2-(2-((叔丁氧基羰基)氨基)-6-氧代-1H-嘌呤-9(6H)-基)乙酸 | 1028077-12-4

• 物质功能分类: 有机原料 - 羧酸类化合物及衍生物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 咪唑并嘧啶类
• 中文名称: 2-(2-((叔丁氧基羰基)氨基)-6-氧代-1H-嘌呤-9(6H)-基)乙酸
• 英文名称: [N²-(tert-butoxycarbonyl)guanidin-9-yl]acetic acid
• 英文别名: 2-(2-((tert-butoxycarbonyl)amino)-6-oxo-1,6-dihydro-9H-purin-9-yl)acetic acid；N2-boc-guanine-9-acetic acid；guanine(Boc) acetic acid；2-(2-((tert-Butoxycarbonyl)amino)-6-oxo-1H-purin-9(6H)-yl)acetic acid；2-[2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]-6-oxo-1H-purin-9-yl]acetic acid
• CAS: 1028077-12-4
• 化学式: C₁₂H₁₅N₅O₅
• 分子量: 309.282
• InChiKey: CALJQZKJKDPZDN-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.1
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  135
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

安全信息

• 危险性防范说明：
  P261,P280,P301+P312,P302+P352,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H302,H315,H319,H335

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-(2-((叔丁氧基羰基)氨基)-6-氧代-1H-嘌呤-9(6H)-基)乙酸 、 N-[n'-Fmoc-(2'-氨基乙基)]甘氨酸 在 O-(N-succinimidyl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium tetrafluoroborate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以82%的产率得到N-[2-(fluorenylmethoxycarbonyl)aminoethyl]-N-[((N²-(tertbutoxycarbonyl)guanin-9-yl)acetyl)]glycine
  参考文献：
  名称：

  微波固相合成反义acpP肽核酸-肽共轭物，对大肠杆菌和耐替加环素的大肠杆菌和肺炎克雷伯菌具有活性

  摘要：

  有效的抗菌反义PNA-肽缀合物的最新发现促进了快速，有效的合成方案的发展，该方案促进了结构活性研究。结合微波辅助固相合成，对PNA单体和氨基酸构件使用Fmoc / Boc保护方案已被证明是反义PNA-肽共轭物连续组装的便捷方法。 将经过验证的反义PNA低聚物（CTCATACTCT；靶向acpP基因的mRNA ）与N端修饰的drosocin（即RXR-PRPYSPRPTSHPRPIRV； X =氨基己酸）或截短的Pip1肽（即RXRRXR-IKILFQNRRMKWKK； X =氨基己酸），并确定所得缀合物的抗菌作用，从而可以评估不同接头的影响以及肽L型和D型之间的差异。 不含接头部分的德罗霉素衍生化合物对野生型大肠杆菌和肺炎克雷伯菌均表现出最高的抗菌活性（MIC在2-4μg/ mL〜0.3-0.7μM范围内），而类似物则显示乙二醇（例如1）部分或极性马来酰亚胺连接基也具有对野生型肺炎克雷伯菌的活性（MIC为4-8μg/

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2019.02.024
• 作为产物：
  描述：

  ethyl 2-{2-[(tert-butoxycarbonyl)amino]-6-chloro-9H-purin-9-yl}acetate 在 sodium hydride 、 3-羟基丙腈 作用下， 以 四氢呋喃 、 mineral oil 为溶剂， 反应 48.0h， 以67%的产率得到2-(2-((叔丁氧基羰基)氨基)-6-氧代-1H-嘌呤-9(6H)-基)乙酸
  参考文献：
  名称：

