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neomycin B/C | 66-86-4

中文名称
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中文别名
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英文名称
neomycin B/C
英文别名
neomycin;(2R,3S,4R,5R,6R)-5-amino-2-(aminomethyl)-6-[(1R,2R,3S,4R,6S)-4,6-diamino-2-[(2S,3R,4S,5R)-4-[(2R,3R,4R,5S)-3-amino-6-(aminomethyl)-4,5-dihydroxyoxan-2-yl]oxy-3-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]oxy-3-hydroxycyclohexyl]oxyoxane-3,4-diol
neomycin B/C化学式
CAS
66-86-4;119-04-0;58617-08-6
化学式
C23H46N6O13
mdl
——
分子量
614.651
InChiKey
PGBHMTALBVVCIT-UFTIIHCESA-N
BEILSTEIN
——
EINECS
——
  • 物化性质
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  • 相关功能分类
  • 相关结构分类

物化性质

  • 熔点:
    >194°C (dec.)
  • 沸点:
    658.4°C (rough estimate)
  • 密度:
    1.3548 (rough estimate)
  • 溶解度:
    可溶于酸性水溶液(轻微)、水(轻微)

计算性质

  • 辛醇/水分配系数(LogP):
    -9
  • 重原子数:
    42
  • 可旋转键数:
    9
  • 环数:
    4.0
  • sp3杂化的碳原子比例:
    1.0
  • 拓扑面积:
    353
  • 氢给体数:
    13
  • 氢受体数:
    19

SDS

SDS:815d1bba42abc4f2406701738774f48f
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制备方法与用途

生物活性

Framycetin(Neomycin B)是一种氨基糖苷类抗生素,是有效的 RNase P 裂解活性抑制剂,Ki 值为 35 μM。它竞争性地结合 RNase P RNA 中特定的二价金属离子结合位点。同时,Framycetin 还能抑制锤头状核酶(hammerhead ribozyme),其 Ki 值为 13.5 μM。此外,5″-azido neomycin B 是 Framycetin 的前体,可与 miR-525 中的 Drosha 位点结合,用于治疗肝性脑病和肠致病性大肠杆菌感染。

靶点

Ki: 35 μM (RNase P 裂解活性) 和 13.5 μM (锤头状核酶)

体外研究

Framycetin(Neomycin B;Fradiomycin B)对 RNase P RNA 切割的抑制作用受 pH 影响,pH 增高可减弱其抑制效应。该化合物不仅靶向细菌和人类核糖体,还影响翻译过程。5″-azido neomycin B 和 Framycetin 选择性地抑制成熟 miRNA 的产生,并通过上调下游蛋白表达及在 HCC 细胞系中抑制入侵作用来发挥作用。

Framycetin 结合 RNA 的结构而非序列 motif,其主要靶点是核糖体的解码位点(16S rRNA 1400 至 1500 区域)。此外,它还与 HIV-1 的 Rev 反应元件、组 I 内含子和锤头状核酶结合,从而抑制这些分子的功能。Framycetin 在翻译过程中诱导遗传密码的错误解读,并抑制多种核酶的作用。