2'-脱氧-6-O-甲基-鸟苷 | 964-21-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 中文名称: 2'-脱氧-6-O-甲基-鸟苷
• 英文名称: 2-amino-9-(2-deoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)-6-methoxypurine
• 英文别名: O⁶-methyl-2'-deoxyguanosine；6-methoxy-2’-deoxyguanosine；O⁶-methyldeoxyguanosine；6-O-methyl-2'-deoxyguanosine；O⁶-Me-dGuo；O⁶-methyl-2'-deoxy-guanosine；O(6)-Methyl-2'-deoxyguanosine；(2R,3S,5R)-5-(2-amino-6-methoxypurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-ol
• CAS: 964-21-6
• 化学式: C₁₁H₁₅N₅O₄
• mdl: MFCD00058545
• 分子量: 281.271
• InChiKey: BCKDNMPYCIOBTA-RRKCRQDMSA-N

物化性质

• 熔点：
  109 - 115°C
• 沸点：
  674.7±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.84±0.1 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  碱性溶液（微溶，超声），DMSO（微溶），甲醇（微溶）

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.1
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.545
• 拓扑面积：
  129
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  8

安全信息

• 储存条件：
  2-8°C

制备方法与用途

O6-甲基脱氧鸟苷是一种DNA加合物，属于嘌呤核苷类似物。这类化合物具有广泛的抗肿瘤活性，尤其对惰性淋巴系统恶性肿瘤有靶向作用。其抗癌机制主要依赖于抑制DNA合成和诱导细胞凋亡等过程。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2'-脱氧-6-O-甲基-鸟苷 在 sodium hydroxide 作用下， 以 吡啶 、 乙醇 为溶剂， 反应 2.58h， 生成 N2-benzoyl-O6-methyldeoxyguanosine
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and characterization of an oligonucleotide containing a carcinogen-modified base: O6-methylguanine

  摘要：

  DOI：

  10.1021/ja00368a023
• 作为产物：
  描述：

  2'-deoxy-N²-isobutyryl-O⁶-methylguanosine 在 ammonium hydroxide 作用下， 反应 72.0h， 以100%的产率得到2'-脱氧-6-O-甲基-鸟苷
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of -6-alkylated deoxyguanosine nucleosides

  摘要：

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(00)87314-1
• 作为试剂：
  描述：

  2'-脱氧鸟苷 、 、 、 、 吡啶 在 2'-脱氧-6-O-甲基-鸟苷 、 O(6)-乙基-2'-脱氧鸟苷 、 2'-deoxy-O⁶-isopropylguanosine 、 Hydron;pyridin-1-ium;chloride 、 碳酸氢钠 作用下， 以 alcohol 为溶剂， 反应 132.92h， 以to yield O6 -methyldeoxyguanosine, O6 -ethyldeoxyguanosine or O6 -isopropyldeoxyguanosine的产率得到2'-脱氧-6-O-甲基-鸟苷
  参考文献：
  名称：

  Methods of screening for nucleoside analogs that are incorporated by HIV

  摘要：

  本发明揭示了与HIV相关的方法和组合物。使用本发明的方法，可以筛选核苷类似物，以确定其是否能够被人类免疫缺陷病毒（“HIV RT”）的反转录酶所合并，并引起不正确的碱基配对。通过这些核苷类似物对病毒的逐步突变使其无法生存。

  公开号：

  US05512431A1

文献信息

• Enzymatic Synthesis of Therapeutic Nucleosides using a Highly Versatile Purine Nucleoside 2’‐DeoxyribosylTransferase from<i>Trypanosoma brucei</i>
  作者：Elena Pérez、Pedro A. Sánchez‐Murcia、Justin Jordaan、María Dolores Blanco、José Miguel Mancheño、Federico Gago、Jesús Fernández‐Lucas

  DOI：10.1002/cctc.201800775

  日期：2018.10.9

  selected as the best derivative (4200 IU/g, activity recovery of 22 %), and could be easily recaptured and recycled for >25 reactions with negligible loss of activity. Finally, MTbPDT3 was successfully employed in the expedient synthesis of several nucleoside analogues. Taken together, our results support the notion that TbPDT has good potential as an industrial biocatalyst for the synthesis of a wide range

  与多步化学方法相比，使用酶来合成核苷类似物具有多个优势，包括化学，区域和立体选择性以及较温和的反应条件。本文报道了来自布鲁氏锥虫的嘌呤核苷2'-脱氧核糖基转移酶（PDT）的生产，表征和利用。Tb PDT是一种二聚体，不仅在很宽的温度范围（50–70°C），pH（4–7）和离子强度（0–500 mM NaCl）范围内都显示出出色的活性和稳定性，而且在高温下具有非凡的高稳定性碱性条件（pH 8-10）。bPDT被证明可以熟练地合成许多治疗性核苷，包括去羟肌苷，维达拉滨，克拉屈滨，氟达拉滨和奈拉拉滨。用Ala或Ser进行结构指导的Val11置换，导致变体的活性提高了2.8倍。Tb PDT也共价固定在戊二醛激活的磁性微球上。选择了M Tb PDT3作为最佳衍生物（4200 IU / g，活性回收率为22％），可以轻松地将其重新捕获和再循环用于> 25个反应，而活性损失可忽略不计。最后，男铽PDT3
• Functionalization of Guanosine and 2′‐Deoxyguanosine at C6: A Modified Appel Process and S_NAr Displacement of Imidazole
  作者：Zlatko Janeba、Xiaoyu Lin、Morris J. Robins

