆菌。他的6 BgaC / Glu233Gly和β1,3- N的组合顺序或单罐模式下的‐乙酰氨基葡萄糖氨基转移酶可产生最多四个LacNAc单元的LacNAc 1型寡聚体。此外，顺序使用所有这三种酶可以访问各种neo-LacNAc低聚物。我们介绍了由1型和2型交替单元和1型终止的LacNAc

  DOI：

  10.1002/cctc.201500645
• 作为产物：
  描述：

  beta-D-半乳糖五乙酸酯 在 哌啶 、 sodium methylate 、 triethylamine tris(hydrogen fluoride) 、 三乙胺 、 ethanaminium,N-(difluoro-λ⁴-sulfanylidene)-N-ethyl-,tetrafluoroborate 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 生成 α-galactosyl fluoride
  参考文献：
  名称：

  β-半乳糖苷酶催化亲核试剂的诱变保留残留水解活性并提供转半乳糖苷酶

  摘要：

  突变能力：来自环状芽孢杆菌(BgaD-A)的 β-半乳糖苷酶活性位点中催化亲核试剂 E532 的定点诱变表明，构建没有水解活性的突变体（糖合酶）的常用方法并非适用于所有保留糖苷酶。BgaD-A 突变体保留了残留的水解活性并充当转半乳糖苷酶。

  DOI：

  10.1002/cctc.202101107

文献信息

• Glycosynthase with Broad Substrate Specificity - an Efficient Biocatalyst for the Construction of Oligosaccharide Library
  作者：Jinhua Wei、Xun Lv、Yang Lü、Gangzhu Yang、Lifeng Fu、Liu Yang、Jianjun Wang、Jianhui Gao、Shuihong Cheng、Qian Duan、Cheng Jin、Xuebing Li

  DOI：10.1002/ejoc.201201507

  日期：2013.4

  A versatile glycosynthase (TnG-E338A) with strikingly broad substrate scope has been developed from Thermus nonproteolyticus β-glycosidase (TnG) by using site-directed mutagenesis. The practical utility of this biocatalyst has been demonstrated by the facile generation of a small library containing various oligosaccharides and a steroidal glycoside (total 25 compounds) in up to 100 % isolated yield

  通过使用定点诱变从非蛋白水解栖热菌 β-糖苷酶 (TnG) 中开发出一种多功能糖合酶 (TnG-E338A)，其底物范围非常广泛。这种生物催化剂的实际效用已通过以高达 100% 的分离产率轻松生成包含各种寡糖和甾体糖苷（总共 25 种化合物）的小型文库得到证明。此外，该酶在一锅平行反应中很容易合成了一系列八种低聚糖，这突出了其在碳水化合物库的组合构建中的潜力，这将有助于糖组学和糖治疗研究。值得注意的是，该酶提供了一种可以将糖合酶技术扩展到组合化学的方法。
• Rapid phenolic O-glycosylation of small molecules and complex unprotected peptides in aqueous solvent
  作者：Tyler J. Wadzinski、Angela Steinauer、Liana Hie、Guillaume Pelletier、Alanna Schepartz、Scott J. Miller

  DOI：10.1038/s41557-018-0041-8

  日期：2018.6

  Glycosylated natural products and synthetic glycopeptides represent a significant and growing source of biochemical probes and therapeutic agents. However, methods that enable the aqueous glycosylation of endogenous amino acid functionality in peptides without the use of protecting groups are scarce. Here, we report a transformation that facilitates the efficient aqueous O-glycosylation of phenolic

  糖基化的天然产物和合成的糖肽代表了生化探针和治疗剂的重要且不断增长的来源。然而，缺少能够在不使用保护基的情况下使肽中的内源氨基酸官能团进行水性糖基化的方法。在这里，我们报道了一种转化，该转化促进了在广泛的小分子，未保护的酪氨酸和嵌入一系列复杂，完全未保护的肽中的酪氨酸残基的酚官能团的有效O-糖基化水溶液。该转化使用糖基氟化物供体，并由Ca（OH）2促进，取决于糖基供体的立体化学，在室温下在水中迅速进行，并具有良好的收率和选择性形成独特的异头物产物。观察到高官能团耐受性，并且在几乎所有蛋白原性氨基酸的所有侧链均存在的情况下，Cys例外，酚糖基化选择性发生。该方法为水中的O-芳基糖苷和Tyr- O-糖基化肽的无保护基的合成提供了高度选择性，有效且操作简单的方法。
• On expanding the repertoire of glycosynthases: Mutant β-galactosidases forming β-(1,6)-linkages
  作者：David L Jakeman、Stephen G Withers

