5-methyl-1-(1-((6-phenoxypyridin-2-yl)methyl)piperidin-4-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 5-methyl-1-(1-((6-phenoxypyridin-2-yl)methyl)piperidin-4-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
• 英文别名: MtTMPK-IN-1；5-methyl-1-[1-[(6-phenoxypyridin-2-yl)methyl]piperidin-4-yl]pyrimidine-2,4-dione
• 化学式: C₂₂H₂₄N₄O₃
• 分子量: 392.458
• InChiKey: BKRRWLAIGUKKJX-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.5
• 重原子数：
  29
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  74.8
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2-bromo-6-(1,3-dioxan-2-yl)pyridine 在 盐酸 、 copper(l) iodide 、 L-半胱氨酸盐酸盐无水物 、 N,N-二甲基甘氨酸盐酸盐 、 三乙酰氧基硼氢化钠 、 caesium carbonate 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 水 、 1,2-二氯乙烷 为溶剂， 反应 24.0h， 生成 5-methyl-1-(1-((6-phenoxypyridin-2-yl)methyl)piperidin-4-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
  参考文献：
  名称：

  非核苷结核分枝杆菌胸苷酸激酶抑制剂的结构辅助优化

  摘要：

  结核分枝杆菌胸苷酸激酶 ( Mt TMPK) 已成为合理药物设计的一个有吸引力的靶标。我们最近研究了新的非核苷Mt TMPK 抑制剂家族，努力使Mt TMPK 抑制剂化学空间多样化。我们在这里报告了一系列新的Mt TMPK 抑制剂，通过将 Topliss 方案与合理的药物设计方法相结合，由Mt TMPK的两种共晶结构与已开发的抑制剂复合物推动。这些努力在我们的测定中提供了最有效的Mt TMPK 抑制剂，其中两种类似物对 H37Rv Mtb 显示出低微摩尔 MIC 值。制备的抑制剂针对Mt TMPK 核苷酸结合袋中的新亚位点，从而为其成药性提供新的见解。我们研究了外排泵的作用以及细胞壁透化剂对选定化合物的影响，以潜在地解释有效的酶抑制和全细胞活性之间缺乏相关性。

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2021.113784

文献信息

• Structure-aided optimization of non-nucleoside M. tuberculosis thymidylate kinase inhibitors
  作者：Lijun Song、Romain Merceron、Fabian Hulpia、Ainhoa Lucía、Begoña Gracia、Yanlin Jian、Martijn D.P. Risseeuw、Toon Verstraelen、Paul Cos、José A. Aínsa、Helena I. Boshoff、Hélène Munier-Lehmann、Savvas N. Savvides、Serge Van Calenbergh

  DOI：10.1016/j.ejmech.2021.113784

  日期：2021.12

  Mycobacterium tuberculosis thymidylate kinase (MtTMPK) has emerged as an attractive target for rational drug design. We recently investigated new families of non-nucleoside MtTMPK inhibitors in an effort to diversify MtTMPK inhibitor chemical space. We here report a new series of MtTMPK inhibitors by combining the Topliss scheme with rational drug design approaches, fueled by two co-crystal structures

  结核分枝杆菌胸苷酸激酶 ( Mt TMPK) 已成为合理药物设计的一个有吸引力的靶标。我们最近研究了新的非核苷Mt TMPK 抑制剂家族，努力使Mt TMPK 抑制剂化学空间多样化。我们在这里报告了一系列新的Mt TMPK 抑制剂，通过将 Topliss 方案与合理的药物设计方法相结合，由Mt TMPK的两种共晶结构与已开发的抑制剂复合物推动。这些努力在我们的测定中提供了最有效的Mt TMPK 抑制剂，其中两种类似物对 H37Rv Mtb 显示出低微摩尔 MIC 值。制备的抑制剂针对Mt TMPK 核苷酸结合袋中的新亚位点，从而为其成药性提供新的见解。我们研究了外排泵的作用以及细胞壁透化剂对选定化合物的影响，以潜在地解释有效的酶抑制和全细胞活性之间缺乏相关性。