5-azido-3-oxapentyl (β-D-galactopyranosyl)-(1->4)-O-2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranoside

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 5-azido-3-oxapentyl (β-D-galactopyranosyl)-(1->4)-O-2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranoside
• 英文别名: N-[(2R,3R,4R,5S,6R)-2-[2-(2-azidoethoxy)ethoxy]-4-hydroxy-6-(hydroxymethyl)-5-[(2S,3R,4S,5R,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxyoxan-3-yl]acetamide
• 化学式: C₁₈H₃₂N₄O₁₂
• 分子量: 496.472
• InChiKey: ZCDAZJPJUSUKGC-VKDBYXODSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.4
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.94
• 拓扑面积：
  211
• 氢给体数：
  7
• 氢受体数：
  14

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-azido-3-oxapentyl (β-D-galactopyranosyl)-(1->4)-O-2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranoside 在 5%-palladium/activated carbon 、 α1,3galactosyltransferase 、 氢气 、 manganese(ll) chloride 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 24.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  提供高特异性抗Gal免疫应答的α-Gal三糖表位的设计和合成†

  摘要：

  展示Galα（1,3）Gal表位的碳水化合物抗原可被人类天然存在的抗体识别。这些抗-Gal抗体最多占血清IgG的1％，并被认为是有害的，因为它们会导致超急性器官排斥。为了模拟这种情况，将α（1,3）半乳糖基转移酶敲除小鼠接种Galα（1,3）Gal表位。在我们的研究中，检查了由方酸酯部分连接的由Galα（1,3）Galβ（1,4）GlcNAc或Galα（1,3）Galβ（1,4）Glc组成的两个α-Gal三糖表位是否存在。它们在KO小鼠中引发免疫反应的能力。使用两组分酶促系统合成两个靶标表位，所述酶联体系使用含有用于偶联的接头部分的修饰的二糖底物。尽管两种糖缀合物疫苗均能诱导所需的高抗Gal IgG抗体滴度，但发现该反应对所用的Galα（1,3）Galβ（1,4）GlcNAc半抗原具有极高的特异性，而与Galα（ 1,3）Galβ（1,4）Glc半抗原。我们的发现表明，尽管同质的糖缀合物疫

  DOI：

  10.1039/c7ob00448f
• 作为产物：
  描述：

  N-acetyl-D-lactosamine 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 sodium methylate 、 4-甲基苯磺酸吡啶 作用下， 以 甲醇 、 1,2-二氯乙烷 为溶剂， 反应 29.0h， 生成 5-azido-3-oxapentyl (β-D-galactopyranosyl)-(1->4)-O-2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranoside
  参考文献：
  名称：

  提供高特异性抗Gal免疫应答的α-Gal三糖表位的设计和合成†

  摘要：

  展示Galα（1,3）Gal表位的碳水化合物抗原可被人类天然存在的抗体识别。这些抗-Gal抗体最多占血清IgG的1％，并被认为是有害的，因为它们会导致超急性器官排斥。为了模拟这种情况，将α（1,3）半乳糖基转移酶敲除小鼠接种Galα（1,3）Gal表位。在我们的研究中，检查了由方酸酯部分连接的由Galα（1,3）Galβ（1,4）GlcNAc或Galα（1,3）Galβ（1,4）Glc组成的两个α-Gal三糖表位是否存在。它们在KO小鼠中引发免疫反应的能力。使用两组分酶促系统合成两个靶标表位，所述酶联体系使用含有用于偶联的接头部分的修饰的二糖底物。尽管两种糖缀合物疫苗均能诱导所需的高抗Gal IgG抗体滴度，但发现该反应对所用的Galα（1,3）Galβ（1,4）GlcNAc半抗原具有极高的特异性，而与Galα（ 1,3）Galβ（1,4）Glc半抗原。我们的发现表明，尽管同质的糖缀合物疫

  DOI：

  10.1039/c7ob00448f

文献信息

• Efficient Preparation of Natural and Synthetic Galactosides with a Recombinant β-1,4-Galactosyltransferase-/UDP-4‘-Gal Epimerase Fusion Protein
  作者：Ola Blixt、Jillian Brown、Melissa J. Schur、Warren Wakarchuk、James C. Paulson

  DOI：10.1021/jo0057809

  日期：2001.4.1

  galactose to a variety of different glucose- and glucosamine-containing acceptors, and utilizes either UDP-galactose or UDP-glucose as donor substrates. A crude lysate from Escherichia coli expressing the fusion protein is demonstrated to be sufficient for the efficient preparation of galactosylated oligosaccharides from inexpensive UDP-glucose in a multigram scale. Lysates containing the fusion protein are

  基于LacNAc的寡糖的多种生物学作用导致对生物学研究的这些结构的需求增加。在该报告中，描述了使用细菌β-4-半乳糖基转移酶/ -UDP-4'-gal-表异构酶融合蛋白合成β-半乳糖苷的有效途径。将来自脑膜炎奈瑟氏球菌的lgtB基因和来自嗜热链球菌的galE基因融合并克隆到表达载体pCW中。融合蛋白将半乳糖转移至各种不同的含葡萄糖和葡萄糖胺的受体，并利用UDP-半乳糖或UDP-葡萄糖作为供体底物。已证明表达融合蛋白的大肠杆菌的粗裂解物足以以毫克规模从廉价的UDP葡萄糖有效制备半乳糖基化的寡糖。还发现含有融合蛋白的裂解物可用于在偶联的反应混合物中产生更复杂的寡糖，例如，用于由N-乙酰基葡糖胺制备唾液酸化物。因此，细菌表达的融合蛋白非常适合于方便，经济地制备天然低聚糖和基于乳糖胺核心的合成衍生物。
• The design and synthesis of an α-Gal trisaccharide epitope that provides a highly specific anti-Gal immune response
  作者：Kensaku Anraku、Shun Sato、Nicholas T. Jacob、Lisa M. Eubanks、Beverly A. Ellis、Kim D. Janda

  DOI：10.1039/c7ob00448f

  日期：——

  moiety were examined for their ability to elicit immune responses in KO mice. Both target epitopes were synthesized using a two-component enzymatic system using modified disaccharide substrates containing a linker moiety for coupling. While both glycoconjugate vaccines induced the required high anti-Gal IgG antibody titers, it was found that this response had exquisite specificity for the Galα(1,3)Galβ(1

  展示Galα（1,3）Gal表位的碳水化合物抗原可被人类天然存在的抗体识别。这些抗-Gal抗体最多占血清IgG的1％，并被认为是有害的，因为它们会导致超急性器官排斥。为了模拟这种情况，将α（1,3）半乳糖基转移酶敲除小鼠接种Galα（1,3）Gal表位。在我们的研究中，检查了由方酸酯部分连接的由Galα（1,3）Galβ（1,4）GlcNAc或Galα（1,3）Galβ（1,4）Glc组成的两个α-Gal三糖表位是否存在。它们在KO小鼠中引发免疫反应的能力。使用两组分酶促系统合成两个靶标表位，所述酶联体系使用含有用于偶联的接头部分的修饰的二糖底物。尽管两种糖缀合物疫苗均能诱导所需的高抗Gal IgG抗体滴度，但发现该反应对所用的Galα（1,3）Galβ（1,4）GlcNAc半抗原具有极高的特异性，而与Galα（ 1,3）Galβ（1,4）Glc半抗原。我们的发现表明，尽管同质的糖缀合物疫