methyl 4,6-O-benzylidene-2-N-phthalimido-β-D-mannopyranoside | 81927-56-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 异吲哚及其衍生物
• 英文名称: methyl 4,6-O-benzylidene-2-N-phthalimido-β-D-mannopyranoside
• 英文别名: methyl 4,6-O-benzylidene-2-deoxy-2-phthalimido-β-D-glucopyranoside；methyl 4,6-O-benzylidene-2-deoxy-2-phthalimide-β-D-glucopyranoside；2-[(2R,4aR,6R,7R,8R,8aS)-8-hydroxy-6-methoxy-2-phenyl-4,4a,6,7,8,8a-hexahydropyrano[3,2-d][1,3]dioxin-7-yl]isoindole-1,3-dione
• CAS: 81927-56-2
• 化学式: C₂₂H₂₁NO₇
• 分子量: 411.411
• InChiKey: LDLANDFJIIDMRD-GARQETNWSA-N

物化性质

• 沸点：
  614.4±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.45±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.2
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  94.5
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl 4,6-O-benzylidene-2-N-phthalimido-β-D-mannopyranoside 在 盐酸 、 molecular sieve 、 sodium hydride 、 sodium cyanoborohydride 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙二醇二甲醚 、 乙醚 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 甲基 3,6-二-O-苄基-2-脱氧-2-(1,3-二氧代-1,3-二氢-2H-异吲哚-2-基)吡喃己糖苷
  参考文献：
  名称：

  具有生物学意义的模型寡糖的合成。4. 岩藻糖基化 N,N'-二乙酰壳二糖苷及相关寡糖的合成

  摘要：

  合成了两种三糖和一种含有 L-岩藻糖和 2-乙酰氨基-2-脱氧-D-葡萄糖的二糖。甲基 3,6-di-O-benzyl-2-deoxy-2-phthalimido-β-D-glucopyranoside 用 3,4,6-tri-O-acetyl-2-deoxy-2-phthalimido-β- 糖基化D-吡喃葡萄糖基溴。通过肼解作用去除邻苯二甲酰亚胺保护基团，然后进行 N-乙酰化和脱苄基作用，得到 N,N'-二乙酰壳二糖苷 3',4',6'-三乙酸甲酯。后者在 6 位用 2,3,4-三-O-苄基-α-L-吡喃岩藻糖基溴选择性岩藻糖基化，在脱苄基和脱-O-乙酰化后，得到甲基2-乙酰氨基-4-O- (2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl)-2-deoxy-6-O-(α-L-fucopyranosyl)-β-D-glucopyranoside。当甲基 3-

  DOI：

  10.1139/v85-182
• 作为产物：
  描述：

  2-脱氧-2-苯二酰亚胺-1,3,4,6-四-氧-乙酰-β-D-吡喃葡萄糖 在 对甲苯磺酸 N-碘代丁二酰亚胺 、 三氟甲磺酸 、 三氟化硼乙醚 、 potassium tert-butylate 作用下， 以 甲醇 、 乙醚 、 1,2-二氯乙烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 2.08h， 生成 methyl 4,6-O-benzylidene-2-N-phthalimido-β-D-mannopyranoside
  参考文献：
  名称：

  Zuurmond, H. M.; Klein, P. A. M. van der; Wildt, J. de, Journal of Carbohydrate Chemistry, 1994, vol. 13, # 2, p. 323 - 340

  摘要：

  DOI：

文献信息

• Synthesis of Diverse<i>N</i>-Substituted Muramyl Dipeptide Derivatives and Their Use in a Study of Human NOD2 Stimulation Activity
  作者：Kuo-Ting Chen、Duen-Yi Huang、Cheng-Hsin Chiu、Wan-Wan Lin、Pi-Hui Liang、Wei-Chieh Cheng

  DOI：10.1002/chem.201501557

  日期：2015.8.17

  preparation of diverse N‐substituted muramyl dipeptides (N‐substituted MDPs) from different protected monosaccharides is described. The synthetic MDPs include N‐acetyl MDP and N‐glycolyl MDP, known NOD2 ligands, and this methodology allows for structural variation at six positions, including the muramic acid, peptide, and N‐substituted moieties. The capacity of these molecules to activate human NOD2 in the

