(R)-N-FMOC-2-氨基-3-羟基-3-甲基丁酸 | 884880-39-1

• 物质功能分类: 生物化工 - 生化试剂 - 氨基酸
• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 中文名称: (R)-N-FMOC-2-氨基-3-羟基-3-甲基丁酸
• 中文别名: (R)-N-FMOC-2-氨基-3-羟基-3-甲基丁酸/FMOC-(R)-2-AMINO-3-HYDROXY-3-METHYLBUTANOICACID；(R)-N-Fmoc-2-氨基-3-羟基-3-甲基丁酸；FMOC-(R)-2-氨基-3-羟基-3-甲基丁酸
• 英文名称: Fmoc-D-OHVal
• 英文别名: (R)-β-hydroxy-N-(Fmoc)valine；(R)-2-((((9H-Fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-3-hydroxy-3-methylbutanoic acid；(2R)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-3-hydroxy-3-methylbutanoic acid
• CAS: 884880-39-1
• 化学式: C₂₀H₂₁NO₅
• 分子量: 355.39
• InChiKey: KIOMNBRJPAICIT-KRWDZBQOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.6
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.3
• 拓扑面积：
  95.9
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

安全信息

• 危险等级：
  IRRITANT
• 危险性防范说明：
  P261,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H302,H315,H319,H335

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (R)-N-FMOC-2-氨基-3-羟基-3-甲基丁酸 在 2,6-二甲基吡啶 、 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 、 碳酸氢钠 作用下， 以 乙醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 47.0h， 生成 Fmoc-D-βOTBSVal-OH
  参考文献：
  名称：

  形成通道的 48-mer 肽聚乙酰胺 B 的固相全合成和双重作用机制

  摘要：

  Polytheonamide B (1) 由于其极其复杂的结构、体外通道形成能力和极强的细胞毒性，是一种独特的肽天然产物。1 的 48 聚体序列包含交替的 d,l-氨基酸，并拥有一系列空间庞大的 β-四取代和氢键形成残基。据信，这些不寻常的结构特征驱动 1 折叠成 4.5 nm 长的管，在质膜上形成跨膜离子通道，并发挥细胞毒性。然而，尽管其潜在的生物学应用，这些不寻常的残基的多次取代显着增加了合成挑战，阻碍了 1 的固相肽合成 (SPPS)。在这项研究中，我们首先通过广泛优化各种因素来解决合成问题。 SPPS。新的保护组策略的适应允许树脂上的 37 聚体肽延长，N 端 11 聚体片段缩合到树脂上。去除 18 个保护基团和树脂以优异的总产率产生了 1 个（4.5%，从 17 个步骤开始 76 个步骤）。SPPS 协议在操作上很简单，并且被证明很容易适应荧光 48 聚体探针 2 的全合成。合成

  DOI：

  10.1021/jacs.8b06755
• 作为产物：
  描述：

  9-芴甲基-N-琥珀酰亚胺基碳酸酯 、 N-Boc-3-羟基-D-缬氨酸 在 三氟乙酸 、 碳酸氢钠 作用下， 以 二氯甲烷 、 水 、 丙酮 为溶剂， 以78%的产率得到(R)-N-FMOC-2-氨基-3-羟基-3-甲基丁酸
  参考文献：
  名称：

  Cytokine receptor modulators and uses thereof

  摘要：

  本发明涉及细胞因子受体结合化合物，例如非竞争性VEGF受体、IL-1受体、IL-4受体或IGF-1受体结合肽和肽类拟态拮抗剂，以及这些化合物的治疗用途。本发明的化合物可用于治疗细胞因子相关疾病，如增生性疾病（例如结肠、乳腺、前列腺和肺癌）、异常新血管生成和血管生成、年龄相关性黄斑变性以及增生性和/或炎症性皮肤疾病，如银屑病。

  公开号：

  US20090048161A1

文献信息

• Solid‐Phase Total Synthesis of Yaku'amide B Enabled by Traceless Staudinger Ligation
  作者：Hiroaki Itoh、Kensuke Miura、Koichi Kamiya、Tomoya Yamashita、Masayuki Inoue

  DOI：10.1002/anie.201916517

  日期：2020.3.9

  solid-phase strategy for total synthesis of the peptidic natural product yaku'amide B (1), which exhibits antiproliferative activity against various cancer cells. Its linear tridecapeptide sequence bears four β,β-dialkylated α,β-dehydroamino acid residues and is capped with an N-terminal acyl group (NTA) and a C-terminal amine (CTA). To realize the Fmoc-based solid-phase synthesis of this complex structure

