O⁶-Allyl-3',5'-O-bis(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxyguanosine | 150903-99-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: O⁶-Allyl-3',5'-O-bis(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxyguanosine
• 英文别名: O⁶-allyl-3',5'-bis(O-tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxyguanosine；O⁶-allyl-3',5'-di-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxyguanosine；O⁶-Allyl-3',5'-bis(tert-butyldimethylsilyl)-2'-desoxyguanosin；O⁶-allyl-3',5'-bis(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxyguanosine；O⁶-allyl-3',5'-di-tert-butyldimethylsilyl-2-deoxyguanosine；O(6)-allyl-3',5'-di-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxyguanosine；o6-Allyl-3',5'-di-o-(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxyguanosine；9-[(2R,4S,5R)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]-6-prop-2-enoxypurin-2-amine
• CAS: 150903-99-4
• 化学式: C₂₅H₄₅N₅O₄Si₂
• 分子量: 535.834
• InChiKey: ABULJBNRUOXCAT-IPMKNSEASA-N

物化性质

• 沸点：
  597.4±60.0 °C(predicted)
• 密度：
  1.12±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.67
• 重原子数：
  36
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.72
• 拓扑面积：
  107
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  O⁶-Allyl-3',5'-O-bis(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxyguanosine 在 亚硝酸正戊酯 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 5.0h， 生成 Trifluoro-methanesulfonic acid 6-allyloxy-9-[(2R,4S,5R)-4-(tert-butyl-dimethyl-silanyloxy)-5-(tert-butyl-dimethyl-silanyloxymethyl)-tetrahydro-furan-2-yl]-9H-purin-2-yl ester
  参考文献：
  名称：

  Steinbrecher, Thomas; Wameling, Christa; Oesch, Franz, Angewandte Chemie, 1993, vol. 105, # 3, p. 408 - 410

  摘要：

  DOI：
• 作为产物：
  描述：

  3',5'-bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxyguanosine 在 caesium carbonate 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 8.0h， 生成 O⁶-Allyl-3',5'-O-bis(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxyguanosine
  参考文献：
  名称：

  一种简单的鸟嘌呤核苷 C-6 修饰方法†

  摘要：

  在 C-6 位置引入各种取代基的简便方法 鸟苷 和 2'-脱氧鸟苷被报道。在简单的 1 步转化中，叔丁基二甲基甲硅烷基保护的鸟苷和2'-脱氧鸟苷通过与 1 H-苯并三唑-1-基氧基-三（二甲氨基）鏻六氟磷酸盐 (BOP)反应转化为O 6 -(苯并三唑-1-基) 衍生物和1,8-二氮杂双环[5.4.0]undec-7ene(DBU)。容易分离、稳定和可储存的O 6 -(苯并三唑-1-基)鸟苷衍生物在适当条件下暴露于一系列亲核试剂后，以良好的产率得到 C-6 修饰的 2-氨基嘌呤核苷类似物。

  DOI：

  10.1039/b905298d

文献信息

• Synthesis and Reactions of 2-Chloro- and 2-Tosyloxy-2‘-deoxyinosine Derivatives
  作者：Narender Pottabathini、Suyeal Bae、Padmanava Pradhan、Hoh-Gyu Hahn、Heduck Mah、Mahesh K. Lakshman

  DOI：10.1021/jo050847j

  日期：2005.9.1

  commercially available 2‘-deoxyguanosine. The present method leading to the chloro nucleoside is operationally simpler compared to previously reported glycosylation techniques where isomeric products were obtained. Both electrophilic nucleosides can be used for the preparation of N-substituted 2‘-deoxyguanosine analogues via displacement of the leaving groups, and a comparison of their reactivities shows the chloro