  微波固相合成反义acpP肽核酸-肽共轭物，对大肠杆菌和耐替加环素的大肠杆菌和肺炎克雷伯菌具有活性

  摘要：

  有效的抗菌反义PNA-肽缀合物的最新发现促进了快速，有效的合成方案的发展，该方案促进了结构活性研究。结合微波辅助固相合成，对PNA单体和氨基酸构件使用Fmoc / Boc保护方案已被证明是反义PNA-肽共轭物连续组装的便捷方法。 将经过验证的反义PNA低聚物（CTCATACTCT；靶向acpP基因的mRNA ）与N端修饰的drosocin（即RXR-PRPYSPRPTSHPRPIRV； X =氨基己酸）或截短的Pip1肽（即RXRRXR-IKILFQNRRMKWKK； X =氨基己酸），并确定所得缀合物的抗菌作用，从而可以评估不同接头的影响以及肽L型和D型之间的差异。 不含接头部分的德罗霉素衍生化合物对野生型大肠杆菌和肺炎克雷伯菌均表现出最高的抗菌活性（MIC在2-4μg/ mL〜0.3-0.7μM范围内），而类似物则显示乙二醇（例如1）部分或极性马来酰亚胺连接基也具有对野生型肺炎克雷伯菌的活性（MIC为4-8μg/

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2019.02.024

文献信息

• Expanding the Scope and Orthogonality of PNA Synthesis
  作者：Srinivasu Pothukanuri、Zbigniew Pianowski、Nicolas Winssinger

  DOI：10.1002/ejoc.200800141

  日期：2008.6

  nucleic acids (PNAs) hybridize to natural oligonucleotides according to Watson and Crick base-pairing rules. The robustness of PNA oligomers and ease of synthesis have made them an attractive platform to encode small or macromolecules for microarraying purposes and other applications based on programmable self assembly. A cornerstone of these endeavors is the orthogonality of PNA synthesis with other chemistries

  根据 Watson 和 Crick 碱基配对规则，肽核酸 (PNA) 与天然寡核苷酸杂交。PNA 寡聚体的稳健性和易于合成使它们成为一个有吸引力的平台，用于编码小分子或大分子，用于微阵列目的和其他基于可编程自组装的应用。这些努力的基石是 PNA 合成与其他化学物质的正交性。在此，我们对末端氮原子的六种保护基团（Alloc、Teoc、4-N3Cbz、Fmoc、4-OTBSCbz 和 Azoc）和核碱基上的五种保护基团（Cl-Bhoc、F- Bhoc、Teoc、4-OMeCbz 和 Boc）。
• Clickable peptide nucleic acids (cPNA) with tunable affinity
  作者：Dalila Chouikhi、Sofia Barluenga、Nicolas Winssinger

  DOI：10.1039/c0cc01081b

  日期：——

  Peptide nucleic acids (PNAs) are functional analogues of natural oligonucleotides. Herein, we report the synthesis of PNAs bearing a triazole in lieu of the amide bond assembled using a “click” cycloaddition, their hybridization properties as well as the DNA-templated coupling of the azide and alkyne PNA fragments.

  肽核酸（PNAs）是天然寡核苷酸的功能类似物。在此，我们报道了采用“点击”环加成反应合成的含三氮唑取代酰胺键的PNAs，它们的杂交性质以及叠氮和炔基PNA片段的DNA模板偶联反应。
• Expanding the Scope of PNA-Encoded Synthesis (PES): Mtt-Protected PNA Fully Orthogonal to Fmoc Chemistry and a Broad Array of Robust Diversity-Generating Reactions
  作者：Dalila Chouikhi、Mihai Ciobanu、Claudio Zambaldo、Vincent Duplan、Sofia Barluenga、Nicolas Winssinger

  DOI：10.1002/chem.201201337

  日期：2012.10.1

  criterion in the synthesis of nucleic acid encoded libraries is the scope of reactions that can be used to introduce molecular diversity and devise divergent pathways for diversity‐oriented synthesis (DOS). To date, the protecting group strategies that have been used in peptide nucleic acid (PNA) encoded synthesis (PES) have limited the choice of reactions used in the library synthesis to just a few prototypes

