apicidin | 183506-66-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: apicidin
• 英文别名: cyclo[(2S)-2-amino-8-oxodecanoyl-1-methoxy-L-tryptophyl-L-isoleucyl-(2R)-2-piperidinexcarbonyl]；(3S,6S,9S,12R)-3-[(2S)-butan-2-yl]-6-[(1-methoxyindol-3-yl)methyl]-9-(6-oxooctyl)-1,4,7,10-tetrazabicyclo[10.4.0]hexadecane-2,5,8,11-tetrone
• CAS: 183506-66-3
• 化学式: C₃₄H₄₉N₅O₆
• 分子量: 623.793
• InChiKey: JWOGUUIOCYMBPV-GMFLJSBRSA-N

物化性质

• 熔点：
  188-190oC
• 密度：
  1.27±0.1 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  二甲基亚砜：1mg/mL

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.4
• 重原子数：
  45
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.62
• 拓扑面积：
  139
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  6

安全信息

• 危险品标志：
  T+
• 危险类别码：
  R26/27/28
• 危险品运输编号：
  UN 2811 6.1/PG 2
• 安全说明：
  S22,S26,S36/37/39,S45

制备方法与用途

生物活性

Apicidin（OSI 2040）是一种由真菌产生的代谢物，作为组蛋白脱乙酰酶（HDAC）抑制剂，具有抗寄生虫和广谱抗增殖活性。

靶点

HDAC

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  apicidin 在 臭氧 、 二甲基硫 、 potassium tert-butylate 作用下， 以 二氯甲烷 、 四氢呋喃 、 叔丁醇 为溶剂， 反应 1.17h， 以76%的产率得到(3S,6S,9S,12R)-3-[(2S)-butan-2-yl]-6-(1-methoxy-4-oxoquinolin-3-yl)-9-(6-oxooctyl)-1,4,7,10-tetrazabicyclo[10.4.0]hexadecane-2,5,8,11-tetrone
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of Apicidin-Derived Quinolone Derivatives:  Parasite-Selective Histone Deacetylase Inhibitors and Antiproliferative Agents

  摘要：

  Apicidin's indole was efficiently converted into a series of N-substituted quinolone derivatives by indole N-alkylation followed by a two-step, one-pot, ozonolysis/aldol condensation protocol. The new quinolones exhibited good parasite selectivity and potency both at the level of their molecular target, histone deacetylase, and in their whole cell antiproliferative activity in vitro.

  DOI：

  10.1021/jm0001976
• 作为产物：
  描述：

  5-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)戊醛 在 N-乙基吗啉 、 盐酸 、 lithium hydroxide 、 N-甲基吲哚酮 、 四丙基高钌酸铵 、 copper(I) bromide dimethylsulfide complex 、 四溴化碳 、 五氟苯基二苯基磷酸酯 、 四丁基氟化铵 、 1-羟基苯并三唑 、 magnesium 、 1-(3-二甲基氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺 、 三苯基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 溶剂黄146 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 24.0h， 生成 apicidin
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of Apicidin

  摘要：

  DOI：

  10.3987/com-00-9014

文献信息

• [EN] ISOINDOLINONE INHIBITORS OF THE MDM2-P53 INTERACTION AND PROCESS FOR MAKING THEM<br/>[FR] INHIBITEURS ISOINDOLINONE DE L'INTERACTION MDM2-P53 ET PROCÉDÉS DE PRÉPARATION DE CES DERNIERS
  申请人：ASTEX THERAPEUTICS LTD

  公开号：WO2018178691A1

  公开（公告）日：2018-10-04

  The invention relates to processes for preparing isoindolin-1-one derivatives, and in particular processes for preparing (2S,3S)-3-(4-chlorophenyl)-3-[(1R)-1-(4-chlorophenyl)-7-fluoro-5-[(1S)-1-hydroxy-1- (oxan-4-yl)propyl]-1-methoxy-3-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-2-yl]-2-methylpropanoic acid. The invention also relates to crystalline forms of the compound (2S,3S)-3-(4-chlorophenyl)-3-[(1R)-1-(4- chlorophenyl)-7-fluoro-5-[(1S)-1-hydroxy-1-(oxan-4-yl)propyl]-1-methoxy-3-oxo-2,3-dihydro-1H- isoindol-2-yl]-2-methylpropanoic acid and its salts.