  2-氯和2-甲苯磺酰氧基-2'-脱氧肌苷作为他们的方便合成叔描述了丁基丁基二甲基甲硅烷基醚。两种化合物均可通过常规途径合成，并依赖于可商购的2'-脱氧鸟苷。与先前报道的获得异构体产物的糖基化技术相比，导致氯代核苷的本发明方法在操作上更简单。两种亲核核苷均可用于通过离去基团的置换来制备N-取代的2'-脱氧鸟苷类似物，其反应性的比较表明，氯类似物具有优越性。有趣的是，Pd催化剂介导的两步一锅法将烯丙基保护的氯核苷中间体转化为最终的修饰2'-脱氧鸟苷衍生物也是可行的。根据这些观察，对Pd催化的芳基胺化反应以及C-C交叉偶联的初步评估也已经用氯代和对甲苯氧基核苷底物进行了。结果表明2-氯-2'-脱氧肌苷的潜在高合成效用，并且在许多情况下，该衍生物可以取代制备起来较麻烦或不易获得的溴和氟类似物。
• Synthesis and Biological Properties of C-2 Triazolylinosine Derivatives
  作者：Mahesh K. Lakshman、Amit Kumar、Raghavan Balachandran、Billy W. Day、Graciela Andrei、Robert Snoeck、Jan Balzarini

  DOI：10.1021/jo300628y

  日期：2012.7.20

  with t-BuONO and TMS-N3 yield the C-2 azido derivatives. We have previously analyzed the solvent-dependent azide·tetrazole equilibrium of C-6 azidopurine nucleosides, and in contrast to these, the O6-allyl C-2 azido nucleosides appear to exist predominantly in the azido form, relatively independent of solvent polarity. In the presently described cases, the tetrazole appears to be very minor. Consistent

  O 6 -(苯并三唑-1 H -基)鸟苷及其2'-脱氧类似物很容易转化为O 6 -烯丙基衍生物，在与t -BuONO和TMS-N 3重氮化后产生C-2叠氮衍生物。我们之前已经分析了 C-6 叠氮嘌呤核苷的溶剂依赖性叠氮·四唑平衡，与此相反，O 6 -烯丙基 C-2 叠氮核苷似乎主要以叠氮形式存在，相对独立于溶剂极性。在目前描述的情况下，四唑似乎非常少。与叠氮官能团的存在一致，每个纯 C-2 叠氮化物在 2126-2130 cm -1处显示出突出的红外波段. 叠氮核苷与炔烃连接的条件筛选表明，在t- BuOH/H 2 O中的 CuCl是最佳的，C-2 1,2,3-三唑基核苷的产率为 70-82%。用 Et 3 N·3HF去除甲硅烷基，然后用 PhSO 2 Na/Pd(PPh 3 ) 4 去烯丙基化，得到 C-2 三唑基肌苷核苷。在继续证明O 6 -(benzotriazol-1 H-yl)嘌呤核苷，一种
• Novel Stereoselective Control over Cis vs Trans Opening of Benzo[<i>c</i>]phenanthrene 3,4-Diol 1,2-Epoxides by the Exocyclic <i>N</i>²-Amino Group of Deoxyguanosine in the Presence of Hexafluoropropan-2-ol
  作者：Haruhiko Yagi、Andagar R. Ramesha、Govind Kalena、Jane M. Sayer、Subodh Kumar、Donald M. Jerina

  DOI：10.1021/jo020418a

  日期：2002.9.1

  We describe a novel and efficient synthesis (62-84% yields) of the eight possible, diastereomerically pure, cis and trans, R and S O(6)-allyl-protected N(2)-dGuo phosphoramidite building blocks derived through cis and trans opening of (+/-)-3alpha,4beta-dihydroxy-1beta,2beta-epoxy-1,2,3,4-tetrahydrobenzo[c]phenanthrene [BcPh DE-1 (1)] and (+/-)-3alpha,4beta-dihydroxy-1alpha,2alpha-epoxy-1,2,3,4-te