  DOI：10.1081/ncn-120027823

  日期：2004.1.1

  Treatment of sugar‐protected 2‐N‐trityl derivatives of guanosine and 2′‐deoxyguanosine with imidazole/triphenylphosphine/iodine/ethyldiisopropylamine gives the corresponding 6‐(imidazol‐1‐yl)‐2‐(tritylamino)purine nucleosides. SNAr displacement of the imidazole moiety with nucleophiles provides 2‐amino‐6‐substituted‐purine nucleosides and 2′‐deoxynucleosides. †In honor and celebration of the 70th birthday

  用咪唑/三苯基膦/碘/乙基二异丙胺处理糖保护的鸟苷和 2'-脱氧鸟苷的 2-N-三苯甲基衍生物，得到相应的 6-(咪唑-1-基)-2-(三苯甲基氨基)嘌呤核苷。用亲核试剂对咪唑部分进行 SNAr 置换，提供 2-氨基-6-取代的嘌呤核苷和 2'-脱氧核苷。†为了纪念和庆祝 Leroy B. Townsend 教授 70 岁生日。#这篇论文是：核酸相关化合物，122。论文 121 是参考文献。1.
• Modified Nucleotides for Discrimination between Cytosine and the Epigenetic Marker 5-Methylcytosine
  作者：Janina von Watzdorf、Kim Leitner、Andreas Marx

  DOI：10.1002/anie.201511520

  日期：2016.2.24

  for diagnostics. Here we describe that modified dGTP analogues as well as modified primers are able to sense the presence or absence of a single methylation of C, even though this modification does not interfere directly with Watson-Crick nucleobase pairing. By screening several modified nucleotide scaffolds, O(6)-modified 2'-deoxyguanosine analogues were identified as discriminating between C and 5mC

  5-Methyl-2'-deoxycytosine 是真核细胞中最常见的 DNA 表观遗传标记，在基因调控中起关键作用，并影响发育和癌变等各种细胞过程。因此，5mC的检测可以作为诊断的重要生物标志物。在这里，我们描述了修饰的 dGTP 类似物以及修饰的引物能够感知 C 的单个甲基化是否存在，即使这种修饰不会直接干扰 Watson-Crick 核碱基配对。通过筛选几个修饰的核苷酸支架，O(6)-修饰的 2'-脱氧鸟苷类似物被确定为区分 C 和 5mC。这些修饰的核苷酸可能会在位点特异性 5mC 检测中得到应用，例如，通过实时 PCR 方法。
• [EN] NUCLEOTIDE PRODRUGS<br/>[FR] PROMÉDICAMENTS NUCLÉOTIDIQUES
  申请人：CERECOR INC

  公开号：WO2019136389A1

  公开（公告）日：2019-07-11

  The invention relates to nucleotide prodrugs and pharmaceutical preparations thereof. The invention further relates using the prodrugs of the invention in the treatment of mitochondrial DNA (mtDNA) depletion syndrome (MDS).

  这项发明涉及核苷酸前药和其制药制剂。该发明还涉及使用该发明的前药治疗线粒体DNA（mtDNA）耗竭综合征（MDS）。
• N7-DNA: Synthesis and Base Pairing of Oligonucleotides ContainingN7-(2-Deoxy-?-D-erythro-pentofuranosyl)guanine (N7Gd)
  作者：Frank Seela、Peter Leonard

  DOI：10.1002/hlca.19960790215

  日期：1996.3.20

  The synthesis of oligonucleotides containing N7-(2-deoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)guanine (N7Gd; 1) is described. Compound 1 was prepared by nucleobase-anion glycosylation of 2-amino-6-methoxypurine (5) with 2-deoxy-3,5-di-O-(4-toluoyl)-α-D-erythro-pentofuranosyl chloride (6) followed by detoluoylation and displacement of the MeO group (8101). Upon base protection with the (dimethylamino)methylidene

  描述了含有N 7-（2-脱氧-β-D-赤型-呋喃呋喃糖基）鸟嘌呤（N 7 G d；1）的寡核苷酸的合成。化合物1的制备是通过将2-氨基-6-甲氧基嘌呤（核碱基阴离子糖基化5与2-脱氧-3,5-二- ）Ö - （4-甲苯酰基）-α-D-赤式-pentofuranosyl酰氯（6）接着是去甲苯甲酸酯化和MeO基团的置换（8101）。用（二甲基氨基）亚甲基残基（11）进行碱保护后，将4,4-二甲氧基三苯甲基引入OHC（5'）（12）。制备膦酸酯3和亚磷酰胺4，并将其用于固相寡核苷酸合成中。自互补十二聚体d（N 7 GC）6显示出S型熔化。双工的T m为40°。这表明通过嘌呤的N（7）与磷酸二酯主链连接的鸟嘌呤残基能够与胞嘧啶进行碱基配对。