二环霉素 | 38129-37-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 中文名称: 二环霉素
• 中文别名: 双环霉素
• 英文名称: Aizumycin
• 英文别名: bicyclomycin；(1S)-6-hydroxy-5-methylene-1-((1S,2S)-1,2,3-trihydroxy-2-methyl-propyl)-2-oxa-7,9-diaza-bicyclo[4.2.2]decane-8,10-dione；antibiotic WS-4545；bicozamycin；(1S,6R)-6-hydroxy-5-methylidene-1-[(1S,2S)-1,2,3-trihydroxy-2-methylpropyl]-2-oxa-7,9-diazabicyclo[4.2.2]decane-8,10-dione
• CAS: 38129-37-2
• 化学式: C₁₂H₁₈N₂O₇
• 分子量: 302.284
• InChiKey: WOUDXEYYJPOSNE-VKZDFBPFSA-N

物化性质

• 熔点：
  188-191° (dec); mp 187-189° (dec) (Imanaka); mp 166-170° (Nakatsuka et al.)
• 比旋光度：
  D23 +63.5° (methanol)
• 沸点：
  786.6±60.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.57±0.1 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  0.64 M

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.9
• 重原子数：
  21
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.67
• 拓扑面积：
  148
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  二环霉素 在 platinum(IV) oxide 氢气 作用下， 以 水 为溶剂， 生成 dihydrobicyclomycin
  参考文献：
  名称：

  BICYCLOMYCIN, A NEW ANTIBIOTIC

  摘要：

  通过核磁共振光谱分析，新型抗生素双环霉素的结构已基本阐明，并通过 X 射线晶体衍射分析，最终确定其为 8，10-二氮-6-羟基-5-亚甲基-1-(2'-甲基-1'，2'，3'-三羟基丙基)-2-氧杂双环 [4，2，2] 癸烷-7，9-二酮。制备并研究了它的一些酰基衍生物。此外，还研究了酰基衍生物的结构与尿液排泄率之间的关系。

  DOI：

  10.7164/antibiotics.25.576
• 作为产物：
  描述：

  (1S,6R)-6-<(tert-butyldimethylsilyl)oxy>-1-<(1S,2S)-2,3-dihydroxy-2,3-O-isopropylidene-1-(p-methoxybenzyl)-2-methylpropyl>-7,9-bis(p-methoxybenzyl)-5-methylene-7,9-diaza-2-oxabicyclo<4.2.2>decane-8,10-dione 在 ammonium cerium(IV) nitrate 、 四丁基氟化铵 、 水 、 2,3-二氯-5,6-二氰基-1,4-苯醌 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 2.92h， 生成 二环霉素
  参考文献：
  名称：

  Chiral synthesis of bicyclomycin and diastereomeric stereoselectivity of the key aldol condensation

  摘要：

  DOI：

  10.1021/jo00261a009

文献信息

• Role of the C(6)-Hydroxy Group in Bicyclomycin:  Synthesis, Structure, and Chemical, Biochemical, and Biological Properties
  作者：Alejandro Santillán,、Xiangdong Zhang、Jon Hardesty、William R. Widger、Kohn

  DOI：10.1021/jm9708386

  日期：1998.3.1

  the C(6) hydroxy group in 1 was essential for activity. We found that replacing the C(6)-hydroxy group in 1 with weaker hydrogen bond donors led to low inhibitory activities in the rho-dependent ATPase and transcription termination assays. None of the bicyclomycin derivatives exhibited antibiotic activity against E. coli W3350 cells at a 32 mg/mL concentration. The apparent specificity for the C(6)-hydroxy

  双环霉素（1）是一种商业抗生素，其在大肠杆菌中的主要作用位点是转录终止因子rho。最近的结构活性关系研究为1，表明用烷氧基和硫代烷氧基取代基取代C（6）-羟基会导致rho生化分析中抑制活性的急剧下降。这种结构特异性的起源已通过C（6）-氨基-（13），C（6）-（羟基氨基）-（14）和C（6）的合成以及化学，生物化学和生物学评估进行了探索-巯基双环霉素（15）。这些化合物，像1一样，能够与​​rho进入氢键供体相互作用，并且能够进行C（6）开环以生成α，β-不饱和羰基，亚胺或硫酮系统。将13-15的化学反应性与1的化学反应性进行了比较。我们观察到1，在中性和碱性条件下用EtSH处理后，很容易进行C（6）的半胱氨酸键裂解，然后将共轭物添加到β-亚甲基-α-酮酰胺2中，从而得到迈克尔加成加合物，而13-15通过初始裂解C（1 ）-O（2）键。13-15和相关类似物的生化和生物学测定表明1中的C
• Synthesis and reactivity of bicyclomycin C(3') amines
  作者：Hyeung-Geun Park、Marco A. Vela、Harold Kohn

