(2E,6E,10E)-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10-trien-1-yl diphosphate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 异戊烯醇脂质
• 英文名称: (2E,6E,10E)-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10-trien-1-yl diphosphate
• 英文别名: phosphono [(2E,6E,10E)-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10-trienyl] hydrogen phosphate
• 化学式: C₂₀H₃₈O₇P₂
• 分子量: 452.465
• InChiKey: TXWIQRIIDXYTBT-QIRCYJPOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.9
• 重原子数：
  29
• 可旋转键数：
  15
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.7
• 拓扑面积：
  113
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  E,E,E-12-hydroxyfarnesyl acetate 在 N-氯代丁二酰亚胺 、 二甲基硫 、 4-甲基苯磺酸吡啶 、 tris(tetra-n-butylammonium) hydrogen pyrophosphate 、 magnesium 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醚 、 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 82.67h， 生成 (2E,6E,10E)-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10-trien-1-yl diphosphate
  参考文献：
  名称：

  探索GGTase-I底物要求。第2部分：新型饱和香叶基香叶基二磷酸类似物的合成及生化分析

  摘要：

  蛋白质异戊二烯化是一种翻译后修饰，可帮助某些蛋白质定位于血浆中的成员，并在这些成员中激活细胞信号传导。为了更好地了解类异戊二烯的需求和FTase和GGTase-I的差异，合成了一系列饱和的香叶基香叶基二磷酸二氢类似物，并针对哺乳动物FTase和GGTase-I进行了筛选。在我们的化合物库中，几种类似物被证明是GGTase-I的底物，与 GGPP（k rel  = 1.0）相比，11d的k rel = 0.95 。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2016.06.035

文献信息

• Functional Characterization and Cyclization Mechanism of a Diterpene Synthase Catalyzing the Skeleton Formation of Cephalotane‐Type Diterpenoids
  作者：Changkang Li、Shuai Wang、Xinxin Yin、Aobo Guo、Kebo Xie、Dawei Chen、Songyang Sui、Yaotian Han、Jimei Liu、Ridao Chen、Jungui Dai

  DOI：10.1002/anie.202306020

  日期：2023.8.14

  Cephalotene synthase (CsCTS), a new diterpene synthase from Cephalotaxus sinensis responsible for forming the core skeleton of cephalotane-type diterpenoids, was functionally identified. The cyclization cascade was studied in depth through isotopic labeling experiments and DFT calculations. Site-directed mutagenesis guided by molecular docking revealed the critical amino acid residues for the unique

  三尖杉烯合酶（CsCTS）是一种来自三尖杉的新二萜合酶，负责形成三尖杉烷型二萜类化合物的核心骨架，并得到了功能鉴定。通过同位素标记实验和DFT计算对环化级联进行了深入研究。由分子对接引导的定点诱变揭示了独特的碳正离子驱动级联环化机制的关键氨基酸残基。
• Exploration of GGTase-I substrate requirements. Part 2: Synthesis and biochemical analysis of novel saturated geranylgeranyl diphosphate analogs
  作者：Kayla J. Temple、Elia N. Wright、Carol A. Fierke、Richard A. Gibbs

  DOI：10.1016/j.bmcl.2016.06.035

  日期：2016.8

  Protein prenylation is a type of post-translational modification that aids certain proteins in localizing to the plasma member where they activate cell signaling. To better understand the isoprenoid requirements and differences of FTase and GGTase-I, a series of saturated geranylgeranyl diphosphate analogs were synthesized and screened against both mammalian FTase and GGTase-I. Of our library of compounds

  蛋白质异戊二烯化是一种翻译后修饰，可帮助某些蛋白质定位于血浆中的成员，并在这些成员中激活细胞信号传导。为了更好地了解类异戊二烯的需求和FTase和GGTase-I的差异，合成了一系列饱和的香叶基香叶基二磷酸二氢类似物，并针对哺乳动物FTase和GGTase-I进行了筛选。在我们的化合物库中，几种类似物被证明是GGTase-I的底物，与 GGPP（k rel  = 1.0）相比，11d的k rel = 0.95 。