(E)-methyl 3-(4-methoxy-3-(4,4,5,5-tetramethyl-1,3,2-dioxaborolan-2-yl)phenyl)acrylate | 888738-42-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯丙烷和聚酮 - 肉桂酸及其衍生物
• 英文名称: (E)-methyl 3-(4-methoxy-3-(4,4,5,5-tetramethyl-1,3,2-dioxaborolan-2-yl)phenyl)acrylate
• 英文别名: 3-[4-methoxy-3-(4,4,5,5-tetramethyl-[1,3,2]dioxaborolan-2-yl)-phenyl]-acrylic acid methyl ester；methyl (E)-3-[4-methoxy-3-(4,4,5,5-tetramethyl-1,3,2-dioxaborolan-2-yl)phenyl]prop-2-enoate
• CAS: 888738-42-9
• 化学式: C₁₇H₂₃BO₅
• 分子量: 318.178
• InChiKey: PBOJLYCIBAQIEL-CSKARUKUSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.18
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.47
• 拓扑面积：
  54
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (E)-methyl 3-(4-methoxy-3-(4,4,5,5-tetramethyl-1,3,2-dioxaborolan-2-yl)phenyl)acrylate 在 2-双环己基膦-2',6'-二甲氧基联苯 、 potassium fluoride 、 tris-(dibenzylideneacetone)dipalladium(0) 、 三溴化硼 、 sodium hydroxide 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， -78.0~110.0 ℃ 、101.33 kPa 条件下， 反应 22.08h， 生成 (E)-3-(3'-allyl-4',6-dihydroxy-[1,1'-biphenyl]-3-yl)acrylic acid
  参考文献：
  名称：

  用于动态蛋白质界面的天然产物开关

  摘要：

  小配体是通过动态结合界面控制蛋白质复合物功能的有效方法。在基因转录中发现了经典的例子，其中小配体通过动态激活功能2（AF2）界面调节核受体与共激活蛋白的结合。当前的配体靶向AF2的配体结合口袋侧。很少有配体可以选择性地靶向AF2的共激活子侧，或者可以选择性地从界面的一侧切换到另一侧。我们使用NMR光谱学和建模来识别天然产物，该天然产物靶向AF2两侧的类维生素A X受体（RXR）。然后，我们使用化学合成，细胞筛选和X射线共晶体技术来拆分这种双重活性，从而产生有效且分子效率高的RXR激动剂，以及对RXR /共激活剂相互作用具有选择性的首个抑制剂。我们的发现证明了未来在动态蛋白质界面上探索天然产物的合理性。

  DOI：

  10.1002/anie.201403773
• 作为产物：
  描述：

  4-溴-2-氯苯酚 在 1,1'-双(二苯膦基)二茂铁二氯化钯(II)二氯甲烷复合物 、 potassium acetate 、 palladium diacetate 、 potassium carbonate 、 三乙胺 、 2-二环己基磷-2,4,6-三异丙基联苯 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 43.17h， 生成 (E)-methyl 3-(4-methoxy-3-(4,4,5,5-tetramethyl-1,3,2-dioxaborolan-2-yl)phenyl)acrylate
  参考文献：
  名称：

  用于动态蛋白质界面的天然产物开关

  摘要：

  小配体是通过动态结合界面控制蛋白质复合物功能的有效方法。在基因转录中发现了经典的例子，其中小配体通过动态激活功能2（AF2）界面调节核受体与共激活蛋白的结合。当前的配体靶向AF2的配体结合口袋侧。很少有配体可以选择性地靶向AF2的共激活子侧，或者可以选择性地从界面的一侧切换到另一侧。我们使用NMR光谱学和建模来识别天然产物，该天然产物靶向AF2两侧的类维生素A X受体（RXR）。然后，我们使用化学合成，细胞筛选和X射线共晶体技术来拆分这种双重活性，从而产生有效且分子效率高的RXR激动剂，以及对RXR /共激活剂相互作用具有选择性的首个抑制剂。我们的发现证明了未来在动态蛋白质界面上探索天然产物的合理性。

  DOI：

  10.1002/anie.201403773

文献信息

• WO2006/56854
  申请人：——

  公开号：——

  公开（公告）日：——
• Ligand Dependent Switch from RXR Homo- to RXR-NURR1 Heterodimerization
  作者：Marcel Scheepstra、Sebastian A. Andrei、Rens M. J. M. de Vries、Femke A. Meijer、Jian-Nong Ma、Ethan S. Burstein、Roger Olsson、Christian Ottmann、Lech-Gustav Milroy、Luc Brunsveld

  DOI：10.1021/acschemneuro.7b00216

  日期：2017.9.20

  Retinoid X receptors (RXRs) play key roles in many physiological processes in both the periphery and central nervous system. In addition, RXRs form heterodimers with other nuclear receptors to exert their physiological effects. The nuclear receptor related 1 protein (NURR1) is particularly interesting because of its role in promoting differentiation and survival of dopamine neurons. However, only a small number of RXR-heterodimer selective modulators are available, with limited chemical diversity. This work describes the synthesis, biochemical evaluation, and structural elucidation of a novel series of RXR ligands with strongly biased interactions with RXRa-NURRI heterodimers. Targeted modifications to the small molecule biaryl scaffold caused local RXRa side -chain disturbances and displacement of secondary structural elements upon ligand binding. This resulted in the repositioning of protein helices in the heterodimer interface of RXRa, alterations in homo- versus heterodimer formation, and modulation of activation function 2 (AF2). The data provide a rationale for the design of RXR ligands consisting of a highly conserved hydrophilic region, strongly contributing to the ligand affinity, and a variable hydrophobic region, which efficiently probes the effects of structural changes at the level of the ligand on co -regulator recruitment or the RXRa-NURRI dimerization interface.
• A Natural‐Product Switch for a Dynamic Protein Interface
  作者：Marcel Scheepstra、Lidia Nieto、Anna K. H. Hirsch、Sascha Fuchs、Seppe Leysen、Chan Vinh Lam、Leslie in het Panhuis、Constant A. A. van Boeckel、Hans Wienk、Rolf Boelens、Christian Ottmann、Lech‐Gustav Milroy、Luc Brunsveld

  DOI：10.1002/anie.201403773

  日期：2014.6.16

  Small ligands are a powerful way to control the function of protein complexes via dynamic binding interfaces. The classic example is found in gene transcription where small ligands regulate nuclear receptor binding to coactivator proteins via the dynamic activation function 2 (AF2) interface. Current ligands target the ligand‐binding pocket side of the AF2. Few ligands are known, which selectively

  小配体是通过动态结合界面控制蛋白质复合物功能的有效方法。在基因转录中发现了经典的例子，其中小配体通过动态激活功能2（AF2）界面调节核受体与共激活蛋白的结合。当前的配体靶向AF2的配体结合口袋侧。很少有配体可以选择性地靶向AF2的共激活子侧，或者可以选择性地从界面的一侧切换到另一侧。我们使用NMR光谱学和建模来识别天然产物，该天然产物靶向AF2两侧的类维生素A X受体（RXR）。然后，我们使用化学合成，细胞筛选和X射线共晶体技术来拆分这种双重活性，从而产生有效且分子效率高的RXR激动剂，以及对RXR /共激活剂相互作用具有选择性的首个抑制剂。我们的发现证明了未来在动态蛋白质界面上探索天然产物的合理性。