  DOI：10.1139/v02-077

  日期：2002.8.1

  Oligosaccharide synthesis by enzymatic processes offers the potential for thrusting oligosaccharides to the forefront of pharmaceutical research, in part, due to expedient and scalable reaction protocols. Glycosynthases are an emerging class of mutant enzymes capable of synthesizing glycosidic linkages in high yield. We report a new glycosynthase enzyme generated by a point mutation of E. coli β-galactosidase

  通过酶促过程合成寡糖提供了将寡糖推向药物研究前沿的潜力，部分原因在于方便和可扩展的反应方案。糖合酶是一类新兴的突变酶，能够以高产率合成糖苷键。我们报告了一种由大肠杆菌 β-半乳糖苷酶的点突变产生的新糖合酶，该酶将 α-半乳糖基氟与芳基糖苷缩合形成 β-(1,6) 糖苷键。酶内靠近活性位点的进一步点突变显着提高了产量。关键词：糖基转移，糖合酶，酶促寡糖合成。四氢恶嗪、异法米明、亚氨基蔗糖、糖苷酶抑制剂。 [Traduit par la Redaction]
• Thermus thermophilus Glycosynthases for the Efficient Synthesis of Galactosyl and Glucosyl β-(1→3)-Glycosides
  作者：Jullien Drone、Hui-yong Feng、Charles Tellier、Lionel Hoffmann、Vinh Tran、Claude Rabiller、Michel Dion

  DOI：10.1002/ejoc.200500014

  日期：2005.5

  were much more efficient than E338A. Moreover, our results showed that these enzymes were inactive in the hydrolysis of the α-D-glycopyranosyl fluorides used as donors, and so suitable experimental conditions, under which the rate of spontaneous hydrolysis of the donor was considerably lower than that of enzymatic transglycosidation, provided galactosyl and glucosyl β-(13)-glycosides in yields of up

  根据Withers 策略设计反转突变体糖合酶，从保留Tt-β-Gly 糖苷酶的野生型嗜热栖热菌开始。丙氨酸、丝氨酸和甘氨酸对催化亲核试剂谷氨酸 338 的定向诱变分别提供了 E338A、E338S 和 E338G 突变酶。正如所料，突变体不能催化转糖苷产物的水解。与之前的结果一致，E338S 和 E338G 催化剂比 E338A 高效得多。此外，我们的结果表明，这些酶在用作供体的 α-D-吡喃糖基氟的水解中是无活性的，因此在合适的实验条件下，供体的自发水解速率远低于酶促转糖苷的速率，以高达 90% 的产率提供半乳糖基和葡萄糖基 β-(13)-糖苷。蛋白质数据库中可用的天然 Tt-β-Gly 的结构为通过分子建模解释我们的结果提供了良好的基础。因此，在 E338S 突变体的情况下，当供体和受体处于形成 β-(13)-糖苷键的正确位置时，系统的能量较低。(© Wiley-VCH Verlag GmbH
• Transglycosylations employing recombinant α- and β-galactosidases and novel donor substrates
  作者：Sven Schröder、Lars Kröger、Ralf Mattes、Joachim Thiem

  DOI：10.1016/j.carres.2014.05.005

  日期：2015.2

  stearothermophilus KVE39, and also a thermophilic β-galactosidase BglT from Thermus thermophilus TH 125 could be employed in α- and in β-glycosylations, respectively. With model structures as well as sucrose, isomaltitol, and isomaltulose the stereo- and regiospecificities were studied. Further, a number of modified donor structures with structural variation and different leaving groups were synthesized, employed

  重组α-和β-半乳糖苷酶可以大量制备，用于化学方法合成与营养方法相关的糖基化低聚糖。来自大肠杆菌的α-半乳糖苷酶RafA，来自嗜热嗜热脂肪芽孢杆菌KVE39的另一种嗜热α-半乳糖苷酶AgaB以及来自嗜热栖热菌TH 125的嗜热β-半乳糖苷酶BglT可以分别用于α-糖基化和β-糖基化。利用模型结构以及蔗糖，异麦芽糖醇和异麦芽酮糖，研究了立体和区域特异性。此外，合成，采用了具有结构变化和不同离去基团的许多修饰的供体结构，并将其与经典的供体进行了这些转糖基化的比较。