  我们报告了肽天然产物雅库酰胺B（1）的全合成的固相策略，它对各种癌细胞都具有抗增殖活性。它的线性三肽序列带有四个β，β-二烷基化的α，β-脱氢氨基酸残基，并被N末端酰基（NTA）和C末端胺（CTA）封端。为了实现这种复杂结构的基于Fmoc的固相合成，我们开发了用于酰胺形成，酰胺脱保护和C末端修饰的新方法。首先，无痕的施陶丁格连接使空间阻碍的烯基叠氮化物与新设计的膦酚酚酯之间形成酰胺。其次，Eu（OTf）3的使用导致化学选择性去除了酰胺Boc基团，而没有分离树脂接头。最后，
• Total synthesis of the large non-ribosomal peptide polytheonamide B
  作者：Masayuki Inoue、Naoki Shinohara、Shintaro Tanabe、Tomoaki Takahashi、Ken Okura、Hiroaki Itoh、Yuki Mizoguchi、Maiko Iida、Nayoung Lee、Shigeru Matsuoka

  DOI：10.1038/nchem.554

  日期：2010.4

  Polytheonamide B is by far the largest non-ribosomal peptide known at present, and displays extraordinary cytotoxicity (EC50 = 68 pg ml−1, mouse leukaemia P388 cells). Its 48 amino-acid residues include a variety of non-proteinogenic d- and l-amino acids, and the absolute stereochemistry of these amino acids alternate in sequence. These structural features induce the formation of a stable β-strand-type structure, giving rise to an overall tubular structure over 30 Å in length. In a biological setting, this fold is believed to transport cations across the lipid bilayer through a pore, thereby acting as an ion channel. Here, we report the first chemical construction of polytheonamide B. Our synthesis relies on the combination of four key stages: syntheses of non-proteinogenic amino acids, a solid-phase assembly of four fragments of polytheonamide B, silver-mediated connection of the fragments and, finally, global deprotection. The synthetic material now available will allow studies of the relationships between its conformational properties, channel functions and cytotoxicity. Polytheonamide B is a large non-ribosomal peptide with very high bioactivity. The synthesis described here includes the first preparation of several non-proteinogenic amino acids and a general coupling strategy for large non-natural peptides. The synthesis is a key step necessary to understand and utilize the bioactivity of this and similar compounds.

  聚糖酰胺 B 是目前已知的最大的非核糖体肽，具有非凡的细胞毒性（EC50 = 68 pg mlâ1, 小鼠白血病 P388 细胞）。它的 48 个氨基酸残基包括多种非蛋白原性 d 和 l 氨基酸，这些氨基酸的绝对立体化学结构依次交替。这些结构特征促使形成稳定的δ-strand 型结构，从而形成长度超过 30 Ã 的整体管状结构。在生物环境中，这种折叠结构被认为可以通过一个孔隙在脂质双分子层中运输阳离子，从而起到离子通道的作用。在此，我们首次报告了聚神酰胺 B 的化学结构。我们的合成依赖于四个关键阶段的结合：非蛋白源氨基酸的合成、聚草酰胺 B 四个片段的固相组装、银介导的片段连接以及最后的全局脱保护。现在可用的合成材料将有助于研究其构象特性、通道功能和细胞毒性之间的关系。聚神酰胺 B 是一种大型非核糖体多肽，具有极高的生物活性。本文描述的合成包括首次制备几种非蛋白源氨基酸和大型非天然肽的一般偶联策略。该合成是了解和利用该化合物及类似化合物生物活性的关键一步。
• Functional Analysis of Synthetic Substructures of Polytheonamide B: A Transmembrane Channel-Forming Peptide
  作者：Shigeru Matsuoka、Naoki Shinohara、Tomoaki Takahashi、Maiko Iida、Masayuki Inoue

  DOI：10.1002/anie.201101533

  日期：2011.5.16

  Longer is better: Polytheonamide B, the largest nonribosomal linear peptide identified to date, is a transmembrane channel‐forming peptide. Nine of its substructures have now been chemically synthesized. The membrane‐disrupting and ion‐channel‐forming sequences as well as the cytotoxicity‐enhancing sequence have been identified.