  DOI：10.1021/ja00081a006

  日期：1994.1

  The novel bicyclomycin C(3') tertiary amines 6-8 were prepared in which morpholine, N-acetylpiperazine, and N-carboethoxypiperazine were installed at the C(3') site in bicyclomycin (1), respectively. Previous attempts to synthesize bicyclomycin C(3') amines were unsuccessful. Compounds 68 were found to be more reactive than 1 in neutral and basic solutions. Under these conditions, a novel ring fragmentation

  制备了新型双环霉素 C(3') 叔胺 6-8，其中吗啉、N-乙酰哌嗪和 N-carboethoxypiperazine 分别安装在双环霉素 (1) 的 C(3') 站点上。以前合成双环霉素 C(3') 胺的尝试没有成功。发现化合物 68 在中性和碱性溶液中比 1 更具反应性。在这些条件下，发生了新的环断裂过程以产生单取代的乙内酰脲（即 15、18、19）和 α-亚甲基-γ-丁内酯（17）。提出了形成乙内酰脲 15、18 和 19 以及丁内酯 17 的途径，并提供了支持这些假设的证据。讨论了这种环断裂过程在未来药物设计中的潜在意义
• Bicyclomycin Fluorescent Probes:  Synthesis and Biochemical, Biophysical, and Biological Properties
  作者：Andrew P. Brogan、William R. Widger、Harold Kohn

  DOI：10.1021/jo030020u

  日期：2003.7.1

  Bicyclomycin (1) is a commercially available antibiotic whose primary site of action in Escherichia coli is the transcription termination factor rho. Key aspects of the 1.rho interaction-K(d), stoichiometry for 1.rho binding, and whether 1 and ATP binding induce conformational changes in rho-remain unknown. In this study, the design, synthesis, and characterization of a series of bicyclomycin fluorescent

  双环霉素（1）是一种可商购的抗生素，其在大肠杆菌中的主要作用位点是转录终止因子rho。1.rho相互作用-K（d），1.rho结合的化学计量以及1和ATP结合是否诱导rho构象变化的关键方面仍然未知。在这项研究中，描述了一系列设计用于合成1.rho相互作用的双环霉素荧光探针（BFP）的设计，合成和表征，并记录了它们的使用。我们显示，具有中等至大型C（5a）取代基的二氢双环霉素提供了优异的抑制活性，超过了依赖于poly（C）的ATPase分析中1的抑制活性。通过使用5a-（phenazin-2-ylmethylsulfanyl）dihydrobicyclomycin（15）证明了BFP在双环霉素-rho结合研究中的效用（15）。W381在15和ATP存在下在野生型rho中的激发（290 nm）导致荧光共振能量转移（FRET），K（d）（15）为9.9 microM。使用ADP代替ATP或排除
• THE CHIRAL SYNTHESIS OF BICYCLOMYCIN
  作者：Juji Yoshimura、Masanori Yamaura、Tsuneji Suzuki、Hironobu Hashimoto

  DOI：10.1246/cl.1984.2157

  日期：1984.12.5

  The optically active bicyclomycin was successfully synthesized in 17 steps from N,N′-diacetyl-anhydroglycine.

  从N,N'-二乙酰-脱水甘氨酸通过17步成功合成了具有旋光活性的双环霉素。
• Studies on the reactivity of bicyclomycin with thiols
  作者：Syed Abuzar、Harold Kohn

  DOI：10.1021/ja00164a036

  日期：1990.4

  The chemical reactivity of the clinically important antibiotic bicyclomycin with thiols has been investigated. Emphasis has been placed on discerning the product profiles obtained with cycteine derivatives in light of earlier projections on the likely in vivo biological nucleophile in bicyclomycin-mediated transformations

  已经研究了临床上重要的抗生素双环霉素与硫醇的化学反应性。鉴于早期对双环霉素介导的转化中可能的体内生物亲核试剂的预测，重点放在辨别用半胱氨酸衍生物获得的产品概况