倍癌霉素A | 118292-34-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 中文名称: 倍癌霉素A
• 英文名称: duocarmycin A
• 英文别名: methyl (1R,4R,12S)-4-methyl-3,7-dioxo-10-(5,6,7-trimethoxy-1H-indole-2-carbonyl)-5,10-diazatetracyclo[7.4.0.01,12.02,6]trideca-2(6),8-diene-4-carboxylate
• CAS: 118292-34-5
• 化学式: C₂₆H₂₅N₃O₈
• 分子量: 507.5
• InChiKey: AZVARJHZBXHUSO-DZQVEHCYSA-N

物化性质

• 溶解度：
  溶于二甲基亚砜

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2
• 重原子数：
  37
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  136
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  9

制备方法与用途

生物活性

Duocarmycin A 是一种知名的抗肿瘤抗生素，属于 DNA 烷基化剂，能够有效对 DNA 中富含 AT 的序列 3' 末端的腺嘌呤 N3 进行烷基化。作为一种常用的化学研究工具，Duocarmycin A 通常会导致 HLC-2 细胞凋亡，表现为染色质浓缩、DNA 直方图模式中亚 G1 区域积累以及 procaspase-3 和 caspase-9 水平的降低。

靶点

Procaspase-3	Caspase-9	Duocarmycins

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  倍癌霉素A 在 calf thymus DNA 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 8.0h， 以41.1%的产率得到(2R,8R)-8-(6-Amino-purin-3-ylmethyl)-4-hydroxy-2-methyl-1-oxo-6-(5,6,7-trimethoxy-1H-indole-2-carbonyl)-1,2,3,6,7,8-hexahydro-pyrrolo[3,2-e]indole-2-carboxylic acid methyl ester
  参考文献：
  名称：

  Covalent alkylation of dna with duocarmycin A. Identification of abasic site structure

  摘要：

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(00)97278-2
• 作为产物：
  描述：

  2-氨基-5-硝基苯酚 在 palladium on activated charcoal 吡啶 、 2,6-二甲基吡啶 、 lead(IV) acetate 、 盐酸 、 4-二甲氨基吡啶 、 aluminum amalgam 、 N-溴代丁二酰亚胺(NBS) 、 四氧化锇 、 (DHQ)2-PHAL 、 乙醇 、 甲基磺酰胺 、 三氟化硼乙醚 、 lithium methanolate 、 氢气 、 sodium hydride 、 二正丁基氧化锡 、 potassium carbonate 、 对甲苯磺酸 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三乙胺 、 三氟乙酸 、 potassium iodide 、 potassium hexacyanoferrate(III) 、 肼 、 lithium diisopropyl amide 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 乙醚 、 乙醇 、 二氯甲烷 、 氯仿 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 146.5h， 生成 倍癌霉素A
  参考文献：
  名称：

  Enantioselective Total Synthesis of (+)-Duocarmycin A, epi-(+)-Duocarmycin A, and Their Unnatural Enantiomers

  摘要：

  DOI：

  10.1021/ja953777e

文献信息

• Total Synthesis of (+)-Duocarmycin A, <i>epi</i>-(+)-Duocarmycin A and Their Unnatural Enantiomers:  Assessment of Chemical and Biological Properties
  作者：Dale L. Boger、Jeffrey A. McKie、Takahide Nishi、Tsuyoshi Ogiku

  DOI：10.1021/ja962431g

  日期：1997.1.1

  was employed to control the absolute stereochemistry of the C6 quaternary center. The complementary diastereoselectivity of a thermodynamic versus kinetic condensation of 61 permitted the divergent synthesis of (+)-duocarmycin A or epi-(+)-duocarmycin A from common intermediates. Final introduction of the reactive cyclopropane was accomplished by transannular spirocyclization of the mesylate 44 upon treatment