  核酸编码的文库正以吸引人的高度小型化格式出现，可快速鉴定蛋白质配体。核酸编码文库合成中的一个重要标准是可用于引入分子多样性并设计面向多样性的合成（DOS）的分歧途径的反应范围。迄今为止，已经在肽核酸（PNA）编码的合成（PES）中使用的保护基策略已经将在文库合成中使用的反应的选择限制为仅几个原型。本文中，我们介绍了具有保护基组合（Mtt / Boc）的PNA单体的制备方法，该保护基与基于Fmoc的合成正交并且与在DOS中有效使用的大量反应相兼容（钯交叉偶联，复分解，还原胺化 酰胺化，杂环形成，亲核加成，共轭加成，Pictet-Spengler环化）。我们在PNA主链中整合了γ-修饰，这些修饰可增强杂交和溶解性。我们通过库合成证明了该策略的鲁棒性，该库合成的每一步都具有MALDI MS分析的特征。
• A Convenient Route to <i>N</i>-[2-(Fmoc)aminoethyl]glycine Esters and PNA Oligomerization Using a Bis-<i>N</i>-Boc Nucleobase Protecting Group Strategy
  作者：Filip Wojciechowski、Robert H. E. Hudson

  DOI：10.1021/jo800195j

  日期：2008.5.1

  A simple and practical synthesis of the benzyl, allyl, and 4-nitrobenzyl esters of N-[2-(Fmoc)aminoethyl]glycine is described starting from the known N-(2-aminoethyl)glycine. These esters are stored as stable hydrochloride salts and were used in the synthesis of peptide nucleic acid monomers possessing bis-N-Boc-protected nucleobase moieties on the exocyclic amino groups of ethyl cytosin-1-ylacetate

  描述了从已知的N-（2-氨基乙基）甘氨酸开始的N- [2-（Fmoc）氨基乙基]甘氨酸的苄基，烯丙基和4-硝基苄基酯的简单而实用的合成。这些酯以稳定的盐酸盐形式储存，用于合成在胞嘧啶-1-基乙酸乙酯，腺嘌呤-9-乙酸乙酯和乙酯的环外氨基上具有双-N -Boc保护的核碱基部分的肽核酸单体（O 6-苄基鸟嘌呤-9-基）乙酸盐。酯水解后，将相应的核碱基乙酸与N- [2-（Fmoc）氨基乙基]甘氨酸苄基酯或N- [2-（Fmoc）氨基乙基]甘氨酸烯丙基酯偶联，以保留N- [2-（Fmoc）氨基乙基]甘氨酸烯丙基酯。鸟嘌呤的O 6苄基醚保护基。Fmoc /双-N -Boc保护的单体已成功用于混合序列10-mer PNA低聚物的Fmoc介导的固相肽合成，并被证明是目前使用最广泛的Fmoc / Bhoc-保护的肽核酸单体。
• Synthesis of (<i>R</i>)- and (<i>S</i>)-Fmoc-Protected Diethylene Glycol Gamma PNA Monomers with High Optical Purity
  作者：Wei-Che Hsieh、Ashif Y. Shaikh、J. Dinithi R. Perera、Shivaji A. Thadke、Danith H. Ly

  DOI：10.1021/acs.joc.8b02714

  日期：2019.2.1

  synthetic route has been developed for preparing optically pure, Fmoc-protected diethylene glycol-containing (R)- and (S)-γPNA monomers. The strategy involves the application of 9-(4-bromophenyl)-9-fluorenyl as a temporary, safety-catch protecting group for the suppression of epimerization in the O-alkylation and reductive amination steps. The optical purities of the final monomers were determined to be

  已经开发了用于制备光学纯的，受Fmoc保护的含二甘醇的（R）-和（S）-γPNA单体的稳健合成路线。该策略涉及应用9-（4-溴苯基）-9-芴基作为临时的，安全的保护基团，用于抑制O-烷基化和还原性胺化步骤中的差向异构化。通过19 F-NMR和HPLC评估，最终单体的光学纯度确定为大于99.5％ee 。新的合成方法非常适合大规模单体生产，大多数合成步骤可提供优异的化学收率，而无需进行简单的后处理和沉淀，而无需进行色谱纯化。