Fmoc-[26-32]-OH | 1227750-88-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: Fmoc-[26-32]-OH
• 英文别名: Fmoc-Gly-D-Asm-L-Ile-D-OHAsm-L-t-Leu-D-OHVal-Gly-OH；2-[[(2R)-2-[[(2S)-2-[[(2R,3R)-2-[[(2S,3S)-2-[[(2R)-2-[[2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)acetyl]amino]-4-(methylamino)-4-oxobutanoyl]amino]-3-methylpentanoyl]amino]-3-hydroxy-4-(methylamino)-4-oxobutanoyl]amino]-3,3-dimethylbutanoyl]amino]-3-hydroxy-3-methylbutanoyl]amino]acetic acid
• CAS: 1227750-88-0
• 化学式: C₄₆H₆₅N₉O₁₄
• 分子量: 968.074
• InChiKey: JEVRZIUKULGYGB-CJCBTUODSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.2
• 重原子数：
  69
• 可旋转键数：
  25
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.52
• 拓扑面积：
  349
• 氢给体数：
  12
• 氢受体数：
  14

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Fmoc-[26-32]-OH 在 哌啶 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 2.0h， 以92%的产率得到H-Gly-D-Asn(Me)-Ile-D-Asn(3R-OH,Me)-Gly(tBu)-D-Val(3-OH)-Gly-OH
  参考文献：
  名称：

  聚乙酰胺B合成亚结构的功能分析：跨膜通道形成肽。

  摘要：

  越长越好： Polytheonamide B是迄今为止鉴定出的最大的非核糖体线性肽，是一种跨膜通道形成肽。现在已经化学合成了其9个亚结构。已经确定了破坏膜和形成离子通道的序列以及增强细胞毒性的序列。

  DOI：

  10.1002/anie.201101533
• 作为产物：
  描述：

  Fmoc-甘氨酸 、 Fmoc-L-异亮氨酸 、 Fmoc-L-叔亮氨酸 、 [5-fluoro-2-(5-methoxy-4-methyl-1H-indol-3-ylsulfanyl)-benzyl]-methyl-amine 、 Fmoc-D-OHAsm 、 (R)-N-FMOC-2-氨基-3-羟基-3-甲基丁酸 、 Fmoc-D-Asm 在 哌啶 、 1-羟基苯并三唑 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 N-甲基吡咯烷酮 为溶剂， 反应 0.22h， 生成 Fmoc-[26-32]-OH
  参考文献：
  名称：

  聚乙酰胺B合成亚结构的功能分析：跨膜通道形成肽。

  摘要：

  越长越好： Polytheonamide B是迄今为止鉴定出的最大的非核糖体线性肽，是一种跨膜通道形成肽。现在已经化学合成了其9个亚结构。已经确定了破坏膜和形成离子通道的序列以及增强细胞毒性的序列。

  DOI：

  10.1002/anie.201101533

文献信息

• Total synthesis of the large non-ribosomal peptide polytheonamide B
  作者：Masayuki Inoue、Naoki Shinohara、Shintaro Tanabe、Tomoaki Takahashi、Ken Okura、Hiroaki Itoh、Yuki Mizoguchi、Maiko Iida、Nayoung Lee、Shigeru Matsuoka

  DOI：10.1038/nchem.554

  日期：2010.4

  Polytheonamide B is by far the largest non-ribosomal peptide known at present, and displays extraordinary cytotoxicity (EC50 = 68 pg ml−1, mouse leukaemia P388 cells). Its 48 amino-acid residues include a variety of non-proteinogenic d- and l-amino acids, and the absolute stereochemistry of these amino acids alternate in sequence. These structural features induce the formation of a stable β-strand-type structure, giving rise to an overall tubular structure over 30 Å in length. In a biological setting, this fold is believed to transport cations across the lipid bilayer through a pore, thereby acting as an ion channel. Here, we report the first chemical construction of polytheonamide B. Our synthesis relies on the combination of four key stages: syntheses of non-proteinogenic amino acids, a solid-phase assembly of four fragments of polytheonamide B, silver-mediated connection of the fragments and, finally, global deprotection. The synthetic material now available will allow studies of the relationships between its conformational properties, channel functions and cytotoxicity. Polytheonamide B is a large non-ribosomal peptide with very high bioactivity. The synthesis described here includes the first preparation of several non-proteinogenic amino acids and a general coupling strategy for large non-natural peptides. The synthesis is a key step necessary to understand and utilize the bioactivity of this and similar compounds.

  聚糖酰胺 B 是目前已知的最大的非核糖体肽，具有非凡的细胞毒性（EC50 = 68 pg mlâ1, 小鼠白血病 P388 细胞）。它的 48 个氨基酸残基包括多种非蛋白原性 d 和 l 氨基酸，这些氨基酸的绝对立体化学结构依次交替。这些结构特征促使形成稳定的δ-strand 型结构，从而形成长度超过 30 Ã 的整体管状结构。在生物环境中，这种折叠结构被认为可以通过一个孔隙在脂质双分子层中运输阳离子，从而起到离子通道的作用。在此，我们首次报告了聚神酰胺 B 的化学结构。我们的合成依赖于四个关键阶段的结合：非蛋白源氨基酸的合成、聚草酰胺 B 四个片段的固相组装、银介导的片段连接以及最后的全局脱保护。现在可用的合成材料将有助于研究其构象特性、通道功能和细胞毒性之间的关系。聚神酰胺 B 是一种大型非核糖体多肽，具有极高的生物活性。本文描述的合成包括首次制备几种非蛋白源氨基酸和大型非天然肽的一般偶联策略。该合成是了解和利用该化合物及类似化合物生物活性的关键一步。
• Functional Analysis of Synthetic Substructures of Polytheonamide B: A Transmembrane Channel-Forming Peptide
  作者：Shigeru Matsuoka、Naoki Shinohara、Tomoaki Takahashi、Maiko Iida、Masayuki Inoue

  DOI：10.1002/anie.201101533

  日期：2011.5.16

  Longer is better: Polytheonamide B, the largest nonribosomal linear peptide identified to date, is a transmembrane channel‐forming peptide. Nine of its substructures have now been chemically synthesized. The membrane‐disrupting and ion‐channel‐forming sequences as well as the cytotoxicity‐enhancing sequence have been identified.

  越长越好： Polytheonamide B是迄今为止鉴定出的最大的非核糖体线性肽，是一种跨膜通道形成肽。现在已经化学合成了其9个亚结构。已经确定了破坏膜和形成离子通道的序列以及增强细胞毒性的序列。