  描述了一种灵活的合成策略，该策略可从不同的受保护单糖制备各种N-取代的戊二酰二肽（N-取代的MDP）。合成的MDP包括已知的NOD2配体N-乙酰基MDP和N-甘氨酰基MDP，这种方法允许在六个位置上进行结构变异，包括山mic酸，肽和N-取代的部分。还研究了这些分子在先天免疫应答中激活人NOD2的能力。结果发现，在N-甘氨酰MDP的C 1位置添加甲基显着增强了NOD2的刺激活性。
• Selectively Deoxyfluorinated <i>N</i> ‐Acetyllactosamine Analogues as ¹⁹ F NMR Probes to Study Carbohydrate‐Galectin Interactions
  作者：Martin Kurfiřt、Martin Dračínský、Lucie Červenková Šťastná、Petra Cuřínová、Vojtěch Hamala、Michaela Hovorková、Pavla Bojarová、Jindřich Karban

  DOI：10.1002/chem.202101752

  日期：2021.9.9

  synthesized a complete series of six mono-deoxyfluorinated analogues of LacNAc, in which each hydroxyl has been selectively replaced by fluorine while the anomeric position has been protected as methyl β-glycoside. Initial evaluation of their binding to human galectin-1 and -3 by ELISA and 19F NMR T2-filter revealed that deoxyfluorination at C3, C4′ and C6′ completely abolished binding to galectin-1 but

  半乳糖凝集素是广泛表达的半乳糖结合凝集素，例如在免疫调节、转移扩散和病原体识别中暗示。N-乙酰乳糖胺（Galβ1-4GlcNAc、LacNAc）及其寡聚或糖基化形式是半乳糖凝集素的天然配体。为了探测半乳糖凝集素的底物特异性和结合模式，我们合成了完整系列的六种 LacNAc 单脱氧氟化类似物，其中每个羟基都被氟选择性取代，而异头位置被保护为甲基β-糖苷。通过 ELISA 和19 F NMR T 2初步评估它们与人半乳糖凝集素-1 和 -3 的结合-filter 显示 C3、C4' 和 C6' 处的脱氧氟化完全消除了与 galectin-1 的结合，但仍可检测到与 galectin-3 的非常弱的结合。此外，C2' 的脱氧氟化导致对 galectin-1 的结合亲和力增加了大约 8 倍，而与 galectin-3 的结合基本上不受影响。亲脂性测量表明，与 GlcNAc 部分的脱氧氟化作用相比，Gal
• The design, synthesis and evaluation of high affinity macrocyclic carbohydrate inhibitors
  作者：Robert S. McGavin、Rod A. Gagne、Mary C. Chervenak、David R. Bundle

  DOI：10.1039/b416105j

  日期：——

  Carbohydrate–protein interactions have been investigated for a model system of a monoclonal antibody, SYA/J6, which binds a trisaccharide epitope of the O-polysaccharide of the Shigella flexneri variant Y lipopolysaccharide. The thermodynamics of binding for the methyl glycoside of the native trisaccharide epitope, Rha-Rha-GlcNAc (1) to SYA/J6 over a range of temperatures exhibits strong, linear enthalpy–entropy compensation and a negative heat capacity change (ΔCp = −152 cal mol−1 degree−1). At 293 K the free energy of association is the sum of favourable enthalpy and entropy contributions (ΔH = −3.9 kcal mol−1 and −TΔS = −2.9 kcal mol−1). Crystal structures for SYA/J6 Fab detailed the position of the native trisaccharide epitope, Rha-Rha-GlcNAc (1), and facilitated a strategy to design a tighter binding, low molecular weight ligand. This involved pre-organization of the native trisaccharide 1 in its bound conformation by addition of intramolecular constraints (a β-alanyl or glycinyl tether). ELISA measurements indicated that the glycinyl tethered trisaccharide 2 was not an optimal candidate for further analysis, while microcalorimetry provided data showing that the β-alanyl tethered trisaccharide 3 displayed a 15-fold increase in affinity for SYA/J6. Tethering of 3 resulted in a favourable entropic contribution to binding, relative to the native trisaccharide 1 (−TΔΔS = −1.2 kcal mol−1). Potential energy and dynamics calculations using the AMBER Plus force fields indicated that trisaccharide 3 adopted a rigid conformation similar to that of the bound conformation of the native trisaccharide epitope. While this strategy resulted in modest free energy gains by minimizing losses due to conformational entropy, thermodynamic data are consistent with significant contributions from solvent reorganization.