  该发明涉及制备异吲哚啉-1-酮衍生物的方法，特别是制备(2S,3S)-3-(4-氯苯基)-3-[(1R)-1-(4-氯苯基)-7-氟-5-[(1S)-1-羟基-1-(氧戊-4-基)丙基]-1-甲氧基-3-酮基-2,3-二氢-1H-异吲哚-2-基]-2-甲基丙酸的方法。该发明还涉及化合物(2S,3S)-3-(4-氯苯基)-3-[(1R)-1-(4-氯苯基)-7-氟-5-[(1S)-1-羟基-1-(氧戊-4-基)丙基]-1-甲氧基-3-酮基-2,3-二氢-1H-异吲哚-2-基]-2-甲基丙酸及其盐的晶型形式。
• [EN] PYRROLCARBOXAMIDE DERIVATIVES FOR THE INHBITION OF ERK5<br/>[FR] DÉRIVÉS DE PYRROLCARBOXAMIDE POUR L'INHIBITION DE L'ERK5
  申请人：CANCER REC TECH LTD

  公开号：WO2016042341A1

  公开（公告）日：2016-03-24

  The invention provides compounds of formula (I) or a tautomer, stereoisomer, N-oxide, pharmaceutically acceptable salt or solvate thereof. The compounds are useful for the prophylaxis or treatment of a disease state or condition mediated by ERK5, in particular cancers.

  这项发明提供了式(I)的化合物或其互变异构体、立体异构体、N-氧化物、药用可接受的盐或溶剂。这些化合物对于预防或治疗由ERK5介导的疾病状态或病况，特别是癌症，具有用处。
• [EN] MACROCYCLIZATION OF PEPTIDOMIMETICS<br/>[FR] MACROCYCLISATION DE PEPTIDOMIMÉTIQUES
  申请人：UNIV WARWICK

  公开号：WO2019186174A1

  公开（公告）日：2019-10-03

  The invention provides an improved method of macrocyclization of peptidomimetics, as measured by isolated yields and product distribution, which comprises substitution of one or more of the backbone amide C=O bonds with a turn-inducing motif. The method is general with enhancements seen across a range of ring sizes (e.g. tri-, tetra-, penta- and hexapeptides). Specifically, the invention provides a peptidomimetic macrocycle comprising a carbonyl bioisosteric turn-inducing element having the structure: (I) wherein X is a heteroatom; and wherein R1 to R6 are each independently selected from alkyl, aryl, heteroaryl and H.

  该发明提供了一种改进的肽类类似物的大环化方法，通过孤立产量和产物分布来衡量，其中包括用诱导转向基团替代一个或多个骨架酰胺C=O键。该方法是通用的，在一系列环大小（例如三肽、四肽、五肽和六肽）中均可见到增强效果。具体而言，该发明提供了一种包含具有结构的羰基生物等同体诱导转向元素的肽类类似物大环：（I）其中X是杂原子；其中R1至R6分别独立地选自烷基、芳基、杂芳基和氢。
• [EN] OPSIN-BINDING LIGANDS, COMPOSITIONS AND METHODS OF USE<br/>[FR] LIGANDS DE LIAISON À UNE OPSINE, COMPOSITIONS ET PROCÉDÉS D'UTILISATION
  申请人：BIKAM PHARMACEUTICALS INC

  公开号：WO2013058809A1

  公开（公告）日：2013-04-25

  Compounds are disclosed that are useful for treating ophthalmic conditions caused by or related to production of toxic visual cycle products that accumulate in the eye, such as dry adult macular degeneration, as well as conditions caused by or related to the misfolding of mutant opsin proteins and/or the mis-localization of opsin proteins. Compositions of these compounds alone or in combination with other therapeutic agents are also described, along with therapeutic methods of using such compounds and/or compositions. Methods of synthesizing such agents are also disclosed.

  披露了一些化合物，可用于治疗由于或与在眼睛中积累的有毒视觉循环产物有关的眼科疾病，例如干性成人黄斑变性，以及由于或与突变视蛋白的错误折叠和/或视蛋白的错误定位有关的疾病。还描述了这些化合物单独或与其他治疗剂联合使用的组合物，以及使用这些化合物和/或组合物的治疗方法。还披露了合成这些药剂的方法。
• [EN] COMPOUNDS AND METHODS FOR TARGETING HSP90<br/>[FR] COMPOSÉS ET PROCÉDÉS POUR LE CIBLAGE DE HSP90
  申请人：UNIV DUKE

  公开号：WO2014025395A1

  公开（公告）日：2014-02-13

  Described herein are compounds that may selectively bind to Hsp90, methods of using the compounds, and kits including the compounds. The compounds may include detection moieties such as fluorophores that may allow for selective detection of Hsp90 in a sample.

  本文描述了可能选择性结合到Hsp90的化合物，使用这些化合物的方法，以及包括这些化合物的试剂盒。这些化合物可能包括检测基团，如荧光团，可以允许在样本中选择性地检测Hsp90。