  我们描述了八种可能的，非对映体纯，顺式和反式，R和SO（6）-烯丙基保护的N（2）-dGuo亚磷酰胺结构单元，通过顺式和反式衍生的新型有效合成方法（62-84％产率） （+/-）-3alpha，4beta-dihydroxy-1beta，2beta-epoxy-1,2,3,4-四氢苯并[c]菲[BcPh DE-1（1）]和（+/-）-3alpha的打开六氟丙烷-2-醇（HFP）介导的O（6）合成1,4beta-二羟基-1alpha，2alpha-环氧-1,2,3,4-四氢苯并[c]菲[BcPh DE-2（2）] -在环氧化合物的C-1处的-烯丙基-3′，5′-二-O-（叔丁基二甲基甲硅烷基）-2′-脱氧鸟苷（3）。只需改变反应混合物中HFP的相对用量，即可实现宽比例的顺式/反式加成产物。从而，在5当量3的存在下，DE-1（1）在HFP的5-532当量范围内观察到的顺式/反式加合物比率从17
• Novel trifluoroethanol mediated synthesis of benzo[ a ]pyrene 7,8-diol 9,10-epoxide adducts at the N 2 -position of deoxyguanosine and the N 6 -position of deoxyadenosine
  作者：Andagar R Ramesha、Heiko Kroth、Donald M Jerina

  DOI：10.1016/s0040-4039(00)02220-6

  日期：2001.2

  The exocyclic amino groups of deoxyadenosine and deoxyguanosine readily add to C-10 of the benzo[a]pyrene 7,8-diol 9,10-epoxides at room temperature overnight in trifluoroethanol. Whereas the dG adducts are obtained as a mixture of cis- and trans-opened diastereomers, the dA adducts arise exclusively by cis-opening.

  脱氧腺苷和脱氧鸟苷的环外氨基容易在室温下于三氟乙醇中过夜添加至苯并[ a ] py7,8-二醇9,10-环氧化物的C-10中。dG加合物是以顺式和反式非对映异构体的混合物形式获得的，而dA加合物仅通过顺式打开而产生。
• Fluorinated Alcohol Mediated Control over Cis vs Trans Opening of Benzo[<i>a</i>]pyrene-7,8-diol 9,10-Epoxides at C-10 by the Exocyclic Amino Groups of <i>O</i>⁶-Allyl Protected Deoxyguanosine and of Deoxyadenosine
  作者：Haruhiko Yagi、Donald M. Jerina

  DOI：10.1021/jo070303c

  日期：2007.8.1

  stereoselectively to afford only cis adducts for both DEs. A highly efficient HPLC separation of dGuo adduct diastereomers derived from DE-2 (2) was developed using acetone as a modifier in CH2Cl2 or in n-hexane. Through the use of varying molar ratios of the different fluorinated alcohols described above and the newly developed HPLC separation method, the four possible phosphoramidites (cis/trans, R/S) of the B[a]P

  对（±）-7β，8α-二羟基-9β，10β-环氧-7,8,9,10-四氢苯并[ a ] py B [ a ] P DE-1（1）}和（±）-7β，8α-二羟基-9α，10α-环氧-7,8,9,10-四氢苯并[ a ] py B [ a ] P DE-2（2）}在C-10处是氟化醇三氟乙醇（TFE），六氟丙烷-2-醇（HFP）和全氟叔丁醇（PFTB）中受保护的嘌呤核苷的环外氨基。O 6-烯丙基-3'，5'-二-O-（叔丁基二甲基甲硅烷基）-2'-脱氧鸟苷的2-氨基的加成（3）和3′，5′-二-O-（叔丁基二甲基甲硅烷基）-2′-脱氧腺苷（4）的6-氨基在环氧化物的C-10处出现。在5当量3的存在下，在10-250当量氟化醇的范围内，DE-1（1）的反应中观察到的顺式：反式比率从53:47到87:13（对于TFE为60:40）变化HFP为92：8，PFTB为52:48至73:27。在相同的