  描述了 (+)-duocarmycin A (1) 的对映选择性全合成的全部细节，其中提供了控制远程立体中心的相对和绝对立体化学的解决方案。采用 15 的催化不对称二羟基化来引入活化环丙烷所需的绝对立体化学，并采用 61 的非对映选择性 Dieckmann 型缩合来控制 C6 季中心的绝对立体化学。61 的热力学与动力学缩合的互补非对映选择性允许从常见中间体合成 (+)-duocarmycin A 或表 - (+)-duocarmycin A。反应性环丙烷的最终引入是通过甲磺酸酯 44 在用碱处理或直接从相应的游离醇本身、duocarmycin D1 (42) 处理后，在 Mitsunobu 活化后的跨环螺环化来完成的。值得注意的是，使用 (DHQD)2-PHAL/(DHQ)2-PHAL 的 15 的不对称二羟基化...
• Total Synthesis of the Duocarmycins
  作者：Ken Yamada、Toshiki Kurokawa、Hidetoshi Tokuyama、Tohru Fukuyama

  DOI：10.1021/ja035303i

  日期：2003.6.1

  The total synthesis of (+)-duocarmycin A and SA through a common indoline intermediate is described. The key reactions include selective lithiation of a 2,6-dibromoiodobenzene derivative and diastereoselective addition to a chiral nitroalkene, copper-mediated aryl amination, and addition of aryllithium to azlactones.

  描述了 (+)-duocarmycin A 和 SA 通过常见二氢吲哚中间体的全合成。关键反应包括 2,6-二溴碘苯衍生物的选择性锂化和手性硝基烯烃的非对映选择性加成、铜介导的芳基胺化以及芳基锂加成到吖内酯。
• Synthetic studies on duocarmycin. 2. Synthesis and cytotoxicity of natural (+)-duocarmycin A and its three possible stereoisomers.
  作者：Yasumichi Fukuda、Kazuhiko Nakatani、Shiro Terashima

  DOI：10.1016/s0040-4020(01)86994-5

  日期：1994.2

  types of the tricyclic intermediates and the synthetic scheme established in the synthesis of racemic compounds. In vitro cytotoxicity assay against P388 murine leukemia obviously showed that the absolute configuration of cyclopropane moiety in (+)-1 is closely related to its cytotoxicity.

  通过特征在于两种类型的三环中间体的光学拆分和在外消旋化合物的合成中建立的合成方案来实现标题合成。针对P388鼠白血病的体外细胞毒性试验显然表明（+）- 1中环丙烷部分的绝对构型与其细胞毒性密切相关。
• Duocarmycins, Potent Antitumor Antibiotics Produced by Streptomyces sp. Structures and Chemistry.
  作者：Tohru YASUZAWA、Ken'ichi MUROI、Michio ICHIMURA、Isami TAKAHASHI、Tatsuhiro OGAWA、Keiichi TAKAHASHI、Hiroshi SANO、Yutaka SAITOH

  DOI：10.1248/cpb.43.378

  日期：——

  Seven novel potent antitumor antibiotics, duocarmycins A (1), C1 (2), C2 (3), D (4), B1 (5), B2 (6) and SA (7), were isolated from three independently collected Streptomyces sp. The complete structures, including absolute stereochemistry, were determined by spectral and chemical studies of those duocarmycins and several derivatives. Duocarmycins A (1) and SA (7) possess a 1,2,7,7a-tetrahydrocycloprop[1

  从三个独立收集的链霉菌属菌种中分离出七种新型强效抗肿瘤抗生素，杜卡霉素A（1），C1（2），C2（3），D（4），B1（5），B2（6）和SA（7）。 。完整的结构，包括绝对的立体化学，是通过对那些杜卡霉素和几种衍生物的光谱和化学研究确定的。Duocarmycins A（1）和SA（7）具有1,2,7,7a-四氢环丙[1,2-c]吲哚-4-一亚基，这是与链霉菌中CC-1065（10）相同的药效基团zelensis。
• A novel guanine N3 alkylation by antitumor antibiotic duocarmycin A
  作者：Hiroshi Sugiyama、Kazushige Ohmori、Kit Lam Chan、Masahiro Hosoda、Akira Asai、Hiromitsu Saito、Isao Saito

  DOI：10.1016/s0040-4039(00)60376-3

  日期：1993.3

  Antitumor antibiotic duocarmycin A was found to undergo a novel N3 alkylation of the guanine residue (G7) of d(GCAATTGC)2. Guanine base was shown to be a second major target of duocarmycin A in DNA.

  发现抗肿瘤抗生素杜卡霉素A对d（GCAATTGC）2的鸟嘌呤残基（G 7）进行了新的N3烷基化。鸟嘌呤碱基被证明是DNA中杜卡霉素A的第二个主要靶标。