  碳水化合物-蛋白质相互作用已针对一种单克隆抗体模型系统 SYA/J6 进行了研究，该抗体结合了志贺氏杆菌柔性 Y 型脂多糖 O-多糖的三糖表位。天然三糖表位的甲基糖苷（Rha-Rha-GlcNAc，1）与 SYA/J6 在不同温度下的结合热力学表现为强烈的线性焓-熵补偿和负热容变化（ΔCp = -152 卡/摩尔/度）。在 293 K 时，结合自由能是焓和熵的有利贡献之和（ΔH = -3.9 千卡/摩尔，-TΔS = -2.9 千卡/摩尔）。SYA/J6 Fab 的晶体结构详细描述了天然三糖表位 Rha-Rha-GlcNAc（1）的位置，并促成了一种策略，即设计一种更紧密结合的低分子量配体。这一策略包括通过添加内分子约束（β-丙氨酸或甘氨酸接头）使天然三糖 1 在其结合构象中预排列。ELISA 测量表明，甘氨酸接头的三糖 2 不是进一步分析的理想候选物，而微量热法数据显示，β-丙氨酸接头的三糖 3 对 SYA/J6 的亲和力提高了 15 倍。与天然三糖 1 相比，3 的接头导致了对结合有利的熵贡献（-TΔΔS = -1.2 千卡/摩尔）。使用 AMBER Plus 力场进行的势能和动力学计算表明，三糖 3 采取了类似于天然三糖表位结合构象的刚性构象。尽管这种策略通过最小化构象熵损失实现了适度的自由能增益，但热力学数据与溶剂重组的大量贡献是一致的。
• Synthesis and conformational studies of the tyvelose capped, Lewis-x like tetrasaccharide epitope of Trichinella spiralis
  作者：Jian Zhang、Albin Otter、David R. Bundle

  DOI：10.1016/s0968-0896(96)00182-4

  日期：1996.11

  halide-ion glycosylation methods. The unique 3,6-dideoxy-beta-D-arabinohexopyranosyl residue that caps the structure was introduced to selectively protected 2-(trimethylsilyl)ethyl and methyl trisaccharide glycosides by utilizing an insoluble silver zeolite catalyst and a glycosyl halide. In separate reactions not only were the principal targets obtained but also the corresponding alpha-linked tetrasaccharides

  化学合成和高分辨率NMR研究报道了四糖表位和旋毛虫细胞表面聚糖末端元素的结构。使用硫代糖苷和卤化物离子糖基化方法，由单糖合成子合成了Lewis Gal-c型β-糖苷酸替代β-Gal糖的Lewis-x型三糖的2-（三甲基甲硅烷基）乙基和甲基糖苷。通过利用不溶性银沸石催化剂和糖基卤化物，引入了独特的3,6-二脱氧-β-D-阿拉伯环己基吡喃糖基残基，以选择性保护2-（三甲基甲硅烷基）乙基和甲基三糖苷。在单独的反应中，不仅获得了主要靶标，而且获得了相应的α-连接的四糖。甲基四糖苷的NMR光谱比较表明，在α-连接的酪糖结构的位点处，特定的GalNAc共振（C-1，C-2，C-3）具有异常宽的13C（8-21 Hz）和1H线。代表天然寄生虫表位的β-连接的四糖苷仅表现出较窄的线宽（3 Hz，13C）。由于NOE得出的对α-连接的酪氨酸结构的距离限制与不寻常的糖苷构象异构体的存在不一致，因此，有限数目的
• Low-Barrier Pathway for<i>endo</i>-Cleavage Induced Anomerization of Pyranosides with<i>N</i>-Benzyl-2,3-<i>trans</i>-oxazolidinone Groups
  作者：Hiroko Satoh、Jürg Hutter、Hans Peter Lüthi、Shino Manabe、Kazuyuki Ishii、Yukishige Ito

  DOI：10.1002/ejoc.200801140

  日期：2009.3

  anomerization from the β form to the α form even in the presence of a weak Lewis acid. Experimental evidence for endo-cleavage, the breaking of the bond between the pyran-oxygen and anomeric carbon atoms, in the anomerization reactions was obtained. This unexpected phenomenon was investigated by quantum mechanical calculations, which found clear differences in the transition states between anomerized and non-anomerized

  即使在弱路易斯酸存在下，具有 N-苄基-2,3-反式-恶唑烷酮的吡喃糖苷也会发生从 β 型到 α 型的异构化。获得了在异构化反应中内裂，即吡喃-氧和异头碳原子之间的键断裂的实验证据。通过量子力学计算研究了这种意外现象，该计算发现异构化和非异构化底物之间的过渡态存在明显差异。计算表明，BF3 诱导内切，然后旋转 C1-C2 键，通过较低能量的过渡态产生 α 形式。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2009)