  越长越好： Polytheonamide B是迄今为止鉴定出的最大的非核糖体线性肽，是一种跨膜通道形成肽。现在已经化学合成了其9个亚结构。已经确定了破坏膜和形成离子通道的序列以及增强细胞毒性的序列。
• Interleukin-1 receptor antagonists, compositions, and methods of treatment
  申请人：Chemtob Sylvain

  公开号：US20060094663A1

  公开（公告）日：2006-05-04

  Peptides that are designed to inhibit the biological activity of the IL-1R type 1 receptor and inhibit IL-1R/IL-1RacP related cell signaling and biological activity are disclosed. Compositions comprising IL-1R antagonists of the present invention are useful in the treatment of IL-1 related diseases or conditions such as arthritis, rheumatoid arthritis, osteoarthritis, and inflammatory bowel disease as well as other chronic or acute inflammatory diseases. This invention also discloses an isolated compound having an IL-1R antagonist activity, said compound being selected from the group consisting of: a peptide comprising the amino acid sequence RYTPELX, wherein R, Y, T, P, E, L, refer to their corresponding amino acids, and X is selected from no amino acid and alanine (A); and a derivative of (a) wherein the derivative incorporates one, two or three amino acid modification selected from an amino acid addition, deletion or substitution in the RYTPEL portion of the peptide, and wherein said derivative maintains its antagonist IL-1R activity.

  本发明揭示了设计用于抑制IL-1R类型1受体的生物活性并抑制IL-1R/IL-1RacP相关细胞信号传导和生物活性的肽。本发明的IL-1R拮抗剂组合物在治疗与IL-1相关的疾病或病况，如关节炎、类风湿性关节炎、骨关节炎和炎性肠病以及其他慢性或急性炎症性疾病方面非常有用。本发明还揭示了一种具有IL-1R拮抗剂活性的分离化合物，所述化合物选自以下组成的群体：包括氨基酸序列RYTPELX的肽，其中R、Y、T、P、E、L分别指它们对应的氨基酸，X选自无氨基酸和丙氨酸（A）；以及（a）的衍生物，该衍生物在肽的RYTPEL部分中包含一、二或三个氨基酸修饰，所选的修饰包括氨基酸添加、删除或替换，并且该衍生物保持其拮抗剂IL-1R活性。
• INTERLEUKIN-1 RECEPTOR ANTAGONISTS, COMPOSITIONS, AND METHODS OF TREATMENT
  申请人：Chemtob Sylvain

  公开号：US20100041609A1

  公开（公告）日：2010-02-18

  Peptides that are designed to inhibit the biological activity of the IL-1R type 1 receptor and inhibit IL-1R/IL-1RacP related cell signaling and biological activity are disclosed. Compositions comprising IL-1R antagonists of the present invention are useful in the treatment of IL-1 related diseases or conditions such as arthritis, rheumatoid arthritis, osteoarthritis, and inflammatory bowel disease as well as other chronic or acute inflammatory diseases. This invention also discloses an isolated compound having an IL-1R antagonist activity, said compound being selected from the group consisting of: a peptide comprising the amino acid sequence RYTPELX, wherein R, Y, T, P, E, L, refer to their corresponding amino acids, and X is selected from no amino acid and alanine (A); and a derivative of (a) wherein the derivative incorporates one, two or three amino acid modification selected from an amino acid addition, deletion or substitution in the RYTPEL portion of the peptide, and wherein said derivative maintains its antagonist IL-1R activity.

  本发明揭示了设计用于抑制IL-1R类型1受体的生物活性并抑制IL-1R/IL-1RacP相关细胞信号和生物活性的肽。包含本发明的IL-1R拮抗剂的组合物在治疗与IL-1相关的疾病或病况，如关节炎、类风湿性关节炎、骨关节炎和炎症性肠病以及其他慢性或急性炎症性疾病方面是有用的。本发明还揭示了一种具有IL-1R拮抗剂活性的分离化合物，所述化合物选自以下组：包含氨基酸序列RYTPELX的肽，其中R、Y、T、P、E、L分别指它们对应的氨基酸，X选自无氨基酸和丙氨酸（A）；及其衍生物，其中衍生物在肽的RYTPEL部分中包含一种、两种或三种氨基酸修饰，所述修饰选自氨基酸添加、删除或替换，并且所述衍生物保持其拮抗剂IL-1R活性。