resistance has made new inhibitor chemotypes more pressing. Adopting a structure-based approach, we docked 1.2 billion non-covalent lead-like molecules and a new library of 6.5 million electrophiles against the enzyme structure. From these, 29 non-covalent and 11 covalent inhibitors were identified in 37 series, the most potent having an IC50 of 29 and 20 μM, respectively. Several series were optimized
需要使用抗病毒疗法来治疗
SARS-CoV-2,以降低正在进行的 COVID-19 大流行的发病率。一个众所周知的药物靶点是主要病毒
蛋白酶 (M Pro ),它是一种已批准药物和几种研究药物的靶点。新兴的病毒耐药性使得新的
抑制剂化学型变得更加紧迫。采用基于结构的方法,我们将 12 亿个非共价先导分子和一个包含 650 万个亲电子试剂的新库与酶结构对接。从这些
抑制剂中,在 37 个系列中鉴定出 29 种非共价
抑制剂和 11 种共价
抑制剂,其中最有效的 IC 50分别为 29 和 20 μM。对几个系列进行了优化,产生了低微摩尔
抑制剂。随后的晶体学证实了对接预测的结合模式,并可能进一步优化模板。虽然新的
化学型可能有助于进一步优化
SARS-CoV-2 的 M Pro
抑制剂,但适度的成功率也揭示了我们在挑战 M Pro等目标的方法中的弱点,与其他更成功的目标相比,以及与其他结构相比 -基于针对 M